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10年做出這項(xiàng)原始創(chuàng)新成果!無(wú)小刺魚誕生全揭秘
吃魚被魚刺卡喉,是眾多食客的切膚之痛。但太不巧的是,我國(guó)的主養(yǎng)魚類如青草鰱鳙鯉鯽魴,都存在一定數(shù)量的肌間刺——即遍布于魚背、魚尾等處惱人的“小刺”。

這些魚能不能不長(zhǎng)小刺?這在以前,是天方夜譚;但現(xiàn)在,這個(gè)“無(wú)理要求”有望成為現(xiàn)實(shí)。

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院教授高澤霞,現(xiàn)在是名副其實(shí)的魚類肌間刺研究專家。今年,她領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了決定魚類肌間刺形成的關(guān)鍵基因,并先后利用基因編輯手段,獲得了無(wú)小刺的斑馬魚(模式魚類)和武昌魚(主養(yǎng)經(jīng)濟(jì)魚類,學(xué)名團(tuán)頭魴)。未來(lái),該技術(shù)突破還有望成功應(yīng)用到鯽魚、鯉魚乃至青、草、鰱、鳙等重要經(jīng)濟(jì)魚類。

這項(xiàng)創(chuàng)新性成果的背后,是高澤霞團(tuán)隊(duì)歷時(shí)十年之久的苦苦求索。更值得稱道的是,自開展無(wú)小刺魚研究以來(lái),團(tuán)隊(duì)從2012年到2021年間僅拿到4項(xiàng)共計(jì)170萬(wàn)元的經(jīng)費(fèi)支持,加上2021年剛獲批的一個(gè)250萬(wàn)元的項(xiàng)目,前后也僅有420萬(wàn)元經(jīng)費(fèi)支撐。

靠有限的經(jīng)費(fèi)資助,高澤霞團(tuán)隊(duì)是怎樣一步步做出這項(xiàng)原始創(chuàng)新成果的?一切要從十年前的“無(wú)心插柳”說(shuō)起。

有肌間刺武昌魚

無(wú)肌間刺武昌魚

這根“刺”,如鯁在喉


2010年6月,高澤霞從華中農(nóng)業(yè)大學(xué)畢業(yè),獲得農(nóng)學(xué)博士學(xué)位。那時(shí),她所在的團(tuán)隊(duì)主要關(guān)注武昌魚的生長(zhǎng)、抗病和耐低氧性狀。但逐漸地,“讓武昌魚長(zhǎng)快一點(diǎn)、長(zhǎng)大一點(diǎn)”“抗病能力和耐低氧能力強(qiáng)一點(diǎn)”這些研究,讓高澤霞覺得有點(diǎn)“不過(guò)癮”。

“長(zhǎng)得快、抗病、耐低氧的問(wèn)題解決之后,武昌魚的價(jià)格還是抬不上來(lái)。為啥?魚刺多,讓很多消費(fèi)者望而卻步。”她對(duì)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》說(shuō),卡喉之痛讓人不勝其煩,肌間刺的存在嚴(yán)重影響了魚類的食用和加工價(jià)值。

肌間刺這根“刺”,讓高澤霞如鯁在喉。

肌間刺的三維立體結(jié)構(gòu)

她開始查文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)之前也有學(xué)者關(guān)注過(guò)這個(gè)問(wèn)題,但只是零星的探討,并沒有深入的研究。

不讓武昌魚長(zhǎng)出肌間刺,理論上講,如果能找到肌間刺形成的主控基因,是可以通過(guò)基因編輯技術(shù)實(shí)現(xiàn)的;但更重要的問(wèn)題是,不長(zhǎng)肌間刺的武昌魚能否正常生長(zhǎng)?

高澤霞想到,在魚類的進(jìn)化過(guò)程中,有的魚類的小刺變軟退化,有的魚類如鱸形目的鱸魚、鲇形目的黃顙魚都沒有肌間小刺……她覺得,單憑這個(gè),就值得一試。

中科院水生生物研究所研究員徐旭東告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》,在魚類的演化史上,小刺經(jīng)歷了逐漸增多、形態(tài)趨向復(fù)雜,之后又逐漸減少、消失的過(guò)程。他說(shuō),低等真骨魚類如鯡形目、鯉形目,小刺較多,而較高等的鱸形目則完全消失。但不幸的是,被國(guó)人選中的主養(yǎng)魚種刺很多,那些無(wú)小刺魚類一般養(yǎng)殖成本較高,或者“嬌氣不好養(yǎng)”,在產(chǎn)量上難以與常見的7大主養(yǎng)魚相匹敵。

除了產(chǎn)業(yè)價(jià)值,這項(xiàng)研究背后也有科學(xué)價(jià)值。高澤霞對(duì)記者表示:“我們的父母長(zhǎng)輩包括我自己也有腰椎間盤突出的問(wèn)題,研究肌間刺還跟了解骨質(zhì)增生(俗稱“骨刺”)有點(diǎn)關(guān)系。”綜合因素下,她決定瞄準(zhǔn)魚類的肌間刺剔除一探究竟。

理想很美,但真做起來(lái)的時(shí)候她才發(fā)現(xiàn),無(wú)從下手。

“當(dāng)時(shí)沒人能告訴你應(yīng)該怎樣開展這項(xiàng)工作;查閱生物信息數(shù)據(jù)庫(kù),也沒多少肌間刺相關(guān)的遺傳資源——大都是表型方面的:肌間刺什么時(shí)候長(zhǎng)、骨化順序如何等?!备邼上颊f(shuō):“這也是當(dāng)時(shí)為什么這類項(xiàng)目很難申請(qǐng)到經(jīng)費(fèi)的原因——沒有研究基礎(chǔ)、沒有預(yù)期結(jié)果,確實(shí)讓人很難辦。”

不過(guò),探索的種子已經(jīng)在心里扎了根,高澤霞堅(jiān)持要試一試。沒有正式項(xiàng)目支持,就借著實(shí)驗(yàn)室研究武昌魚的便利,先從基礎(chǔ)工作慢慢做起。

“挑刺兒”是個(gè)功夫活


高澤霞從最基本的形態(tài)學(xué)開始做起,然后再設(shè)法去構(gòu)建肌間刺的遺傳資源——肌間刺形成到底是哪些基因表達(dá)在發(fā)揮作用?哪個(gè)或哪幾個(gè)基因是關(guān)鍵基因?

“要想知道梨子的味道,就得親口嘗一嘗?!眴?wèn)題的答案,高澤霞決定把它們一個(gè)個(gè)“挑”出來(lái)。

這個(gè)“挑”,是“挑刺兒”的“挑”。

一條性成熟的武昌魚約有120多根肌間小刺(注:有個(gè)體差異,普遍數(shù)量為 84~146根),每根小刺都刺入肌肉組織內(nèi)部,且周圍有結(jié)締組織黏連。高澤霞要做的,就是要把這120多根肌間刺從活魚身上挑出來(lái),提取高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄組RNA,進(jìn)而探究肌間刺發(fā)生與基因表達(dá)之間的關(guān)系。

這絕對(duì)是個(gè)有難度的技術(shù)活兒。要挑刺兒,首先就得清楚知道這120多根肌間刺都分布在哪里,接著要從被麻醉的活魚身上,把這些跟結(jié)締組織黏連的肌間刺干凈利落地拔起,不能拖泥帶水;拔出后,還要迅速除掉外周的肌肉組織,趕在RNA降解之前放進(jìn)液氮中研磨,使骨組織充分分解,進(jìn)而提取高質(zhì)量的RNA。

高澤霞與學(xué)生

高澤霞帶著學(xué)生一挑就是三個(gè)月;三個(gè)月后,她的眼睛看哪里都好像有根刺。

熟能生巧,幾個(gè)月后她挑刺拔刺的功夫爐火純青。在這件事中,她總結(jié)了一個(gè)道理,經(jīng)常講給組內(nèi)的學(xué)生:做科研要敢想,敢想還要敢做,敢做還要敢于堅(jiān)持做、鍥而不舍地做,要有毅力和耐心。

“為什么這么說(shuō)?因?yàn)樽鲭y題很容易失敗,我們經(jīng)歷了太多次失敗?!备邼上几吨袊?guó)科學(xué)報(bào)》說(shuō),從那之后,高質(zhì)量地挑刺、拔刺,成了課題組每個(gè)學(xué)生必備技能之一。

這套“挑刺”程序也改進(jìn)了提取RNA的方法,實(shí)現(xiàn)了世界上第一次全面魚刺基因表達(dá),高澤霞據(jù)此申請(qǐng)了魚刺研究的第一個(gè)國(guó)家專利。她透露,這套方法,后續(xù)被許多研究人員借鑒、引用。

做肌間刺前幾年,“沒有人員費(fèi)”


“挑刺”這關(guān)一過(guò),課題組建立了很大信心:從這個(gè)過(guò)程中,他們已經(jīng)知道了肌間刺里都有哪些基因在表達(dá)。高澤霞還帶著團(tuán)隊(duì)把肌間刺外周的結(jié)締組織、肌肉組織也分離出來(lái),試圖找到它們之間基因表達(dá)的差異。

嚴(yán)格來(lái)說(shuō),肌間刺也是魚的骨骼。研究團(tuán)隊(duì)想要搞清楚肌間刺與魚的其它骨骼組織相比,在組織結(jié)構(gòu)上、基因表達(dá)上都有什么差異?

另外,魚的肌間刺并不是生來(lái)就有的。比如武昌魚的肌間刺是在孵化后十五六天才開始生長(zhǎng)、大概50天后全部長(zhǎng)齊,那么從沒有長(zhǎng)刺到長(zhǎng)第一根刺開始,再到所有的刺長(zhǎng)齊、變長(zhǎng)、變大的過(guò)程中,分別是哪些基因在發(fā)揮作用?

高通量測(cè)序技術(shù)(第二代測(cè)序技術(shù))的快速發(fā)展,為肌間刺基因資源的挖掘帶來(lái)了契機(jī)。之后,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)(第三代測(cè)序技術(shù))也逐漸獲得應(yīng)用。有了細(xì)胞水平的測(cè)序手段,高澤霞還想弄明白,為什么肌間刺的前身——肌腱細(xì)胞會(huì)向成骨細(xì)胞分化?

通過(guò)對(duì)武昌魚肌間刺發(fā)生、發(fā)育不同時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組、mRNA組、蛋白組等多組學(xué)分析,加之對(duì)比肌間刺組織與其他骨骼組織的基因、蛋白表達(dá)的差異性分析,高澤霞研究團(tuán)隊(duì)逐步弄清楚了調(diào)控武昌魚肌間刺生長(zhǎng)發(fā)育的基因作用,并篩選、鑒定了一批(約60個(gè))關(guān)鍵候選基因。

調(diào)控肌間刺發(fā)育的主效基因就藏在這些候選基因中。換言之,只要找對(duì)了關(guān)鍵基因,就可以通過(guò)基因編輯技術(shù),逐步構(gòu)建無(wú)肌間刺的武昌魚。

無(wú)肌間刺武昌魚,6個(gè)月、250g

這里不得不提的是,在做這些研究時(shí),高通量測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的費(fèi)用不菲。而高澤霞2012年剛開始“沒有一分錢來(lái)做這事”,直到2015年才拿到由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)提供的第一筆10萬(wàn)元青年自主創(chuàng)新基金;三年后成果有望,2018年才從學(xué)校拿到第二筆30萬(wàn)元項(xiàng)目基金。

做這件事,高澤霞得到了導(dǎo)師、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)教授王衛(wèi)民的全力支持。用她的話來(lái)說(shuō),實(shí)驗(yàn)室正常的運(yùn)轉(zhuǎn)全靠導(dǎo)師及自己主持的其他項(xiàng)目維持,她和學(xué)生們做武昌魚肌間刺,沒有人員費(fèi)、基礎(chǔ)耗材費(fèi)等經(jīng)費(fèi)支撐。

“完全沒有肌間刺,才有意義”


候選基因在手,高澤霞帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開始用模式魚類——斑馬魚來(lái)篩選主導(dǎo)魚類肌間刺發(fā)生發(fā)育的關(guān)鍵基因。鯉形目的斑馬魚只需3個(gè)月就能性成熟,用它來(lái)做基因篩選,能夠盡快看到敲除掉不同基因后魚兒的“長(zhǎng)刺表現(xiàn)”。畢竟,等待著他們篩選的潛在基因有60多個(gè)。

60多個(gè)基因的逐個(gè)排除、驗(yàn)證,找到關(guān)鍵主效基因工作量巨大。盡管有心理預(yù)期,但高澤霞自己也沒想到,竟花了長(zhǎng)達(dá)四五年時(shí)間。

期間,研究團(tuán)隊(duì)也有一些動(dòng)搖:培育一些少刺魚是不是也可行呢?畢竟少長(zhǎng)刺也比許多小刺強(qiáng)。這樣是不是也可以算作改良育種?但思忖再三,高澤霞覺得還要繼續(xù)找下去。

“只做一半算怎么回事兒?”她對(duì)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》說(shuō),無(wú)論是對(duì)消費(fèi)者還是對(duì)養(yǎng)殖業(yè)而言,“完全沒有肌間刺,才有意義”。

這幾年里,高澤霞抗住了里里外外的許多壓力。

在學(xué)校,有同一學(xué)院的老師覺得做無(wú)肌間刺武昌魚不靠譜,她會(huì)陪著笑臉跟老師們解釋;出去作報(bào)告,講她打算“死磕”無(wú)刺魚,也經(jīng)常聽到質(zhì)疑的聲音;她的學(xué)生用無(wú)小刺魚的研究方向開題,有生態(tài)等方面的評(píng)審專家覺得這事兒不值得做、做不成功,在開題報(bào)告答辯會(huì)上直接“勸退”。學(xué)生悻悻地找到她,她還要強(qiáng)打起精神給學(xué)生鼓勁兒。

“越是有質(zhì)疑的聲音,我越有動(dòng)力,一定要把無(wú)肌間刺的武昌魚做出來(lái)?!备邼上颊f(shuō)。

備受質(zhì)疑但也常受鼓舞。2015年,徐旭東以全國(guó)政協(xié)委員、水生生物專家的身份,在科學(xué)網(wǎng)博客發(fā)表題為《中國(guó)應(yīng)培育無(wú)小刺主養(yǎng)魚》的博文,作為他建言相關(guān)部門設(shè)立“原始創(chuàng)新基金”和“原始創(chuàng)新計(jì)劃”的生動(dòng)案例。

文章中,徐旭東提到“中國(guó)科學(xué)家應(yīng)當(dāng)拿出當(dāng)年攻關(guān)雜交水稻制種技術(shù)的智慧和勇氣培育無(wú)小刺主養(yǎng)魚品種”,他覺得“在中國(guó)人的食譜中,動(dòng)物性蛋白營(yíng)養(yǎng)有三分之一來(lái)自于魚類”,因此這個(gè)動(dòng)議“并非小題大做”。

高澤霞與徐旭東素未謀面,但得此文如遇知音,也堅(jiān)定了她做無(wú)小刺魚的決心。

無(wú)刺武昌魚魚苗

沒底氣?“大蓋巨脂鯉”送助攻


2015年還發(fā)生了一則趣事,讓高澤霞做武昌魚肌間刺這件事有了更多底氣。

那年她前往西班牙參加世界魚類遺傳育種大會(huì),分享她做魚刺的故事。會(huì)上,有一位巴西學(xué)者——University of Mogi das Cruzes的Alexandre Hilsdorf教授也講述了魚刺有關(guān)的故事,而且有著神奇的色彩。

在巴西有一種名為大蓋巨脂鯉的魚,是當(dāng)?shù)匾环N主要養(yǎng)殖魚類,屬于脂鯉目,也長(zhǎng)著上百根肌間刺。偶然的一天,這位學(xué)者接到一個(gè)養(yǎng)殖戶的電話,說(shuō)他們正在吃一條“一根小刺都沒有的大蓋巨脂鯉”,請(qǐng)他一定過(guò)來(lái)看看。

Alexandre Hilsdorf開始不相信有這種事情,但又覺得養(yǎng)殖戶不至于拿這件事騙他,琢磨再三之后,坐了三個(gè)小時(shí)的飛機(jī)去一探究竟。

那條魚確實(shí)是一根肌間刺都沒有。顧不上想到底怎么回事,他帶著透射儀器把這家養(yǎng)魚場(chǎng)的幾千條魚掃了個(gè)遍,還真的發(fā)現(xiàn)了十幾條完全沒有肌間刺的大蓋巨脂鯉。

這些無(wú)肌間刺的大蓋巨脂鯉一樣能繁育后代。這位學(xué)者不敢怠慢,就用這十幾條魚開始選育,果然培育出了無(wú)肌間刺的大蓋巨脂鯉。

“大家猜測(cè)那些魚是突變體?!备邼上几嬖V《中國(guó)科學(xué)報(bào)》,巴西境內(nèi)的亞馬遜河是全球自然環(huán)境條件最為變化多端的一條河流,無(wú)論光照、氣溫、干濕度都有可能創(chuàng)造自然突變條件。

可惜的是,現(xiàn)在他們也還沒弄清楚是哪些基因突變導(dǎo)致的。后來(lái),這位巴西學(xué)者還把不長(zhǎng)肌間刺的大蓋巨脂鯉樣本送給高澤霞,希望幫助探明背后原因。

但這個(gè)故事更令高澤霞激動(dòng)的是,這個(gè)現(xiàn)象表明,原本有肌間刺的魚類,在失去長(zhǎng)刺能力之后,一樣可以正常生長(zhǎng)、繁育,并且在營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和口味方面也沒有明顯差異。

“這不正好佐證了我們做這件事的意義嗎?”高澤霞激動(dòng)地反問(wèn)道。

她告訴記者,我國(guó)魚類遺傳育種與發(fā)育生物學(xué)領(lǐng)域知名專家、中國(guó)科學(xué)院院士桂建芳也吃到過(guò)無(wú)小刺的武昌魚。聽到這個(gè)消息后,她也效仿巴西學(xué)者去掃描了幾千條武昌魚,但可惜“運(yùn)氣沒那么好”。

不過(guò),桂建芳院士對(duì)她帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)做肌間刺工作非常支持和鼓勵(lì),并在研究思路、實(shí)驗(yàn)具體方案方面提供了很多指導(dǎo),這讓高澤霞很是感動(dòng)。

高澤霞(右二)

“無(wú)小刺魚”的故事未完待續(xù)


從60多個(gè)候選基因中,高澤霞團(tuán)隊(duì)先后發(fā)現(xiàn)了3個(gè)基因在不同程度上調(diào)控了魚類肌間刺的發(fā)生發(fā)育。

其中,scxa基因功能缺失,能讓魚類肌間刺的數(shù)目顯著減少70%左右,突變體斑馬魚背部肌間刺完全缺失,僅保留尾部少數(shù)肌間刺。但遺憾的是,scxa基因缺失品系也存在肋骨發(fā)育缺陷問(wèn)題。

后來(lái)他們發(fā)現(xiàn)bmp6基因的缺失也能讓斑馬魚肌間刺的數(shù)目顯著減少30%左右,且其他骨骼組織發(fā)育基本正常。

最終他們發(fā)現(xiàn)了runx2b基因缺失會(huì)導(dǎo)致突變斑馬魚肌間刺完全缺失,且其個(gè)體生長(zhǎng)、其它骨骼單元形成、肌肉脂肪酸和氨基酸含量等性狀均未受到顯著影響。
“就真的一根肌間刺都沒有。當(dāng)時(shí)我們都不敢相信這是真的,但又真的非常興奮。”高澤霞難以描述當(dāng)時(shí)的心情。

原來(lái),在runx2b基因之前,他們已經(jīng)鬧過(guò)一次“烏龍”。

2018年,一位學(xué)生觀察后跟高澤霞說(shuō),敲除掉scpp5基因的斑馬魚沒有長(zhǎng)出肌間刺。當(dāng)時(shí)整個(gè)課題組都激動(dòng)得不行,都以為成功了。但當(dāng)觀察了更多敲除掉這個(gè)基因的斑馬魚之后,大家又傻了眼:大部分斑馬魚甚至一根刺都沒少長(zhǎng)。

“那次我們就像坐了一趟過(guò)山車,所以發(fā)現(xiàn)runx2b基因后,大家覺得有點(diǎn)'不真實(shí)’,變得非常謹(jǐn)慎?!备邼上夹χf(shuō):“大家不能再受一次刺激了?!?/span>

幾乎檢測(cè)了實(shí)驗(yàn)室所有能檢測(cè)的敲除runx2b基因的斑馬魚后,大家才長(zhǎng)舒一口氣。

后來(lái),他們把這個(gè)發(fā)現(xiàn)發(fā)表在National Science Review(《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》英文版)上。

在模式魚類上告捷,馬不停蹄地,高澤霞開始帶隊(duì)在武昌魚上看效果。這一步,也非常關(guān)鍵。

“這個(gè)基因在魚類上高度同源,而且武昌魚和斑馬魚同屬于鯉形目,因此我們有預(yù)期,在武昌魚上會(huì)取得同樣的效果。”高澤霞說(shuō)。

當(dāng)敲除runx2b基因的武昌魚魚苗被培育出來(lái)、經(jīng)過(guò)“長(zhǎng)刺期”,被觀察到確實(shí)沒有肌間刺之后,那種內(nèi)心的激動(dòng)仍讓高澤霞久久不能平復(fù)。

故事到這里還沒講完。

高澤霞告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》,成果被報(bào)道后,許多人找她投資,聲稱要建廠、開公司。對(duì)此,高澤霞特別強(qiáng)調(diào)并聲明:“無(wú)肌間刺武昌魚的生產(chǎn)性推廣,一定要經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的試驗(yàn)性養(yǎng)殖評(píng)估。對(duì)每一代無(wú)肌間刺武昌魚生長(zhǎng)指標(biāo)、肉質(zhì)等指標(biāo)也都需要進(jìn)行細(xì)致的評(píng)估。并且,需國(guó)家層面有關(guān)基因編輯培育新品種的制度建立和頒布實(shí)施之后,才能考慮進(jìn)行生產(chǎn)性推廣。

“無(wú)刺魚相關(guān)的評(píng)估工作我們目前正在開展,另外,我們與國(guó)內(nèi)多個(gè)團(tuán)隊(duì)合作開展了草魚、銀鯽、鰱等重要養(yǎng)殖魚類的魚刺形成主效調(diào)控基因敲除實(shí)驗(yàn),也取得了一些進(jìn)展?!备邼上紝?duì)記者說(shuō),2020年,團(tuán)隊(duì)得到了武漢市一項(xiàng)50萬(wàn)元的科技計(jì)劃支持;2022年,湖北洪山實(shí)驗(yàn)室又批復(fù)了一筆250萬(wàn)元的支持經(jīng)費(fèi),專門開展肌間刺相關(guān)的研究。目前,她也是國(guó)家大宗淡水魚產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系魴種質(zhì)資源鑒定與新種質(zhì)創(chuàng)制崗位專家,有了相對(duì)穩(wěn)定的支持。

“我們今年共獲得了300多條完全沒有肌間刺的武昌魚。”這個(gè)數(shù)字讓她有點(diǎn)驕傲:這些魚是團(tuán)隊(duì)取得突破性成果的明證,而且這些魚,也足夠他們開展接下來(lái)的工作了。

“現(xiàn)在肌間刺的研究,也是我們的主業(yè)之一了。”高澤霞笑著說(shuō)道。

編輯 | 方圓

排版 | 郭剛

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