鄂爾多斯市中心醫(yī)院肖斌博士與北京中日友好醫(yī)院張維庫研究員組成的聯(lián)合研究小組發(fā)現(xiàn)治療新冠肺炎的潛在活性小分子!
▲內(nèi)蒙古細(xì)胞生物學(xué)會官網(wǎng)截圖
近日,鄂爾多斯市中心醫(yī)院肖斌博士與北京中日友好醫(yī)院張維庫研究員組成聯(lián)合研究小組,基于傳統(tǒng)中醫(yī)藥“以毒攻毒”理念,利用計算機(jī)輔助藥物設(shè)計等技術(shù)手段,開展了從有毒中藥瑞香狼毒中篩選抗SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)藥物的研究工作,并獲得了2個潛在高活性的小分子。
瑞香狼毒(斷腸草,蒙藥名:達(dá)楞圖如)始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,主產(chǎn)于我國內(nèi)蒙古、黑龍江、甘肅、青海等地。其味辛,性平,有毒,歸肝、脾經(jīng);主咳逆上氣,破積聚飲食、寒熱水氣,具有逐水祛痰、破積殺蟲之功效。近年來的研究顯示,其提取物及所含化學(xué)成分具有抗病毒活性(其中若干化合物具有較強(qiáng)的抗HIV活性以及較低的細(xì)胞毒性,EC90<1 nM)。
親和力最高的結(jié)合構(gòu)象
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↑①狼毒素,與氨基酸殘基THR-26、TYR-54、LEU-141形成3個氫鍵結(jié)合
↑②異狼毒素,與氨基酸殘基SER-144、CYS-145、GLY-143、LEU-141、GLU-166形成5個氫鍵結(jié)合
肖斌、張維庫等人綜合運(yùn)用計算機(jī)輔助藥物設(shè)計等技術(shù)手段,對瑞香狼毒中的百余個小分子化合物進(jìn)行了研究工作。鑒于Mpro蛋白表面多空腔的特點(diǎn),除與6LU7中小分子配體Mpro_B進(jìn)行對比外,研究小組采用了全覆蓋靶點(diǎn)蛋白(global grid box)的搜索策略,從中篩選出2個與Mpro靶點(diǎn)親和力強(qiáng)且策略方法重現(xiàn)性高的雙黃酮化合物狼毒素(Chamaejasmin)和異狼毒素(Isochamaejasmin),這2個化合物靶點(diǎn)親和力均大于瑞德西韋、利托那韋(Ritonavir)、更昔洛韋(Ganciclovir)、利巴韋林(Ribavirin)、氯喹(Chloroquine)、達(dá)蘆那韋(Darunavir)、阿巴卡韋(Abacavir)等已知藥物,且均能有效占據(jù)已知的Mpro蛋白結(jié)合位點(diǎn)并形成若干重要的氫鍵結(jié)合。
該研究為瑞香狼毒中天然產(chǎn)物的生物活性研究拓展了方向,可考慮將其納入抗SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)體內(nèi)外活性篩選中。
目前,聯(lián)合研究小組正在基于SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)相關(guān)靶點(diǎn)尋找更多可能的潛在藥物分子,也將針對與Mpro靶點(diǎn)蛋白親和力較強(qiáng)的狼毒中天然產(chǎn)物繼續(xù)進(jìn)行深入的抗SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)體內(nèi)外活性測試,以期為抗新冠肺炎藥物的發(fā)現(xiàn)和開發(fā)提供更多信息。
▲肖斌
肖斌,2007年9月至2013年就讀于沈陽藥科大學(xué),獲生藥學(xué)博士學(xué)位;2009年8月至2013年1月在釜山大學(xué)留學(xué),并從事博士課題研究;2013年8月至今,就職于鄂爾多斯市中心醫(yī)院藥劑科臨床藥學(xué)實(shí)驗室。多年來主要從事藥物化學(xué)、藥理學(xué)、分子對接等方面的藥學(xué)研究。
擔(dān)任內(nèi)蒙古細(xì)胞生物學(xué)會理事、鄂爾多斯市博士創(chuàng)新協(xié)會常務(wù)理事、鄂爾多斯市藥品學(xué)會理事。
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