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該系列在首發(fā)文之后便停更兩周
辜負(fù)廣(zi)大(zuo)粉(duo)絲(qing)的期待
這周說什么也得接上這條腿
身為不折不扣的實(shí)驗(yàn)汪plus生信菜鳥
歷練了一身抖M的絕技
自討苦吃與銷售技術(shù)唇槍舌戰(zhàn)推杯換盞后
綜合質(zhì)量與銅板的考量
總結(jié)了一套diao絲玩得起的辟邪劍譜
今日寡人風(fēng)雨兼程地推出
轉(zhuǎn)錄組RNA-seq的建庫詳解
依舊向諸位力薦天朝某贊的kit
還是先看過原理圖咯
是否有點(diǎn)似曾相識?
轉(zhuǎn)錄組建庫就是比基因組多個(gè)反轉(zhuǎn)錄
但由于起始Input是總RNA
mRNA捕獲片段化等過程中一定注意
RNase FREE?。?!
RNase FREE?。?!
RNase FREE?。?!
然后 流程快照
二鏈合成一步純化后
就和基因組建庫么區(qū)別啦!
那么。。。
涉及各組分的細(xì)節(jié)呢?
除了前面原理圖以外
這里可以再多補(bǔ)充一點(diǎn)
與dsDNA不同
RNA的片段化不靠超聲或酶解
而是利用二價(jià)金屬離子和高溫
也就是說那個(gè)frag/prime
含有Mg2+、Zn2+等
通過溫度和時(shí)間調(diào)節(jié)片段大小
其他的細(xì)節(jié)作為商機(jī)
喜歡打破砂鍋問到底的童鞋
比起DNA建庫
轉(zhuǎn)錄組還是麻煩了許多
步驟多、還易錯(cuò)
安利補(bǔ)救小貼士
還有幾點(diǎn)提示
LncRNA要用連特異性建庫
常規(guī)片段化后再反轉(zhuǎn)錄(單細(xì)胞相反)
其他品牌有細(xì)微差異,譬如
反轉(zhuǎn)錄加接頭、環(huán)化文庫、特異ID去dup等
以上內(nèi)容
未來會加以介紹
敬請期待 ; )
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