一是要核實(shí)企業(yè)當(dāng)期購進(jìn)的農(nóng)產(chǎn)品的進(jìn)項(xiàng)稅款，特別是取得增值稅專用發(fā)票的農(nóng)產(chǎn)品的進(jìn)項(xiàng)稅是否準(zhǔn)確核算并從當(dāng)期全部進(jìn)項(xiàng)稅額中轉(zhuǎn)出。同時(shí)，注意核實(shí)企業(yè)銷售免稅的副產(chǎn)品（例如植物油生產(chǎn)企業(yè)生產(chǎn)的副產(chǎn)品豆粕）進(jìn)項(xiàng)稅額是否按規(guī)定進(jìn)項(xiàng)稅額作轉(zhuǎn)出處理。

　　二是企業(yè)按照投入產(chǎn)出法核定農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項(xiàng)稅額，其公式是由當(dāng)期銷售貨物數(shù)量計(jì)算得出當(dāng)期農(nóng)產(chǎn)品耗用數(shù)量，再由當(dāng)期農(nóng)產(chǎn)品耗用數(shù)量計(jì)算得出允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額，而公式中當(dāng)期銷售貨物數(shù)量是不含采購除農(nóng)產(chǎn)品以外的半成品生產(chǎn)的貨物數(shù)量，也就是說用外購的半成品生產(chǎn)的貨物銷售時(shí)是按其購進(jìn)時(shí)取得的增值稅專用發(fā)票抵扣進(jìn)項(xiàng)稅的，而不是用核定扣除辦法計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅的，所以應(yīng)核實(shí)企業(yè)是否能夠分別準(zhǔn)確核算銷售的貨物是來源于自產(chǎn)半成品還是外購半成品。

　　三是要核實(shí)企業(yè)是否準(zhǔn)確核算副產(chǎn)品的銷售額并計(jì)提銷項(xiàng)稅，并通過副產(chǎn)品與主產(chǎn)品的比例關(guān)系測算企業(yè)實(shí)際生產(chǎn)及銷售主產(chǎn)品的數(shù)量。

　　四是企業(yè)按照投入產(chǎn)出法核定農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項(xiàng)稅額，其當(dāng)期銷售貨物數(shù)量只能是主產(chǎn)品的數(shù)量，而不含副產(chǎn)品的數(shù)量，以免重復(fù)計(jì)算抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額。