圖文并茂教你NCBI
2015-04-03江流兒EasyScienceEasyScience
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NCBI不僅是全面開(kāi)放的學(xué)術(shù)資源共享數(shù)據(jù)庫(kù)，而且其功能強(qiáng)大到無(wú)微不至。其中關(guān)于查詢基因序列這一塊，更是包羅萬(wàn)象，一家獨(dú)大。下面只針對(duì)性的介紹下包括全基因組、CCDS、mRNA、蛋白序列序列的查找方式。
① 打開(kāi)NCBI主頁(yè)在下拉框里選擇Gene選項(xiàng)，輸入基因名稱（nanog） 物種名稱（mouse）
② 搜索結(jié)果會(huì)有種屬的區(qū)別，要看清你要的種屬
③點(diǎn)擊nanog，出現(xiàn)如下頁(yè)面，選擇箭頭所指左鍵之
④在新的頁(yè)面點(diǎn)擊sequence即可顯示nanog的基因組序列
⑤nanog的基因組序列。下圖紅亮的部分為nanog基因的外顯子。外顯子的上游序列，可以搜尋nanog的啟動(dòng)子序列等調(diào)控元件。
⑥定位nanog的mRNA序列。選擇Nucleotide數(shù)據(jù)庫(kù)，輸入基因（nanog） 物種名（mouse）
⑦ 打開(kāi)箭頭所指鏈接，可以看到mRNA的相關(guān)信息以及全部序列
⑧如果想導(dǎo)出編碼區(qū)（CDS）序列，則點(diǎn)擊右上角的send，選擇Coding Sequence，然后Create file即可。
⑨如果想看到nanog的蛋白序列，則選擇Protein數(shù)據(jù)庫(kù)，點(diǎn)擊箭頭所指鏈接，就可以看到氨基酸的序列嘍！
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