今天是第2306期日報(bào)。
Nature Microbiology[IF:30.964]
① 口腔厭氧菌韋榮球菌屬物種在炎癥性腸病患者腸道中豐度升高；② 韋榮球菌能利用炎癥標(biāo)志性代謝產(chǎn)物硝酸鹽，作為終端電子受體進(jìn)行厭氧呼吸；③ 依賴narGHJI操縱子的硝酸鹽呼吸，可促進(jìn)韋榮球菌屬在有機(jī)酸中的生長，并使其能夠利用氨基酸和肽作為碳源，這種代謝轉(zhuǎn)變伴隨著碳代謝和ATP產(chǎn)生途徑的變化；④ 結(jié)腸炎模型小鼠中，小韋榮球菌的narG缺失突變菌株豐度顯著低于野生型菌株，說明硝酸鹽呼吸是結(jié)腸炎中小韋榮球菌異位定植的基礎(chǔ)。
Inflammation-associated nitrate facilitates ectopic colonization of oral bacterium Veillonella parvula in the intestine
09-22, doi: 10.1038/s41564-022-01224-7
【主編評語】口腔微生物在腸道的定植與多種疾病有關(guān)，如炎癥性腸?。↖BD）和結(jié)腸癌，但其中異位定制的機(jī)制尚不清楚。小韋榮球菌（Veillonella parvula）是一種從有機(jī)酸中獲取能量的口腔細(xì)菌，在炎癥性腸病患者的腸道中豐度顯著升高。Nature Microbiology最新發(fā)表的研究成果，證明韋榮球菌菌株可利用炎癥的標(biāo)志性代謝物硝酸鹽，作為終端電子受體進(jìn)行厭氧呼吸，并通過擴(kuò)展自身代謝途徑，以利用氨基酸等碳源進(jìn)行生長。本研究結(jié)果提供了一個(gè)研究框架，幫助理解IBD和其他炎癥患者中韋榮球菌屬物種的豐度增加的機(jī)制。（@NL）
Journal of the National Cancer Institute[IF:11.816]
① 選取美國3個(gè)人群隊(duì)列，分別隨訪13.9、6.4和7.9年，最終納入1306例肺癌患者和3304名健康人，采集口腔清洗樣本測序；② 發(fā)現(xiàn)較高的口腔菌群α多樣性與較低的肺癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)；③ 較高豐度的乏養(yǎng)菌屬、乳酸桿菌屬和鏈球菌屬，及消化鏈球菌、尤氏真桿菌、嗜胨菌屬和團(tuán)聚桿菌屬的存在與肺癌風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)；④ 菌群α多樣性與較低的鱗狀細(xì)胞癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，但與腺癌和小細(xì)胞肺癌關(guān)聯(lián)較弱；⑤ 口腔菌群與肺癌風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)，尤其對于鱗狀細(xì)胞癌患者和曾吸煙者。
The oral microbiome and lung cancer risk: An analysis of 3 prospective cohort studies
08-05, doi: 10.1093/jnci/djac149
【主編評語】多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)，肺癌患者的口腔菌群與健康人存在顯著差異，部分物種也有增加肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)的可能。近日，美國國家癌癥研究所研究人員在Journal of the National Cancer Institute發(fā)表最新研究，選取美國3個(gè)人群隊(duì)列約4600多人（1306例肺癌患者和3304名健康人），發(fā)現(xiàn)口腔菌群與肺癌密切相關(guān)，且較高的微生物多樣性與較低的肺癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。還鑒定出幾個(gè)標(biāo)志性物種，尤其是高豐度的乏養(yǎng)菌屬、乳酸桿菌屬和鏈球菌屬顯著增加了患病風(fēng)險(xiǎn)?？傊?，口腔菌群與肺癌風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)，尤其對于鱗狀細(xì)胞癌患者和曾吸煙者。（@九卿臣）
Molecular Psychiatry[IF:13.437]
① 納入1982年黎巴嫩戰(zhàn)爭中以色列退伍軍人189名，采集唾液樣本測序，發(fā)現(xiàn)空氣污染與PTSD和較高精神病理指標(biāo)正相關(guān)；② PTSD嚴(yán)重程度與口腔菌群多樣性和豐度有關(guān)，睡眠障礙與sp_HMT_332、Noxia豐度正相關(guān)，與擬桿菌門負(fù)相關(guān)；③ 受教育年限與sp_HMT_871水平升高、擬桿菌門和厚壁菌門水平降低有關(guān)，與不良精神病理指標(biāo)負(fù)相關(guān)；④ PTSD患者具有sp_HMT_332和871和Noxia水平降低及擬桿菌、厚壁菌門豐度增加的特征，存在代謝紊亂現(xiàn)象（如轉(zhuǎn)醛酶）。
Oral microbiota signatures in post-traumatic stress disorder (PTSD) veterans
07-22, doi: 10.1038/s41380-022-01704-6
【主編評語】創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙（ PTSD）是指個(gè)體經(jīng)歷、目睹或遭遇到一個(gè)或多個(gè)涉及自身或他人的實(shí)際死亡，導(dǎo)致延遲出現(xiàn)和長期持續(xù)的精神障礙，尤其是在經(jīng)歷戰(zhàn)爭的退伍人群中發(fā)病率更高。近日，以色列研究人員在Molecular Psychiatry發(fā)表最新研究，納入1982年黎巴嫩戰(zhàn)爭中以色列退伍軍人189名采集唾液樣本，發(fā)現(xiàn)患有PTSD的退伍軍人唾液中存在一組特定類型的細(xì)菌。總之，該研究有助于強(qiáng)化對PTSD的物理診斷，以便更好制定合理的措施干預(yù)或治療PTSD患者。（@九卿臣）
Journal of Crohn's and Colitis[IF:10.02]
① 納入41名CD患者和24名健康人，其中39%CD患者有口腔表現(xiàn)，表現(xiàn)為鵝卵石化和/或口腔潰瘍；② CD患者和健康人的口腔菌群具有顯著差異，且差異由CD診斷、同時(shí)使用類固醇或硫唑嘌呤和存在口腔潰瘍等變量主導(dǎo)；③ 在健康人、有口腔表現(xiàn)和無口腔表現(xiàn)的CD患者中鑒定到32種豐度具有顯著差異的物種，大多數(shù)與CD診斷有關(guān)，如活潑瘤胃球菌；④ 口腔菌群可作為診斷物區(qū)分CD患者與健康人，且丁酸鹽代謝相關(guān)的微生物酶增加與存在口腔潰瘍呈正相關(guān)。
Oral Microbiome of Crohn’s Disease Patients With and Without Oral Manifestations
05-02, doi: 10.1093/ecco-jcc/jjac063
【主編評語】Journal of Crohn's and Colitis近期發(fā)表的研究，探究了有/無口腔表現(xiàn)的CD患者口腔微生物群結(jié)構(gòu)。發(fā)現(xiàn) CD患者的口腔微生物群與正常個(gè)體有顯著差異，提示口腔微生物或可以用于診斷CD。（@NL）
Cell Reports[IF:9.995]
① 口腔致病菌牙齦卟啉單胞菌（Pg）的腸道易位通過增強(qiáng)Th17細(xì)胞分化加劇牙周炎；② Pg的外膜囊泡含有T細(xì)胞抗原和佐劑以誘導(dǎo)Pg-Th17細(xì)胞分化；③ Pg通過腸道M細(xì)胞被派氏結(jié)吸收并呈遞給樹突細(xì)胞，誘導(dǎo)Pg-Th17細(xì)胞在派氏結(jié)中分化并發(fā)生全身易位；④ Pg誘導(dǎo)的牙周炎和Th17細(xì)胞反應(yīng)在無菌小鼠中減弱；⑤ 腸道來源的Th17細(xì)胞在口腔感染后遷移至口腔；⑥ 抗生素改變腸道菌群，從而影響牙周炎發(fā)生發(fā)展。
Pathobiont-responsive Th17 cells in gut-mouth axis provoke inflammatory oral disease and are modulated by intestinal microbiome
09-06, doi: 10.1016/j.celrep.2022.111314
【主編評語】雖然Th17細(xì)胞介導(dǎo)的免疫應(yīng)答在牙周免疫及炎癥中發(fā)揮重要作用，但Th17型免疫反應(yīng)在何處發(fā)生以及如何被誘導(dǎo)尚不清楚。Cell Reports最新研究發(fā)現(xiàn)，致病菌牙齦卟啉單胞菌的腸道易位通過增強(qiáng)腸道Th17細(xì)胞分化，從而加劇牙周炎，同時(shí)腸道菌群在該過程中起著關(guān)鍵作用。（@RZN）
JCI insight[IF:9.484]
① 研究SPF與無菌（GF）小鼠牙槽骨和非口腔骨骼的骨免疫，評估與全身菌群不同的口腔菌群誘導(dǎo)的骨免疫調(diào)節(jié)作用；② SPF組與GF組小鼠皮質(zhì)/小梁骨減少，牙槽骨中促破骨表型增強(qiáng)；③ SPF小鼠牙槽骨BM中具有促破骨作用的TLR信號和Th17細(xì)胞增加，誘導(dǎo)口腔菌群參與特殊免疫刺激作用；④ 口腔共生菌誘導(dǎo)小鼠牙槽骨BM中MHCII抗原限制性呈遞；⑤ 洗必泰抑菌劑沖洗可減少SPF小鼠口腔菌群（但不影響腸道菌群），有效緩解自然發(fā)生的骨質(zhì)流失，維持牙槽骨穩(wěn)態(tài)。
Commensal oral microbiota induces osteoimmunomodulatory effects separate from systemic microbiome in mice
01-25, doi: 10.1172/jci.insight.140738
【主編評語】共生微生物對骨骼穩(wěn)態(tài)有重要調(diào)節(jié)作用，但特異性微生物群落對骨免疫反應(yīng)機(jī)制的影響尚不清楚。近日，南卡羅萊納醫(yī)科大學(xué)研究人員在JCI insight發(fā)表最新研究，發(fā)現(xiàn)口腔菌群激活了一組免疫細(xì)胞，而這些免疫細(xì)胞反過來又會(huì)影響破骨細(xì)胞。進(jìn)一步動(dòng)物實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)使用殺菌漱口水來消耗健康的口腔菌群，可有效緩解自然發(fā)生的骨質(zhì)流失，維持牙槽骨穩(wěn)態(tài)，表明口腔菌群和牙槽骨丟失間有直接聯(lián)系。未來仍需要深入挖掘哪些特定的物種真正導(dǎo)致了自然發(fā)生的牙槽骨流失。（@九卿臣）
Nature Communications[IF:17.694]
① 通過電子顯微鏡探究奈瑟菌科細(xì)胞形狀，除毛蟲狀細(xì)絲外，還有桿狀和球菌狀；② 比較整個(gè)奈瑟菌科細(xì)胞形狀和基因組，推斷多細(xì)胞、縱向分裂細(xì)菌是從桿狀、橫向分裂細(xì)菌進(jìn)化而來；③ 多個(gè)特定基因位點(diǎn)（AmiC2，MreB，F(xiàn)tsA等）的突變可能介導(dǎo)這種不尋常的繁殖策略；④ 將基因變化引入棒狀奈瑟科重現(xiàn)這種進(jìn)化，雖不能強(qiáng)迫桿狀細(xì)菌變成多細(xì)胞，但會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞變長變??；⑤ 進(jìn)化過程中，細(xì)胞形狀通過延長/分裂過程的重新加工發(fā)生改變，以便在口腔中存活。
Evolution of longitudinal division in multicellular bacteria of the Neisseriaceae family
08-22, doi: 10.1038/s41467-022-32260-w
【主編評語】口腔中有超過700種細(xì)菌，需要不斷地經(jīng)歷來自上皮細(xì)胞脫落、唾液流動(dòng)以及口腔清理等因素的擾動(dòng)，生存挑戰(zhàn)巨大。相比人體腸道，對口腔菌群是如何生長和分裂的還知之甚少。近日，研究人員在Nature Communications發(fā)表最新研究，發(fā)現(xiàn)為更好地粘在口腔，奈氏菌科的細(xì)菌進(jìn)化出了一種獨(dú)特的繁殖方式，雖然典型桿狀物是橫向分裂，但一些生活在人體口腔中的奈氏菌科會(huì)用其尖端附著在基底上，進(jìn)行縱向分裂，一旦細(xì)胞分裂完成，它們就會(huì)相互連接，形成毛毛蟲一樣的細(xì)絲?？傊?，該研究揭示了一種新的細(xì)胞進(jìn)化方式，有助于未來研究細(xì)菌是如何學(xué)會(huì)附著在動(dòng)物表面生活提供指導(dǎo)，值得關(guān)注。（@九卿臣）
Microbiome[IF:16.837]
① 使用熒光原位雜交和光譜成像研究牙菌斑的corncob結(jié)構(gòu)（由束縛在棒狀桿菌細(xì)絲上的球狀細(xì)菌組成）；② 四大類牙菌斑鏈球菌，有兩類是corncob的主要細(xì)菌，其中一類是corncob中最豐富的鏈球菌；③ 在所有樣本中兩類鏈球菌都存在，即該類群具有不同的生態(tài)作用或存在穩(wěn)定種群中功能冗余類群持續(xù)存在的機(jī)制；④ 其他斑塊細(xì)菌的有限亞群之間，也觀察到直接的分類群之間的互作，即每種微生物都可以與多個(gè)潛在伙伴互作來促進(jìn)群落長期穩(wěn)定。
Corncob structures in dental plaque reveal microhabitat taxon specificity
09-05, doi: 10.1186/s40168-022-01323-x
【主編評語】人的口腔是研究細(xì)菌群落如何在不同的棲息地中存在差異的一個(gè)天然實(shí)驗(yàn)室。牙菌斑的corncob結(jié)構(gòu)(由束縛在棒狀桿菌細(xì)絲上的球狀細(xì)菌組成)可用于分析復(fù)雜的天然生物膜中的微生境群落結(jié)構(gòu)。Microbiome近期發(fā)表的文章，借助熒光原位雜交和光譜成像技術(shù)，發(fā)現(xiàn)在corncob結(jié)構(gòu)中，每個(gè)分類群都與有限的潛在微生物群聯(lián)系在一起，這一特點(diǎn)可能會(huì)促進(jìn)群體的的長期穩(wěn)定。深入闡明口腔生物膜中的細(xì)菌近鄰關(guān)系，可能會(huì)發(fā)現(xiàn)更多的分類群關(guān)系，并能利用這些關(guān)系對這些群落進(jìn)行有針對性的調(diào)節(jié)，以維護(hù)口腔健康。（@NL）
NPJ Biofilms and Microbiomes[IF:8.462]
① 納入公民科學(xué)項(xiàng)目中1648名西班牙人（7-85 歲），進(jìn)行口腔菌群分析；② 口腔菌群組成與年齡有關(guān)，與青少年和老年人相比，中年人口腔菌群更為相似，α多樣性更低，而老年人菌群組成更多樣化，且低豐度類群豐度顯著增加，如艾肯氏菌屬和依賴桿菌屬；③ 隨著年齡增長，口腔中的pH值顯著下降，BMI值顯著增加；④ 慢性疾病、吸煙和口腔中的酵母菌是口腔菌群組成的重要驅(qū)動(dòng)因素；⑤ 家庭成員間的口腔菌群組成更相似，且首次發(fā)現(xiàn)同學(xué)間菌群具有相似性。
Citizen-science reveals changes in the oral microbiome in Spain through age and lifestyle factors
05-19, doi: 10.1038/s41522-022-00279-y
【主編評語】口腔微生物與多種口腔感染性疾病及系統(tǒng)性疾病緊密相關(guān)。隨著“人類微生物組計(jì)劃”及其他微生物宏基因組學(xué)相關(guān)項(xiàng)目的開展，人們對口腔微生物群落的認(rèn)識(shí)不斷深入。鑒于口腔與消化、呼吸和循環(huán)系統(tǒng)的聯(lián)系，口腔菌群的組成不僅與口腔健康有關(guān)，還影響全身的系統(tǒng)過程。然而，我們對形成健康口腔菌群組成的內(nèi)在和外在因素的了解仍然非常有限。發(fā)表在NPJ Biofilms and Microbiomes上的一項(xiàng)研究評估了千余名涵蓋了各個(gè)年齡段的西班牙人的口腔菌群特征，有助于發(fā)展基于口腔菌群的口腔及全身系統(tǒng)性疾病的個(gè)體化預(yù)防、診斷及治療策略。（@EADGBE）
mSystems[IF:7.324]
① 當(dāng)具核梭桿菌與S.gordonii或V.parvula共培養(yǎng)時(shí)，具核梭桿菌增加了氨基酸的可用性，丁酸鹽、腐胺、尸胺的產(chǎn)生增多；② 依賴于精氨酸-鳥氨酸逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的S.gordonii產(chǎn)生的鳥氨酸，協(xié)同誘導(dǎo)腐胺產(chǎn)生，在具核梭桿菌生物膜表面形成富含腐胺的微環(huán)境；③ 腐胺加速了牙周病原體P.gingivalis生物膜從成熟到擴(kuò)散的生命周期；④ 分析菌斑樣本發(fā)現(xiàn)，P.gingivalis與S.gordonii和具核梭桿產(chǎn)生腐胺的遺傳模塊共存。
Fusobacterium nucleatum Metabolically Integrates Commensals and Pathogens in Oral Biofilms
07-19, doi: 10.1128/msystems.00170-22
【主編評語】具核梭桿菌是口腔微生物群的一種常見細(xì)菌。之前的研究表明具核梭桿菌和S. gordonii之間存在鳥氨酸互養(yǎng)相互作用，然而，具核梭桿菌在多菌群中更廣泛的代謝方面的作用及其對牙周發(fā)病機(jī)制的影響尚不清楚。mSystems發(fā)表的研究表明，其他口腔共生細(xì)菌提供的氨基酸可誘導(dǎo)具核梭桿菌產(chǎn)生多胺，從而創(chuàng)造富含多胺的微環(huán)境。經(jīng)由具核梭桿菌代謝整合的營養(yǎng)網(wǎng)絡(luò)：從精氨酸到鳥氨酸產(chǎn)生腐植酸，加速了牙周病原體牙齦卟啉菌的生物膜生命周期，揭示口腔生物膜內(nèi)的微生物合作代謝如何促進(jìn)牙周炎產(chǎn)生。（@NL）
感謝本期日報(bào)的創(chuàng)作者：NL，accepted，XLyasby，Mona，Zzz，九卿臣，拍了花寶貝
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