日前，某紡織有限責(zé)任公司采購(gòu)員龔某向湖南省永州市國(guó)稅局12366納稅服務(wù)熱線咨詢，該公司是增值稅一般納稅人，1999年投產(chǎn)，主要從事棉紗加工和布匹印染業(yè)務(wù)。2008年3月，龔某從外地購(gòu)進(jìn)一批棉紗，并請(qǐng)當(dāng)?shù)匾患衣?lián)運(yùn)公司負(fù)責(zé)運(yùn)輸。棉紗運(yùn)回后，公司向聯(lián)運(yùn)公司支付了123922元運(yùn)費(fèi)，18588.24元建設(shè)基金和15490.2元的裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)，合計(jì)158000.44元。為了結(jié)算方便，龔某與聯(lián)運(yùn)公司商定，在開(kāi)具的運(yùn)輸發(fā)票上直接以“運(yùn)雜費(fèi)”的名義注明了全部費(fèi)用158000.44元。公司財(cái)務(wù)人員隨后將這筆運(yùn)輸費(fèi)用申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅11060.03元（158000.44×7%）。而主管國(guó)稅機(jī)關(guān)認(rèn)為這筆“運(yùn)雜費(fèi)”不能進(jìn)行進(jìn)項(xiàng)稅抵扣，要求企業(yè)轉(zhuǎn)出已抵扣進(jìn)項(xiàng)稅11060.03元。這讓公司財(cái)務(wù)人員和龔某疑惑不解：國(guó)家不是規(guī)定運(yùn)費(fèi)可以抵扣嗎？為什么有正規(guī)發(fā)票卻不讓抵扣？
12366咨詢員小黃告訴龔某，國(guó)家有運(yùn)費(fèi)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅相關(guān)規(guī)定，但是填寫不規(guī)范的不能抵扣。國(guó)家稅務(wù)總局《》（財(cái)稅〔1998〕114號(hào)）規(guī)定，增值稅一般納稅人購(gòu)進(jìn)或銷售貨物支付的運(yùn)輸費(fèi)用的扣除率為7%。國(guó)家稅務(wù)總局《》（國(guó)稅發(fā)〔2004〕88號(hào)）第十條第二款規(guī)定，增值稅一般納稅人取得稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)定為自開(kāi)票納稅人的聯(lián)運(yùn)單位和物流單位開(kāi)具的貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票，準(zhǔn)予計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。準(zhǔn)予抵扣的貨物運(yùn)費(fèi)金額，是指自開(kāi)票納稅人和代開(kāi)票單位為代開(kāi)票納稅人開(kāi)具的貨運(yùn)發(fā)票上注明的運(yùn)費(fèi)、建設(shè)基金和現(xiàn)行規(guī)定允許抵扣的其他貨物運(yùn)輸費(fèi)用；裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)和其他雜費(fèi)不予抵扣。貨運(yùn)發(fā)票應(yīng)當(dāng)分別注明運(yùn)費(fèi)和雜費(fèi)，對(duì)未分別注明，而合并注明為運(yùn)雜費(fèi)的不予抵扣。按照此規(guī)定，該公司在向聯(lián)運(yùn)公司支付的費(fèi)用中，只有運(yùn)費(fèi)和建設(shè)基金可以抵扣，裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)等雜費(fèi)是不能抵扣的，而該公司取得的運(yùn)輸發(fā)票上并未對(duì)這些費(fèi)用分別注明，這種發(fā)票不能抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。
咨詢員同時(shí)提醒龔某在辦理稅款抵扣時(shí)注意，國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于公路內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票增值稅抵扣有關(guān)問(wèn)題的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告〔2006〕2號(hào)）第一條規(guī)定，自2007年1月1日起，增值稅一般納稅人購(gòu)進(jìn)或銷售貨物，取得的作為增值稅扣稅憑證的貨運(yùn)發(fā)票，必須是通過(guò)貨運(yùn)發(fā)票稅控系統(tǒng)開(kāi)具的新版貨運(yùn)發(fā)票。在申報(bào)抵扣時(shí)除報(bào)送《增值稅運(yùn)輸發(fā)票抵扣清單》紙質(zhì)文件外，還要報(bào)送使用國(guó)家免費(fèi)提供的軟件錄制的電子信息。電子信息比對(duì)不符的不允許抵扣。國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于加強(qiáng)貨物運(yùn)輸業(yè)稅收征收管理有關(guān)問(wèn)題的通知》（國(guó)稅發(fā)明電〔2003〕53號(hào)）規(guī)定，增值稅一般納稅人取得的貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票，可以在自發(fā)票開(kāi)具日90天后的第一個(gè)納稅申報(bào)期結(jié)束以前申報(bào)抵扣。運(yùn)費(fèi)發(fā)票超過(guò)抵扣時(shí)間的，也不能抵扣。
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