今天是第1325期日報。
Nature Communications[IF:11.878]
① 在Ca+和膽固醇幫助下，通過渦旋可快速將二油?；字岣采w到大腸桿菌Nissle 1917菌株（EcN）表面，形成自組裝脂膜包被的細菌（LCB），該方法也適用其它形態(tài)的細菌；② 正常培養(yǎng)時，LCB的生長及活力與EcN無差異，但在強酸、強堿、高濃度乙醇和膽鹽、人工胃液和腸液條件下具有更高的存活率；③ LCB在小鼠腸道的保留時間和存活率顯著高于未包被的EcN；④ LCB在預防和治療鼠傷寒沙門氏菌和DSS誘導的小鼠結腸炎方面明顯優(yōu)于EcN。
Biointerfacial self-assembly generates lipid membrane coated bacteria for enhanced oral delivery and treatment
12-19, doi: 10.1038/s41467-019-13727-9
【主編評語】口服活菌改善腸道微生態(tài)的療法，受限于活菌在消化道內(nèi)的低存活率。上海交大醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院、上海市腫瘤研究所劉盡堯團隊，近期在Nature Communications報道了一種方法，可快速制備被脂膜包被的細菌，能大大增強細菌在消化道內(nèi)的存活和存留，并以大腸桿菌Nissle 1917菌株為例，表明這一技術可提高這種益生菌防治小鼠結腸炎的效果。（@mildbreeze）
Cell Host and Microbe[IF:15.753]
① 納入212名雙胞胎，發(fā)現(xiàn)酒精可導致腸道菌群失調(diào)，羅斯拜瑞氏屬豐度降低；② 腸道羅斯拜瑞氏菌（R. intestinalis）能改善小鼠酒精性脂肪肝（ALD），降低與肝臟炎癥、脂質(zhì)轉(zhuǎn)運相關基因的表達，死菌也有效；③ R. intestinalis鞭毛蛋白或可通過識別TLR5，上調(diào)緊密連接蛋白Occludin和粘蛋白MUC2基因，保護腸屏障，并上調(diào)IL-22和REG3γ基因；④ R. intestinalis干預ALD小鼠，可改善腸道菌群；⑤ R. intestinalis含糖苷水解酶，能恢復多糖代謝功能。
Roseburia Spp. Abundance Associates with Alcohol Consumption in Humans and Its Administration Ameliorates Alcoholic Fatty Liver in Mice
12-19, doi: 10.1016/j.chom.2019.11.001
【主編評語】目前認為腸道菌與酒精肝的發(fā)生有關，但是，對究竟哪些細菌的變化會引起酒精性脂肪肝，及這些細菌的功能是什么，相關的研究都還不夠充分。Cell Host and Microbe最近發(fā)表的研究，招募了212名雙胞胎，在考慮宿主基因和其他潛在混雜因素的基礎上，分析了飲酒（酒精攝入）對腸道菌群的影響，結果發(fā)現(xiàn)酒精可導致腸道菌群失調(diào)，羅斯拜瑞氏屬豐度降低，腸桿菌科增多。用腸道羅斯拜瑞氏菌（R. intestinalis）干預酒精性脂肪肝小鼠，能改善小鼠酒精性脂肝，增強腸屏障。本研究結果或可用于開發(fā)治療酒精性脂肝的微生物療法。（@nana）
Cell Host and Microbe[IF:15.753]
① 對比分析兒童、年輕人及老年人的鼻菌群組成，發(fā)現(xiàn)在人鼻菌群成熟期間，莫拉克斯氏菌屬等致病菌顯著減少，而表皮葡萄球菌顯著增加；② 在老年人中，鼻菌群的上述變化趨勢有所逆轉(zhuǎn)，表皮葡萄球菌減少而致病菌增加；③ 在體外，表皮葡萄球菌可刺激鼻上皮細胞產(chǎn)生抗菌肽（包括hBD3及LL37），以減少致病菌數(shù)量；④ 表皮葡萄球菌可形成生物膜，以保護其自身免受抗菌肽影響；
Staphylococcus epidermidis Contributes to Healthy Maturation of the Nasal Microbiome by Stimulating Antimicrobial Peptide Production
12-19, doi: 10.1016/j.chom.2019.11.003
【主編評語】來自上海交通大學醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院的李敏團隊與國外團隊合作在Cell Host and Microbe上發(fā)表的一項最新研究，發(fā)現(xiàn)在鼻菌群成熟期間，表皮葡萄球菌通過刺激鼻上皮細胞產(chǎn)生抗菌肽殺傷致病菌，并通過形成生物膜抵抗抗菌肽的殺傷作用，從而促進鼻菌群的健康成熟。（@szx）
Gut Microbes[IF:7.823]
① 豬腸道菌群在調(diào)控消化道健康、代謝穩(wěn)態(tài)以及生理、神經(jīng)和免疫功能中有重要作用；② 動物的年齡、出生方式、品種和遺傳、飲食因素（膳食纖維、銅含量、益生菌、益生元等）、抗生素使用、應激源（如斷奶、感染和炎癥等）以及周圍環(huán)境，都可能影響豬的腸道菌群；③ 腸道菌群可影響豬的腸道和系統(tǒng)性免疫，在菌群與宿主的互作中，腸堿性磷酸酶（IAP）和誘導型熱休克蛋白（iHSP）可調(diào)控抗氧化和抗炎癥反應，對消化道上皮起保護作用。
Interactions between host and gut microbiota in domestic pigs: a review
11-24, doi: 10.1080/19490976.2019.1690363
【主編評語】豬不僅是重要的養(yǎng)殖動物，也是研究菌群-宿主互作的模式生物。Gut Microbes近期發(fā)表了來自廣東海洋大學團隊的綜述，回顧了家豬相關的腸道菌群與宿主互作的研究進展。（@mildbreeze）
Free Radical Biology and Medicine[IF:5.657]
① 小鼠分為4組：對照、DSS誘導結腸炎、DSS+NaCl處理、DSS+NaNO3處理；② NaNO3可緩解DSS誘導的小鼠結腸炎，增加結腸長度，維持體重，減少結腸上皮細胞的凋亡，減少結腸及外周血中的炎癥細胞浸潤；③ DSS處理可導致小鼠腸道菌群失調(diào)，NaNO3處理可恢復乳桿菌屬等有益細菌，增加Gordonibacter等分類群；④ DSS處理可導致p53信號通路、結直腸癌相關通路等代謝通路的富集，NaNO3處理可降低這些通路。
Nitrate ameliorates dextran sodium sulfate-induced colitis by regulating the homeostasis of the intestinal microbiota
12-04, doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2019.12.002
【主編評語】來自首都醫(yī)科大學附屬北京口腔醫(yī)院的王松靈團隊與北京大學口腔醫(yī)院的陳峰團隊在Free Radical Biology and Medicine上發(fā)表的一項最新研究，發(fā)現(xiàn)在DSS誘導的小鼠結腸炎模型中，硝酸鹽可緩解結腸炎癥，并調(diào)節(jié)腸道菌群的組成與功能，提示硝酸鹽或可用于未來的IBD治療。（@szx）
Science of the Total Environment[IF:5.589]
① 在61名患者及73名健康人的糞便中共檢測到111個抗生素抗性基因（ARG）和7個可移動遺傳元件（MGE）；② ARG的主要作用機制包括：導致抗生素失活、細胞保護及外排泵；③ 與健康人相比，患者腸道抗性組及菌群的多樣性較低，而抗生素ARG濃度較高；④ 抗生素含量與ARG的總豐度正相關，與ARG及菌群的多樣性負相關；⑤ 高豐度的cfxA基因（β內(nèi)酰胺類抗生素耐藥基因）可作為抗生素使用的生物標記；⑥ 人腸道中的獸用抗生素可能從飲食中獲得。
Gut resistomes, microbiota and antibiotic residues in Chinese patients undergoing antibiotic administration and healthy individuals
11-21, doi: 10.1016/j.scitotenv.2019.135674
【主編評語】來自南開大學的羅義和毛大慶與團隊在Science of the Total Environment上發(fā)表的一項最新研究，從中國3個省份收集上百份糞便樣本，對比分析了健康人（6個月內(nèi)未接受過抗生素治療）及患者（1個月內(nèi)接受過抗生素治療）的腸道抗性組、菌群、及抗生素殘留情況，發(fā)現(xiàn)近期使用抗生素可降低腸道菌群多樣性，增加腸道中的抗生素耐藥基因水平。（@szx）
NPJ Biofilms and Microbiomes[IF:6.333]
① 日本人動物產(chǎn)品攝入較多，腸道菌群中擬桿菌豐度更高，而印度人攝入更多的植物多糖，普雷沃氏菌和念珠菌豐度更高；② 念珠菌在體外對植物多糖阿拉基木聚糖（AX）具有強烈的生長反應；③ 含有AX的念珠菌生長培養(yǎng)基上清液，促進糞便普雷沃氏菌（P. copri）快速增殖，其中的阿拉伯糖是潛在的促生長因子；④ 念珠菌對木糖具有生長反應，對阿拉伯糖則沒有，而P. copri對木糖和阿拉伯糖皆有生長反應；⑤ 無菌小鼠經(jīng)念珠菌定殖后，可促進P. copri定殖。
Comparison of Japanese and Indian intestinal microbiota shows diet-dependent interaction between bacteria and fungi
12-20, doi: 10.1038/s41522-019-0110-9
【主編評語】腸道菌群中存在微生物的跨界互作，NPJ Biofilms and Microbiomes發(fā)表的一項研究報道了這樣一個具體例子。該研究通過對比不同飲食偏好的日本人和印度人的腸道菌群，結合體外和動物實驗，表明腸道真菌念珠菌可促進腸道共生細菌——糞便普雷沃氏菌的定植和生長，這種真菌-細菌互作中，特定膳食多糖成分可能有關鍵介導作用。（@mildbreeze）
Nature Microbiology[IF:14.3]
① 微生物組中心的首要任務是通過促進合作、支持新項目和提供實驗室和分析服務，加速微生物組研究，也為校園和社區(qū)服務；② 為欲從事微生物組研究的人員提供培訓、對微生物組研究方法的需要、資金資助，促進了微生物組中心的出現(xiàn)；③ 多個中心形成微生物組中心聯(lián)盟（MCC），利于跨學科合作、制定行業(yè)標準、提供平臺等；④ 多數(shù)中心由短期內(nèi)部資金支持，依賴教職工自愿貢獻時間，MCC或可通過擴大資助范圍、發(fā)展慈善和行業(yè)伙伴關系等解決此問題。
The emergence of microbiome centres
12-19, doi: 10.1038/s41564-019-0644-x
【主編評語】Nature Microbiology最近發(fā)表的評論文章，從微生物組中心的任務及作用、出現(xiàn)的原因、面臨的問題及解決方法等方面進行了闡述，意在說明微生物組中心的建立旨在共享戰(zhàn)略和加速知識轉(zhuǎn)移，為微生物組科學發(fā)聲。（@nana）
感謝本期日報的創(chuàng)作者：EADGBE，王文東，szx，宋云皓，Echo Quasimodo
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