2018年4月27日，Nature Communications在線發(fā)表了北京林業(yè)大學(xué)張啟翔教授、程堂仁教授，華大基因陳文彬與美國賓夕法尼亞州立大學(xué)鄔榮領(lǐng)教授為通訊作者的題為“The genetic architecture of floral traits in the woody plant Prunus mume”的研究論文。
梅（Prunus mume）是一種觀賞性木本植物，已在東亞經(jīng)歷了數(shù)千年馴化。梅花性狀的高度多樣性及其近年來完成的基因組測序結(jié)果使它成為研究木本植物進(jìn)化過程的理想模式系統(tǒng)。該研究對(duì)351個(gè)梅樣品（包括348個(gè)梅種質(zhì)和其他3種李屬植物）進(jìn)行了重測序（平均測序深度為19.3x），以探究梅花序性狀的遺傳基礎(chǔ)及其馴化歷史。在梅種質(zhì)中鑒定出李屬植物高度混合的種群結(jié)構(gòu)和漸滲。通過全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS），研究人員鑒定出一些數(shù)量性狀位點(diǎn)（QTL）和基因組區(qū)域，其中一些基因（如MYB108）與花瓣、柱頭、花萼及花芽顏色呈正相關(guān)。
該研究結(jié)果揭示了有花植物（特別是木本植物）馴化的遺傳基礎(chǔ)。
Fig. 1 Phylogenetic tree and ten representative traits of 348 mei accessions.
Fig. 3 Evolution of P. mume and Prunus.
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