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肝癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)之路:面臨的挑戰(zhàn)

作者:何明燕 夏景林

單位:復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院復(fù)旦大學(xué)肝癌研究所

目前肝癌的臨床管理主要包括對高危人群的定期監(jiān)測、早期發(fā)現(xiàn)、早期治療以及對肝癌患者的積極治療和隨訪。治療主要包括手術(shù)治療和局部治療。早期肝癌患者首選外科手術(shù)治療,術(shù)后5年生存率達(dá)50%~70%,但腫瘤復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移率也高達(dá)50%~80%。肝移植較肝葉切除具有復(fù)發(fā)率低及生存率高的優(yōu)點(diǎn),但供體短缺限制其在肝癌治療中的應(yīng)用。肝動脈化療栓塞、射頻微波、酒精局部注射、放療、中醫(yī)藥以及索拉菲尼是多數(shù)中晚期肝癌和肝癌術(shù)后復(fù)發(fā)患者的主要治療方式,對延緩肝癌進(jìn)展和延長生存期具有一定作用。隨著大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)為肝癌的臨床管理注入新鮮血液,為肝癌研究提供新的思路。其旨在通過人類基因組數(shù)據(jù)及相關(guān)大數(shù)據(jù)平臺對疾病內(nèi)在生物學(xué)特征和臨床表型等進(jìn)行整合,并依據(jù)整合結(jié)果對疾病亞型進(jìn)行分子水平的細(xì)分,從而提供精準(zhǔn)的診療方案,且在評估療效和預(yù)測預(yù)后等方面具有一定的優(yōu)勢。但由于肝癌本身的基因組不穩(wěn)定及高度異質(zhì)性導(dǎo)致肝癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)實(shí)踐之路困難重重。本文通過闡述肝癌基因組不穩(wěn)定及其異質(zhì)性,探討肝癌液體活檢及靶向藥物研發(fā)所面臨的挑戰(zhàn)。

1.基因組不穩(wěn)定性

基因組不穩(wěn)定是癌癥發(fā)生的重要分子基礎(chǔ),有2種表現(xiàn)形式:有絲分裂缺陷相關(guān)染色體不穩(wěn)定性(CIN)及DNA代謝缺陷相關(guān)微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MIN)。一般來說,CIN較MIN預(yù)后更差,因?yàn)镃IN更易引起基因組的嚴(yán)重突變,如染色體碎裂、拷貝數(shù)異常等。多數(shù)肝癌細(xì)胞存在明顯的基因組不穩(wěn)定性,且以CIN較為常見。染色體臂的缺失突變以及染色體臂獲得性突變,在肝癌中多次被報(bào)道。其中,4q及16q的缺失在乙肝相關(guān)性肝癌中發(fā)生頻率較高,染色體臂1p缺失在分化較好的肝癌細(xì)胞或不典型增生結(jié)節(jié)以及肝硬化結(jié)節(jié)中檢出率較高。CIN變異小鼠模型也證實(shí),高程度CIN變異具有自發(fā)腫瘤傾向,如CIN相關(guān)基因Sgo1缺陷的小鼠易自發(fā)肝癌。

當(dāng)代腫瘤學(xué)研究和基因深度測序等方法已確定多種癌癥相關(guān)基因突變和表觀遺傳學(xué)錯(cuò)配與癌癥基因組不穩(wěn)定性密切相關(guān)。在肝癌細(xì)胞中,這些基因主要涉及以下幾條信號通路:(1)原癌基因信號通路;(2)DNA損傷修復(fù)信號通路;(3)氧化應(yīng)激途徑;(4)細(xì)胞周期;(5)免疫調(diào)節(jié)信號通路。其中,原癌基因信號通路異常主要發(fā)生于Wnt、Smad及表皮生長因子受體(EGFR)等信號通路相關(guān)基因,如Wnt通路中β-catenin基因CTNNB1(20%~40%)、Axin1(9%~13%)和Zic3(5%)基因,Smad通路中Wwp1(9%)基因,以及EGFR通路中Errfi1(5%)基因等。肝癌中這些基因通常發(fā)生功能獲得型突變,導(dǎo)致原癌基因信號通路活化,進(jìn)而引起低級別CIN和基因組不穩(wěn)定。肝癌中DNA損傷修復(fù)信號通路突變以TP53基因?yàn)榇恚s35%~50%肝癌中含TP53突變。該基因在維持基因組穩(wěn)定性中發(fā)揮重要作用,其功能缺失可引起中心體擴(kuò)增、異倍體細(xì)胞繁殖以及染色體不穩(wěn)定等,尤其當(dāng)TP53突變合并抑癌蛋白pRb功能缺陷或紡錘體檢測點(diǎn)缺陷時(shí),更易引起高級別CIN和基因組不穩(wěn)定。其他肝癌細(xì)胞中常見突變基因還包括CDKN2A、TERT和MLL2等,參與細(xì)胞周期、氧化應(yīng)激、免疫炎性反應(yīng)等信號通路。除癌癥相關(guān)基因異常外,乙型肝炎病毒(HBV)及丙型肝炎病毒(HCV)感染也是誘導(dǎo)基因組不穩(wěn)定性發(fā)生的重要原因。其主要與以下3種途徑相關(guān):(1)病毒蛋白直接干擾有絲分裂過程,引起CIN;(2)病毒基因整合至宿主基因組的特異位點(diǎn),影響癌癥相關(guān)基因的表達(dá)和功能;(3)持續(xù)性慢性炎性反應(yīng)進(jìn)一步加重肝癌基因組不穩(wěn)定性?;蚪M不穩(wěn)定是肝癌高度異質(zhì)性、治療抵抗和腫瘤復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的重要分子基礎(chǔ),同時(shí)增加肝癌精準(zhǔn)病理診斷分型和精準(zhǔn)治療的難度。

2.肝癌異質(zhì)性

肝癌異質(zhì)性是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究的重要內(nèi)容之一。從病因上看,多數(shù)肝細(xì)胞性肝癌的發(fā)生與慢性肝病(包括肝炎病毒感染、酒精相關(guān)肝炎、非酒精性脂肪肝)、致癌物暴露(如黃曲霉素等)和遺傳等因素有關(guān)。慢性肝損傷導(dǎo)致肝細(xì)胞死亡、氧化應(yīng)激、炎性反應(yīng)、再生和纖維化等,在此不良環(huán)境中,引起DNA損傷,驅(qū)動基因發(fā)生突變,環(huán)境抵抗的優(yōu)勢細(xì)胞克隆亞型存活并擴(kuò)增,從而導(dǎo)致肝癌的發(fā)生。致病因素多變是不同患者間肝癌異質(zhì)性的基礎(chǔ)。在肝癌進(jìn)展過程中,微環(huán)境的變化進(jìn)一步促進(jìn)肝癌細(xì)胞發(fā)生變異,壓力選擇下,產(chǎn)生更多克隆亞型,導(dǎo)致肝細(xì)胞性肝癌在基因組學(xué)、形態(tài)學(xué)和腫瘤進(jìn)展征象等方面均表現(xiàn)出高度異質(zhì)性。因此,肝癌異質(zhì)性包括時(shí)間和空間異質(zhì)性,時(shí)間異質(zhì)性是指在肝癌進(jìn)展過程中不同階段異質(zhì)性的逐漸增加,空間異質(zhì)性表現(xiàn)在肝癌內(nèi)部不同區(qū)域的腫瘤細(xì)胞存在不同的特征以及肝癌患者間的腫瘤生物學(xué)行為差異。

肝癌細(xì)胞基因組不穩(wěn)定性是肝癌具有高度異質(zhì)性的重要原因。不同于其他惡性腫瘤如乳腺癌或肺癌等具有多個(gè)決定腫瘤行為的遺傳變異標(biāo)志分子,肝癌細(xì)胞基因變異譜范圍廣,缺乏明確的遺傳變異特征。COSMIC數(shù)據(jù)庫提供的肝癌組織高頻突變基因如圖1所示,除TERT、TP53和CTNNB1突變頻率較高外,其他基因的突變率相對較低,均<10%。肝癌組織中甲基化異?;蛞寻l(fā)現(xiàn)多達(dá)數(shù)千個(gè),且在肝癌發(fā)生早期甚至在肝細(xì)胞不典型增生時(shí)期,DNA甲基化異常即可出現(xiàn),并隨著肝癌發(fā)展和異質(zhì)性增加,DNA甲基化異常程度也進(jìn)一步增加。突變基因及表觀遺傳變異基因的數(shù)目之多、范圍之廣增加了肝癌精準(zhǔn)分子病理診斷的復(fù)雜性,提升了靶向治療研究的難度,是肝癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究面臨的最大挑戰(zhàn)。

3.肝癌液體活檢的難度

液體活檢是指檢測血液或體液分泌物中的腫瘤相關(guān)分子標(biāo)志。目前研究較多的檢測內(nèi)容包括循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)及循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)。ctDNA及CTCs來源于原發(fā)腫瘤DNA或腫瘤細(xì)胞的釋放入血,因此能反映原發(fā)腫瘤的情況。與傳統(tǒng)組織病理活檢比較,液體活檢具有非侵入性、易操作性和可動態(tài)監(jiān)測等優(yōu)點(diǎn),克服了空間和時(shí)間異質(zhì)性的極限。可以通過檢測ctDNA及CTCs的分子特征分析癌癥的基因組信息,對癌癥進(jìn)行精準(zhǔn)的分子病理診斷,并提供靶向治療指導(dǎo)。液體活檢的連續(xù)取樣功能有助于肝癌高危人群的早期診斷,治療反應(yīng)的實(shí)時(shí)監(jiān)測,耐藥評估,以及提前預(yù)測腫瘤的轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)。如TP53基因突變是肝癌組織中最常見的突變,249T位點(diǎn)是TP53基因突變熱點(diǎn),該突變已證實(shí)能在肝癌患者外周循環(huán)和尿液DNA中檢測到。研究顯示,在嚴(yán)重的肝硬化患者外周循環(huán)DNA中也能檢測到TP53249T突變,肝硬化是肝癌的癌前病變。這項(xiàng)結(jié)果提示,TP53249T突變可能在肝癌發(fā)生早期或癌前病變階段就已出現(xiàn)并釋放至外周循環(huán)中,進(jìn)一步研究有望對這部分ctDNA檢測陽性(TP53249T突變)的肝硬化患者進(jìn)行更為密切的影像學(xué)及甲胎蛋白隨訪,以期對早期病灶進(jìn)行積極處理。盡管液體活檢顯現(xiàn)出巨大優(yōu)勢,但由于肝癌異質(zhì)性的存在,液體活檢也僅能反映部分原發(fā)腫瘤的情況,且肝癌本身缺乏明確的遺傳變異標(biāo)志性分子,患者循環(huán)中CTCs及ctDNA的濃度低,這些因素限制了液體活檢在肝癌臨床上的應(yīng)用。以TP53249T突變?yōu)槔?,ctDNA中發(fā)現(xiàn)該突變也與結(jié)腸癌和乳腺癌等其他類型腫瘤有關(guān),因此,循環(huán)DNA中發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)突變表明,患者體內(nèi)可能有腫瘤存在,但特異性太低,對肝癌的診斷僅具有提示意義。

4.靶向藥物研發(fā)的困境

肝癌對傳統(tǒng)化療藥物不敏感。索拉菲尼是目前唯一被FDA批準(zhǔn)用于晚期肝細(xì)胞性肝癌治療的分子靶向藥物。該藥物是一個(gè)多激酶抑制劑,其作用靶點(diǎn)主要包括血管內(nèi)皮生長因子受體(VEGFR)、血小板源生長因子受體(PDGFR)和KIT等。但索拉菲尼的臨床試驗(yàn)結(jié)果不盡如人意,與安慰劑比較,其僅能延長晚期肝細(xì)胞癌患者2~3個(gè)月的生存期。且在索拉菲尼治療過程中,部分患者一開始對治療有反應(yīng)但很快產(chǎn)生耐藥,而對索拉菲尼治療失敗的患者進(jìn)行二線藥物的臨床試驗(yàn)也多以失敗告終。

肝癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究的重要內(nèi)容之一是根據(jù)基因和表觀特征將異質(zhì)性的肝癌細(xì)分成不同亞型,并制定精準(zhǔn)的治療方案。隨著腫瘤靶向藥物研究的深入,其他類型腫瘤信號通路抑制劑治療肝癌的臨床試驗(yàn)相繼展開,如抗血管生成分子制劑、c-Met抑制劑、mTOR抑制劑、MEK抑制劑和免疫調(diào)節(jié)劑等。一項(xiàng)MEK抑制劑聯(lián)合索拉菲尼治療中晚期肝癌的Ⅱ期臨床試驗(yàn)結(jié)果顯示,兩藥聯(lián)用與單用索拉菲尼比較并不能延長肝癌患者總生存期,但4例(4/69)肝癌患者ctDNA中存在KRAS、NRAS突變,其中3例經(jīng)refametinib治療后腫瘤得到明顯緩解,提示依據(jù)精準(zhǔn)的肝癌分子遺傳學(xué)分型進(jìn)行臨床試驗(yàn),盡量減少不同肝癌患者之間的異質(zhì)性,可提高精準(zhǔn)治療療效,有望促進(jìn)靶向制劑的研發(fā)效率。然而,肝癌具有高度異質(zhì)性,目前未發(fā)現(xiàn)明確的標(biāo)志性遺傳變異分子,TERT、TP53和CTNNB1等基因突變,盡管在肝癌中已被證實(shí)為高頻突變基因,但仍未明確其在肝癌進(jìn)展過程中發(fā)揮“驅(qū)動基因”還是“路過基因”作用,限制了肝癌精準(zhǔn)靶向藥物臨床試驗(yàn)的開展。

5.結(jié)語

肝癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究面臨最大的挑戰(zhàn)是肝癌基因組不穩(wěn)定性,導(dǎo)致肝癌的高度異質(zhì)性。由于肝癌缺乏明確的生物標(biāo)志基因,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)很難對肝癌進(jìn)行分子病理水平的精準(zhǔn)診斷和治療,從而影響肝癌液體活檢技術(shù)的應(yīng)用和分子靶向藥物的研發(fā)。因此肝癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究任重而道遠(yuǎn)。但隨著大數(shù)據(jù)計(jì)算工具和云計(jì)算等手段的不斷進(jìn)步,對肝癌基因分子水平異質(zhì)性的認(rèn)識程度也會日益增加,未來肝癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)在肝癌臨床管理中的重要性也將日益突出。

節(jié)選自:《實(shí)用腫瘤雜志》2018年第33卷第1期

腫瘤醫(yī)學(xué)論壇綜合整理

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