隨著二代測序技術(shù)的進(jìn)步以及對單基因遺傳病認(rèn)識的加深，遺傳病基因檢測在疾病診斷中扮演著越來越重要的角色。對于非專業(yè)人士如何看懂遺傳基因檢測報(bào)告呢？希望這篇內(nèi)容能讓大家對報(bào)告有初步了解。
陽性報(bào)告示例
陰性報(bào)告示例
報(bào)告主體內(nèi)容包含：
基本信息：受檢人的個(gè)人信息和送檢信息，包括姓名、年齡、性別、門診/住院號、簡要病史、送檢科室、送檢醫(yī)師、檢測項(xiàng)目、送檢時(shí)間、樣本類型、樣本編號等。
檢測結(jié)果：陽性結(jié)果會列出檢測到的基因變異相關(guān)信息，陰性結(jié)果即為未檢測到。
結(jié)果說明：對檢測到的基因變異的說明和致病性評級。
分析意見：實(shí)驗(yàn)室針對檢測結(jié)果給出的初步結(jié)論和建議。
疾病信息：對于檢出疾病臨床特征的簡要描述。
對于陽性結(jié)果，列表給出的信息有基因名稱、染色體位置、變異信息、變異致病評級、頻率、受檢者及其父母的合子類型、對應(yīng)疾病、遺傳方式。
基因：發(fā)生變異的基因名稱，基因是帶有遺傳信息的DNA片段。
染色體位置：根據(jù)GRCh37/hg19基因組版本對每個(gè)位置的編號，也是變異的絕對位置。具體寫法為：chr染色體號:位置。
轉(zhuǎn)錄本：轉(zhuǎn)錄本是有一個(gè)基因通過轉(zhuǎn)錄形成的一種或多種可供編碼蛋白質(zhì)的成熟的mRNA。由于不同轉(zhuǎn)錄本中對同一個(gè)位點(diǎn)的描述（包括核苷酸、氨基酸的位置）是不同的，所以會在報(bào)告中標(biāo)注出核苷酸、氨基酸位置對應(yīng)的是具體哪個(gè)轉(zhuǎn)錄本，方便變異位點(diǎn)的查找及核對。
外顯子/內(nèi)含子：基因由多個(gè)外顯子內(nèi)含子組成，只有外顯子序列能夠最終表達(dá)成蛋白質(zhì)。exon代表外顯子，IVS代表內(nèi)含子，后面的編號是為了彼此區(qū)分和方便定位。
核苷酸改變/氨基酸改變：根據(jù)HGVS規(guī)則命名的核苷酸變化/氨基酸變化。核苷酸有A、T、C、G四種，原本有固定的排列順序，如果第211號位置發(fā)生了突變，原本的A被C取代了，可以寫作：c.211A>C。相應(yīng)的氨基酸有20種，也有固定的排列，如果第78號位置絲氨酸（S）被酪氨酸（Y）取代了，可以寫作：p.S78Y。
這里只舉例了錯義突變，還有其他的突變類型：無義突變、移碼突變、整碼突變、剪接位點(diǎn)突變，想要詳細(xì)了解可查看往期文章：話基因，聊遺傳-番外篇（一）。
頻率：指該位點(diǎn)在正常人數(shù)據(jù)庫中的頻率。通俗來說，正常人攜帶的頻率越高，致病的可能性就越小。
致病性分析：指該變異根據(jù)ACMG指南*評級以后的致病性，ACMG指南根據(jù)不同證據(jù)，將變異劃分為5個(gè)等級，分別為致病（Pathogenic）、可能致?。↙ikely Pathogenic）、意義未明（Uncertain）、可能良性（Likely Benign）和良性（Benign）。
如果結(jié)果是Pathogenic或Likely Pathogenic，那么變異是致病性的可能性比較大；有時(shí)也會有變異為Uncertain，目前來看致病性證據(jù)不足，但是不能排除，需要根據(jù)臨床進(jìn)一步核實(shí)，Likely Benign或Benign的位點(diǎn)一般不會放到報(bào)告中。
*注：ACMG指南為美國權(quán)威機(jī)構(gòu)——美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會（ACMG）在2015年編寫和發(fā)布的《ACMG遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南》。該指南是多學(xué)科專家基于大量臨床案例和豐富經(jīng)驗(yàn)建立的，可以為分析受檢者位點(diǎn)的致病性提供一定參考，但考慮到每個(gè)檢測者的情況不同，所以不能作為最終臨床判定致病性的結(jié)論，需要同時(shí)結(jié)合受檢者的臨床癥狀、遺傳方式、家族史等方面綜合判斷。
合子類型：由于人類染色體為二倍體，也就是說攜帶的每個(gè)基因都有兩份（性染色體除外），他們彼此間稱作等位基因。
（1）如果兩個(gè)等位基因相同位置存在相同變異，稱為純合；
（2）如果兩個(gè)等位基因都發(fā)生了變異但在不同的位置，稱為復(fù)合雜合；
（3）如果兩個(gè)等位基因只有一個(gè)發(fā)生了變異，稱為雜合。
（4）半合子是一種特殊情況，如男性的X染色體，沒有等位基因，當(dāng)男性X染色體基因發(fā)生改變稱為半合子變異。
（5）野生型即為無基因變異。
疾病名稱：檢測到的基因所對應(yīng)的臨床疾病，常常1個(gè)基因會對應(yīng)幾種疾病，1種疾病也會關(guān)聯(lián)不同基因?？梢愿鶕?jù)疾病后括號內(nèi)的OMIM編號查詢更多的疾病信息（OMIM為在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫，地址：https://omim.org/）。
遺傳方式：常見的是常染色顯性遺傳、常染色體隱性遺傳、X連鎖顯性遺傳和X連鎖隱性遺傳等。
（1）常染色體顯性遺傳（AD）：雜合變異可導(dǎo)致發(fā)病?；颊吒改钙渲兄煌ǔＪ腔颊撸掖蠖酁殡s合體，患者的同胞約有50%概率患病，且男女發(fā)病機(jī)會均等，患者的子女都有50%概率的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。雙親無病時(shí)，子女患病風(fēng)險(xiǎn)低，但也存在新發(fā)變異。
（2）常染色體隱性遺傳（AR）：純合或復(fù)合雜合變異可導(dǎo)致發(fā)病。在系譜中散發(fā)或隔代出現(xiàn)，患者是致病基因的純合或復(fù)合雜合體，其父母不一定發(fā)病，但都是致病基因的攜帶者，患者的同胞約有25%概率患病，且男女發(fā)病機(jī)會均等。近親結(jié)婚時(shí)，后代的發(fā)病率明顯升高。
（3）X連鎖顯性遺傳（XLD）：女性雜合可導(dǎo)致發(fā)病，男性半合子導(dǎo)致發(fā)病。男性的發(fā)病率遠(yuǎn)高于女性，女性雜合子通常不發(fā)病，但由于受X失活的影響，相當(dāng)部分女性雜合子可能表現(xiàn)出不同程度的表型。男性患者的致病基因只通過女兒往下傳遞，不存在傳遞給兒子致病基因的現(xiàn)象，兒子的致病基因只能來自于母親。
（4）X連鎖隱性遺傳（XLR）：男性半合子發(fā)病。類似于AD遺傳模式，發(fā)病概率比較高，女性雜合子中的后代有50%概率患病，女性患者往往多于男性患者，但女性患者的表型較男性更輕。
對于陰性結(jié)果，也并不能完全排除受檢者患遺傳性疾病的可能，原因有
（1）檢測方法的局限性，包括基因的特殊結(jié)構(gòu)、高度同源的假基因、捕獲-測序技術(shù)不能保證覆蓋100%的外顯子區(qū)域等；
（2）變異解讀需要依據(jù)醫(yī)生或患者提供的臨床信息進(jìn)行分析，如受檢者年齡小，未表現(xiàn)出典型的臨床癥狀；
（3）同時(shí)受制于文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫的及時(shí)性、疾病復(fù)雜程度，以及疾病致病基因科學(xué)研究發(fā)展的限制等。
檢測說明：主要對基因檢測進(jìn)行說明，包括檢測方法的介紹、檢測范圍、局限性和實(shí)驗(yàn)室聲明等。
檢測說明頁示例
附錄：僅供臨床醫(yī)師參考，包括
（1）與受檢者癥狀可能相關(guān)，但致病性不明確的變異；
（2）生物學(xué)致病等級較高，但是遺傳方式不符或與當(dāng)前臨床癥狀不相關(guān)的變異
附錄頁示例
通過以上的介紹，您是否對報(bào)告中檢出結(jié)果有一定的了解呢，但是最終致病性的判斷還是需要臨床醫(yī)生來下結(jié)論，建議大家在收到報(bào)告后第一時(shí)間到醫(yī)生處復(fù)診，請臨床醫(yī)生綜合診斷。
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