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膿毒癥生物標(biāo)志物:新技術(shù)的最新綜述


翻譯:梁江洪  校對(duì):黎一蓉  審核:季春蓮

摘要

膿毒癥雖然很早就被認(rèn)識(shí)到,但仍然對(duì)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)構(gòu)成重大挑戰(zhàn)。最大的挑戰(zhàn)之一在于其觸發(fā)因素的異質(zhì)性、多變的臨床表現(xiàn),以及其迅速的進(jìn)展和致死性。因此,迫切需要能夠快速、準(zhǔn)確地檢測(cè)膿毒癥發(fā)生并預(yù)測(cè)其治療反應(yīng)的生物標(biāo)志物。在這篇綜述中,我們將簡(jiǎn)要描述目前膿毒癥的共識(shí)定義和生物標(biāo)志物的理想特征。然后,我們將深入研究目前可用的和正在開發(fā)的病原體、宿主及其相互作用的標(biāo)志物,這些標(biāo)志物共同構(gòu)成膿毒癥。

關(guān)鍵詞:膿毒癥,重癥監(jiān)護(hù),感染,休克,決策,重癥監(jiān)護(hù)病房(ICU)

介紹

膿毒癥雖然很早就被認(rèn)識(shí)到,但仍然對(duì)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)構(gòu)成重大挑戰(zhàn)。2017年,全球疾病負(fù)擔(dān)研究報(bào)告稱,每年有4890萬膿毒癥病例并有1100萬膿毒癥相關(guān)死亡,占全球死亡人數(shù)的近20%。在美國(guó),每年有170萬例膿毒癥病例和27萬例相關(guān)死亡,使其成為國(guó)內(nèi)醫(yī)院死亡的主要原因之一。在成年膿毒癥幸存者中,有1/3在一年內(nèi)死亡,1/6的人經(jīng)歷了嚴(yán)重的長(zhǎng)期患病和反復(fù)住院治療。冠狀病毒大流行加劇使這些數(shù)據(jù)明顯升高——導(dǎo)致全球680多萬人死亡,其中美國(guó)死亡110萬人——突顯了我們對(duì)新型病原體和膿毒癥的脆弱性。

為什么膿毒癥如此難以控制?最大的挑戰(zhàn)之一在于病原體的異質(zhì)性及其多變的臨床表現(xiàn)。膿毒癥是一種綜合征,而不是一種統(tǒng)一的疾病。它是多種病原體和不同宿主環(huán)境相互作用的最終走向(仍未被完全理解),因此很難應(yīng)用一刀切的診斷和治療方法。此外,膿毒癥通常進(jìn)展迅速且致命,這更增加了不明確的緊迫性。因此,迫切需要能夠快速準(zhǔn)確地檢測(cè)到膿毒癥發(fā)作并預(yù)測(cè)其治療反應(yīng)的生物標(biāo)志物。

在這篇綜述中,我們將簡(jiǎn)要描述目前膿毒癥的定義和生物標(biāo)志物的理想特征。然后,我們將深入研究目前可用的和正在開發(fā)的膿毒癥生物標(biāo)志物。

膿毒癥定義

自從公元前8世紀(jì)Homer創(chuàng)造了膿毒癥這個(gè)詞以來,它已經(jīng)歷了多次迭代。膿毒癥的現(xiàn)代術(shù)語來自1991年國(guó)際共識(shí)會(huì)議:嚴(yán)重膿毒癥定義的區(qū)別(由重癥醫(yī)學(xué)會(huì)、歐洲重癥醫(yī)學(xué)會(huì)、美國(guó)胸科醫(yī)師學(xué)會(huì)、美國(guó)胸科學(xué)會(huì)和外科感染學(xué)會(huì)主辦)。該會(huì)議的目標(biāo)是創(chuàng)建標(biāo)準(zhǔn)化的定義和概念,使臨床醫(yī)生能夠更好地檢測(cè)膿毒癥,從而更好地治療危重患者(以及幫助研究人員追蹤膿毒癥)。會(huì)議委員會(huì)介紹了全身性炎癥反應(yīng)綜合征(SIRS)標(biāo)準(zhǔn),它描述了呼吸頻率、心率、體溫和白細(xì)胞計(jì)數(shù)的紊亂,預(yù)示著對(duì)感染或其他身體損傷的強(qiáng)烈炎癥反應(yīng)。因此,指南至此將膿毒癥定義為懷疑或證實(shí)感染的SIRS。他們進(jìn)一步將嚴(yán)重膿毒癥定義為伴有器官功能障礙的膿毒癥,并將膿毒癥休克定義為“其他原因無法解釋的以持續(xù)低血壓為特征的急性循環(huán)衰竭”。

1991年的共識(shí)會(huì)議有助于提高對(duì)膿毒癥的認(rèn)識(shí),并為臨床醫(yī)生制定了概念框架和便于使用的臨床標(biāo)準(zhǔn)。然而,這些標(biāo)準(zhǔn)經(jīng)常被批評(píng)為局限和不具體。2001年舉行了第二次國(guó)際會(huì)議,擴(kuò)大了先前的指導(dǎo)方針。他們建議不要僅僅依賴SIRS標(biāo)準(zhǔn)作為診斷點(diǎn),并擴(kuò)大了“膿毒癥的體征和癥狀”這一短語,以包括更廣泛的臨床癥狀和體格檢查結(jié)果,如精神狀態(tài)改變、尿少、毛細(xì)血管再充盈減慢、高血糖或低血糖。

2016年,美國(guó)危重病醫(yī)學(xué)會(huì)和歐洲危重病醫(yī)學(xué)會(huì)(SCCM/ESICM)發(fā)布了膿毒癥和膿毒性休克的第三個(gè)國(guó)際共識(shí)定義(稱為Sepsis-3.0)。工作組的目標(biāo)是創(chuàng)建定義,以反映我們對(duì)膿毒癥病理生物學(xué)的最新理解。因此,膿毒癥目前被定義為“由宿主對(duì)感染反應(yīng)失調(diào)引起的威脅生命的器官功能障礙?!薄?/p>

目前的定義有三個(gè)核心組成部分:器官功能障礙、宿主失調(diào)和感染。雖然這些條件可能看起來很明顯,但它們并不容易識(shí)別。器官功能障礙可能是最直接的因素;Sepsis-3.0指南推薦使用順序器官衰竭評(píng)分(SOFA)來量化終末器官損傷,評(píng)分變化2+表示危及生命的功能障礙。然而,其他診斷成分的檢測(cè)仍然存在問題。正如將在這篇綜述文章中討論的那樣,目前用于鑒定病原體的測(cè)試是耗時(shí)且不敏感的,并且由于我們對(duì)這種復(fù)雜綜合征的了解仍然有限,用于鑒定宿主反應(yīng)失調(diào)的檢測(cè)很少。然而,我們可以越來越肯定地說,沒有單一的生物標(biāo)志物可以概括膿毒癥,因此需要新的方法來優(yōu)化診斷和治療。

生物標(biāo)志物的定義:

什么是理想的生物標(biāo)志物?

生物標(biāo)志物(biomarker)有可客觀測(cè)量的特點(diǎn),可以作為正常生物過程、致病過程或?qū)χ委煾深A(yù)的藥理學(xué)反應(yīng)的指標(biāo)。被測(cè)量的特征可以有很大的不同,從簡(jiǎn)單的臨床表現(xiàn),如生命體征,到X射線檢查結(jié)果,再到血漿分子。生物標(biāo)志物的用途也有很大的不同。美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院生物標(biāo)志物定義工作組概述了生物標(biāo)志物在醫(yī)學(xué)中的基本用途,包括(但不限于)診斷疾病或病癥的存在,監(jiān)測(cè)疾病或病癥的進(jìn)展,評(píng)估治療或藥效學(xué)反應(yīng),預(yù)測(cè)或風(fēng)險(xiǎn)分層患者預(yù)后,以及預(yù)測(cè)對(duì)干預(yù)措施有不同反應(yīng)的患者亞組。

理想的生物標(biāo)志物應(yīng)該是快速的、可重復(fù)的、具有成本效益的和可鑒別的。本綜述的重點(diǎn)將放在生物標(biāo)志物的兩個(gè)方面(1)診斷病原體的存在,(2)診斷宿主反應(yīng)的失調(diào),以及預(yù)測(cè)膿毒癥預(yù)后。

病原體生物標(biāo)志物

微生物培養(yǎng)長(zhǎng)期以來一直是病原體檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn)?,F(xiàn)在使用的方法與Robert Koch及其同事在19世紀(jì)開發(fā)的方法(在培養(yǎng)基中培養(yǎng)微生物,然后測(cè)試它們對(duì)抗菌藥物的反應(yīng))沒有太大區(qū)別。然而,這種方法有幾個(gè)缺點(diǎn),特別是在處理危重患者時(shí)。最明顯的缺點(diǎn)是培養(yǎng)周期。標(biāo)準(zhǔn)細(xì)菌培養(yǎng)至少需要24到72小時(shí)微生物才能生長(zhǎng),然后再增加24到48小時(shí)才能得到抗菌藥物敏感性信息。在處理特殊的細(xì)菌或其他微生物(如病毒和真菌)時(shí),這個(gè)時(shí)間會(huì)延長(zhǎng)得更多。還有技術(shù)方面的考慮;培養(yǎng)通常需要大量的標(biāo)本、無菌程序以避免污染,并反復(fù)的檢測(cè)。

最后,膿毒癥需要得到及時(shí)治療。數(shù)據(jù)顯示,膿毒癥患者首次給藥延遲會(huì)增加住院死亡風(fēng)險(xiǎn),并且每延遲1小時(shí)與死亡風(fēng)險(xiǎn)之間存在線性關(guān)系。各種社會(huì)指南和質(zhì)量改進(jìn)措施要求在首次懷疑膿毒癥時(shí)給予抗菌藥物,優(yōu)先于并經(jīng)常在血液培養(yǎng)之前給予抗菌藥物。然而,不加區(qū)分地使用抗菌藥物也有其自身風(fēng)險(xiǎn),包括抗菌藥物選擇不恰當(dāng)、隨后的培養(yǎng)結(jié)果受影響以及多重耐藥微生物的出現(xiàn)。

因此,開發(fā)微生物快速檢測(cè)標(biāo)志物已成為人們關(guān)注和研究的熱點(diǎn)。這些新測(cè)試技術(shù)可以更高效:具體來說,是(1)核酸擴(kuò)增和(2)宏基因組學(xué)分析。

核酸擴(kuò)增技術(shù):基于核酸擴(kuò)增的檢測(cè)(NAATs)技術(shù)是通過尋找病原體特異性基因序列(DNA或RNA)然后將其擴(kuò)增到可測(cè)量的水平來識(shí)別病原體。具體而言,多重定量實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)方法是利用熒光探針測(cè)量病原體DNA/RNA的存在并定量測(cè)其數(shù)量。這些檢測(cè)還可以確定與抗菌藥物耐藥性相關(guān)的病原體基因,例如賦予金黃色葡萄球菌耐甲氧西林的mecA基因。這些檢測(cè)的周期為數(shù)小時(shí),可以直接對(duì)患者全血樣本進(jìn)行檢測(cè),而且樣本量比傳統(tǒng)的血液培養(yǎng)方法要小得多。

目前有兩種CE認(rèn)證的NAATs(“Conformité Européene,”即符合歐盟標(biāo)準(zhǔn))是LightCycler SeptiFast Test(Roche診斷)和Magicplex Sepsis Real-Time Test(Seegene)。LightCycler SeptiFast Test可檢測(cè)19種細(xì)菌、5種念珠菌和煙曲霉,以及耐藥標(biāo)記物mecA。它的周期為6小時(shí),只需要1.5毫升患者血液。Magicplex Sepsis Real-Time Test可檢測(cè)90多種病原體(73種革蘭氏陽性菌,12種革蘭氏陰性菌,6種真菌),以及耐藥標(biāo)記物mecA, vanA和vanB。它的周期為8至10小時(shí),同樣需要最少的血液樣本量來處理。

然而,這兩種測(cè)試都存在靈敏度和特異性較差的問題。對(duì)于LightCycler SeptiFast Test,一項(xiàng)對(duì)41項(xiàng)研究的薈萃分析(與血液培養(yǎng)相比,共10493項(xiàng)SeptiFast測(cè)試)報(bào)告了68%(95%置信區(qū)間(CI),63%-73%)的總敏感性和86%(95% CI,84%-89%)的特異性。另一項(xiàng)薈萃分析僅包括來自期刊出版物的數(shù)據(jù),結(jié)果略有改善:敏感性為75%(95% CI,65%-83%),特異性為92%(95% CI,90%-95%)。同樣,Magicplex Sepsis RT檢測(cè)的臨床研究也顯示出不同的測(cè)試性能,敏感性和特異性分別為29%至65%和66%至95%。因此,它們只能被推薦為常規(guī)培養(yǎng)有價(jià)值的輔助手段,特別是在患者可能在培養(yǎng)物收集之前已經(jīng)開始使用抗菌藥物的情況下。

基于T2磁共振(T2MR)的方法將PCR技術(shù)與微型磁共振技術(shù)相結(jié)合,進(jìn)一步提高了檢測(cè)的靈敏度和特異性。在T2MR檢測(cè)中,經(jīng)過PCR擴(kuò)增步驟后,通過雜交檢測(cè)擴(kuò)增的遺傳物質(zhì)與富含探針的超順磁性納米顆粒,從而在T2MR信號(hào)中引起可檢測(cè)到的大變化。目前有兩種FDA批準(zhǔn)和CE標(biāo)記的檢測(cè)可用。T2 Candida檢測(cè)(T2 Biosystems)可以鑒定出5種念珠菌,它們約占臨床念珠菌病例的95%。該方法具有良好的靈敏度和特異性,分別為89% ~ 91%和99%。T2Bacteria試驗(yàn)(T2 Biosystems)可鑒定6種常見細(xì)菌(糞腸球菌、金黃色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鮑曼不動(dòng)桿菌、銅綠假單胞菌、大腸桿菌)。結(jié)果表明,該方法的敏感性和特異性均達(dá)90%。與常規(guī)NAATs相比,這兩種檢測(cè)方法的周期更短,為3至5小時(shí)。然而,鑒于它們的病原體樣本有限,以及檢測(cè)抗菌藥物耐藥性的能力有限,因此臨床應(yīng)用范圍仍然很窄。

宏基因組技術(shù):宏基因組技術(shù)是指在不使用特定病原體引物的情況下對(duì)核酸進(jìn)行測(cè)序,而不是依賴于更通用的擴(kuò)增子(如細(xì)菌和真菌的16S和18S核糖體基因)或非靶向的下一代測(cè)序方法(NGS)。SepsiTest(Molzym)是一種CE標(biāo)記的可用測(cè)試,使用基于擴(kuò)增子的PCR和Sanger第一代測(cè)序。Sanger測(cè)序技術(shù)涉及單個(gè)病原體菌落的傳代培養(yǎng)和測(cè)序,這使得假陽性率低,但也降低了靈敏性。實(shí)際上,SepsiTest具有78%至92%的優(yōu)秀特異性,但變化更大的靈敏度為21%至87%。iDTECT Dx Blood檢測(cè)(PathoQuest)是唯一市售的NGS檢測(cè)。在一項(xiàng)針對(duì)疑似感染的免疫功能低下成年患者的多中心、前瞻性、概念驗(yàn)證研究中,該檢測(cè)方法檢測(cè)出臨床相關(guān)細(xì)菌或病毒感染的比例明顯高于傳統(tǒng)方法(即培養(yǎng)),陰性預(yù)測(cè)值為98.4%(95% CI,95.3%-100%)。

基于宏基因組學(xué)檢測(cè)技術(shù)的理論優(yōu)勢(shì)在于,任何病原體——細(xì)菌、病毒、真菌和寄生蟲——都可以在一次檢測(cè)中檢測(cè)到,以及任何已知的抗微生物藥物的耐藥性基因。然而,這也是一個(gè)缺點(diǎn),至少在現(xiàn)在。目前,這些測(cè)試對(duì)于什么構(gòu)成臨床顯著微生物負(fù)荷沒有一致的參考標(biāo)準(zhǔn)。這些測(cè)試可以檢測(cè)到微生物物質(zhì),而伴隨培養(yǎng)不能檢測(cè)到的微生物物質(zhì),而且濃度要小得多,這就提出了一個(gè)問題,即它們識(shí)別的是真正的感染,還是定植或污染。

總的來說,這些新興的病原體標(biāo)志物令人興奮,可能預(yù)示著一個(gè)更準(zhǔn)確、更快速的微生物檢測(cè)新時(shí)代。然而,它們?nèi)匀挥芯窒扌裕枰谖磥韼啄昙右越鉀Q。首先,仍需要大型多中心試驗(yàn)來證明其在日常臨床應(yīng)用中的有效性、益處和實(shí)用性。其次,檢測(cè)技術(shù)和具有臨床意義的閾值必須在各個(gè)實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化。第三,目前,許多技術(shù)涉及臨床實(shí)驗(yàn)室不容易獲得的生物信息學(xué)技能和專業(yè)知識(shí);這種差距促使外包和樣本轉(zhuǎn)移到其他機(jī)構(gòu),從而導(dǎo)致額外的時(shí)間延遲、成本和數(shù)據(jù)隱私問題。

宿主反應(yīng)的生物標(biāo)志物

關(guān)于膿毒癥,William Osler有一句名言:“除極少數(shù)情況外,病人都死于身體對(duì)感染的反應(yīng),而非感染本身?!币粋€(gè)多世紀(jì)以前,醫(yī)生就能識(shí)別膿毒癥的癥結(jié)所在,但我們?nèi)匀粵]有開發(fā)出足夠的宿主對(duì)膿毒癥反應(yīng)的標(biāo)志物。已有超過100種分子被提出作為宿主反應(yīng)失調(diào)的潛在標(biāo)記物,每種分子都試圖捕獲不同的反應(yīng)類型,從炎癥到免疫抑制再到內(nèi)皮功能障礙。

經(jīng)典生物標(biāo)志物的附加部分:最廣泛研究的感染性宿主反應(yīng)的經(jīng)典生物標(biāo)志物包括乳酸、CRP和降鈣素原。然而,鑒于膿毒癥病理生理學(xué)的復(fù)雜性和患者群體的異質(zhì)性,沒有單一的標(biāo)志物占主導(dǎo)地位。乳酸是Sepsis-3.0定義的膿毒癥休克的一部分,在這種情況下,需要足夠的容量復(fù)蘇,但血清水平仍大于2mmol/l才能診斷。然而乳酸是一種非特異性標(biāo)志物,可因其他休克狀態(tài)、非休克病因或清除不良而升高。同樣,CRP是肝臟對(duì)炎癥信號(hào)(如IL-6)而產(chǎn)生的急性期反應(yīng)物,也可因各種非感染性病因而升高。在一項(xiàng)對(duì)900名患者的大型薈萃分析中,發(fā)現(xiàn)CRP區(qū)分感染性和非感染性炎癥的敏感性僅為75%,特異性更低,為67%。降鈣素原是降鈣素的前體肽,在全身性炎癥狀態(tài)下會(huì)升高。在一項(xiàng)包含30多項(xiàng)研究的大型薈萃分析中,降鈣素原水平區(qū)分感染性炎癥和非感染性炎癥的總敏感性為77%,特異性為79%。

在過去的十年中,人們對(duì)利用“組學(xué)”方法對(duì)膿毒癥患者進(jìn)行識(shí)別和預(yù)后預(yù)測(cè)越來越感興趣。術(shù)語“組學(xué)”指的是綜合描述生物數(shù)據(jù)池的技術(shù);例如基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)。目的是利用這些大型數(shù)據(jù)集來識(shí)別隊(duì)列之間的重要差異,這可能會(huì)識(shí)別到失調(diào)的途徑并預(yù)測(cè)治療反應(yīng)。

基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué):鑒定和表征膿毒癥組學(xué)的第一個(gè)主要工作是使用微陣列平臺(tái)在兒科人群中完成的。2009年,Wong等人從美國(guó)多個(gè)醫(yī)療中心的重癥膿毒癥兒科人群和對(duì)照人群中收集了入院血液樣本。然后,他們利用微陣列技術(shù)比較兩個(gè)隊(duì)列之間的差異;該過程包括分離RNA,轉(zhuǎn)化為帶標(biāo)記的cDNA,最后將cDNA雜交以支持與免疫反應(yīng)和病原體特征相關(guān)的特定基因(微陣列芯片)對(duì)應(yīng)到的核苷酸序列排列表面。樣品與微陣列探針之間的雜交數(shù)量反映了特定mRNA物種的豐度。Wong等人首先確定了膿毒癥患者與非膿毒癥患者差異表達(dá)的基因列表(>6000個(gè)基因)。進(jìn)一步的非監(jiān)督聚類分析和主成分分析表明,在膿毒癥隊(duì)列中,出現(xiàn)了3個(gè)亞組,分別標(biāo)記為A、B和C亞組。他們發(fā)現(xiàn)亞組A與適應(yīng)性免疫反應(yīng)、糖皮質(zhì)激素受體和鋅代謝相關(guān)的基因相對(duì)下調(diào),以及有較高的疾病嚴(yán)重程度和死亡率相關(guān)。然后,他們通過開發(fā)100個(gè)基因的可視分類模型以簡(jiǎn)化微陣列,發(fā)現(xiàn)這樣可以更容易地用于臨床實(shí)踐。有趣的是,在一項(xiàng)針對(duì)300名兒科患者的前瞻性觀察研究中,他們發(fā)現(xiàn)被分為A亞組(基于入院血液采樣)的患者在接受類固醇治療時(shí)死亡率更高,這表明遺傳標(biāo)記與臨床相關(guān)表型之間存在潛在的聯(lián)系。

2016年,Davenport等人發(fā)表了他們關(guān)于成人膿毒癥人群的開創(chuàng)性工作。在研究中,他們招募了來自英國(guó)多家醫(yī)院的ICU成年社區(qū)獲得性肺炎膿毒癥患者。然后,對(duì)他們ICU入院時(shí)收集的血液樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組微陣列分析,并描述了2個(gè)轉(zhuǎn)錄組膿毒癥反應(yīng)特征,稱為SRS1和SRS2。SRS1組與相對(duì)免疫抑制、內(nèi)毒素耐受性和T細(xì)胞衰竭有關(guān)。SRS1組包括死亡率的臨床結(jié)果更差。這些研究人員隨后根據(jù)這些數(shù)據(jù)開發(fā)了一個(gè)七基因分類器模型,該模型在預(yù)測(cè)SRS分組方面表現(xiàn)良好。該方案在糞便性腹膜炎人群中得到了重復(fù),這意味著在不同感染源的膿毒癥人群中具有一定的普遍性。有趣的是,在糞便性腹膜炎研究中,作者觀察了多個(gè)時(shí)間點(diǎn)(而不是單一入院時(shí)間點(diǎn)),發(fā)現(xiàn)一些患者會(huì)在第1天和第5天之間“切換”SRS分組,這種演變的表型與臨床結(jié)果相對(duì)應(yīng)。

在一項(xiàng)有趣的“概念驗(yàn)證”研究中,Antcliffe等人重新分析了一小部分仍有可用血液樣本的VANISH(血管加壓素與去甲腎上腺素作為感染性休克的初始治療)試驗(yàn)參與者。該研究說明了分子標(biāo)志物為臨床實(shí)踐提供信息的潛力。他們將SRS分類應(yīng)用于這些受試者,以探索SRS與氫化可的松治療反應(yīng)之間的關(guān)系。令人驚訝的是,他們發(fā)現(xiàn)SRS2組——免疫抑制較少的組——在接受類固醇治療時(shí)的死亡率要高得多(42%對(duì)8%),而SRS1組的死亡率沒有顯著變化(33%對(duì)37%)。盡管結(jié)果是反直覺和發(fā)人深省的,但SRS2的小樣本量(n=55)和該人群的高死亡率可能表明一個(gè)不穩(wěn)定的效應(yīng)估計(jì)。

這種分子技是相當(dāng)新的,在相對(duì)較小的樣本量上進(jìn)行試驗(yàn),因此可能導(dǎo)致不穩(wěn)定或不可推廣的亞分組。Sweeney等人在2018年的研究中試圖解決這些問題,在該研究中使用了膿毒癥患者的多個(gè)公共轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集。他們利用非監(jiān)督聚類分析,從900名受試者的衍生隊(duì)列和600名患者組成的驗(yàn)證集中確定了33個(gè)轉(zhuǎn)錄本分類器。基于基因本體和通路分析,將他們的組標(biāo)記為炎癥性、適應(yīng)性和凝血性。這些分子特征符合相關(guān)的臨床特征。適應(yīng)性群集的死亡率最低,而炎癥性和凝血性群集的死亡率相似地升高。將這些亞組應(yīng)用于住院的COVID-19患者人群時(shí),進(jìn)一步驗(yàn)證了這些亞組,并再次證明適應(yīng)性組患者預(yù)后更好,炎癥性或凝血性組患者死亡率高。

隨著這些新的分子分析技術(shù)出現(xiàn),通過即時(shí)檢測(cè)對(duì)膿毒癥危重患者進(jìn)行表型分析的時(shí)代即將到來,但是關(guān)于膿毒癥患者的遺傳和蛋白質(zhì)組學(xué)特征的重要問題仍未得到解答:這些模式是先天的還是對(duì)病原體和其他條件的動(dòng)態(tài)反應(yīng)?它們是否有因果關(guān)系,是否可以使它們轉(zhuǎn)化以改善臨床結(jié)果,或者它們純粹是病原體-宿主反應(yīng)的反映?迄今為止,與免疫和凝血途徑相關(guān)的研究干預(yù)措施的試驗(yàn)沒有顯示出益處,有些甚至是有害的。

代謝組學(xué):代謝組學(xué)是“組學(xué)”技術(shù)在膿毒癥研究中的最新應(yīng)用。代謝組學(xué)是對(duì)代謝組的研究,是指由生物體中負(fù)責(zé)代謝過程的細(xì)胞產(chǎn)生的小分子(<1500 Da)的積累。因此,代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)提供了人體細(xì)胞代謝的“實(shí)時(shí)”快照,反過來又反映了身體的潛在生理狀態(tài)。此外,代謝物是細(xì)胞反應(yīng)的最下游副產(chǎn)物,包括先前的基因組,蛋白質(zhì)組學(xué)和環(huán)境效應(yīng),通常被稱為“基因型和表型之間的聯(lián)系”。

代謝組學(xué)研究一般有兩種方法,靶向和非靶向?qū)嶒?yàn),類似于上述病原體NAAT檢測(cè)技術(shù)。有靶向的實(shí)驗(yàn)尋找特定的預(yù)先確定的分子,并允許研究人員測(cè)試特定的假設(shè);然而,調(diào)查人員還必須依賴已有的數(shù)據(jù)和概念,因此受到當(dāng)前知識(shí)狀態(tài)的限制。非靶向?qū)嶒?yàn)著眼于“全球”代謝物,即在一個(gè)單一的無偏見實(shí)驗(yàn)中觀察數(shù)千種代謝物;然后,研究人員可以進(jìn)行探索性研究,比較不同人群之間的代謝譜,例如膿毒癥與非膿毒癥,或危重癥與病情穩(wěn)定的受試者。

代謝組學(xué)研究中使用了三種類型的分析技術(shù):核磁共振(NMR),氣相色譜-質(zhì)譜(GC-MS)和液相色譜-質(zhì)譜(LC-MS)。核磁共振分析測(cè)量來自原子同位素原子核的信號(hào),可以提供詳細(xì)的分子結(jié)構(gòu)信息。GC-MS和LC-MS測(cè)定的是液相或氣相色譜分離后帶電代謝物的質(zhì)荷比,可以提供更高的靈敏度和廣泛的代謝物檢測(cè)?;谶@些原因,GC-MS和LC-MS更常用于膿毒癥代謝組學(xué)的研究。

目前已發(fā)表的代謝組學(xué)研究主要集中在膿毒癥的診斷、預(yù)后和治療反應(yīng)上。值得注意的是,這些研究中許多是單中心、小樣本,因?yàn)檫@一領(lǐng)域仍然很新穎,需要特殊的專業(yè)知識(shí)和成本。

在膿毒癥診斷方面,大多數(shù)代謝組學(xué)研究都集中在膿毒癥與無菌SIRS的鑒別問題上。最常涉及的代謝途徑包括氨基酸和胺,脂肪酸相關(guān)代謝物以及磷脂。Neugebauer等人進(jìn)行了迄今為止規(guī)模最大的研究,對(duì)406例患者進(jìn)行了多區(qū)域回顧性分析(非感染性SIRS66例,肺炎100例,尿路感染112例,腹腔感染83例,血流感染45例)。研究人員在入院前24小時(shí)內(nèi)抽取患者的血液樣本,對(duì)其進(jìn)行靶向LC-MS,重點(diǎn)關(guān)注與氨基酸和胺,脂肪酸以及磷脂相關(guān)的途徑。他們發(fā)現(xiàn)膿毒癥組與非膿毒癥組相比,有26種代謝物存在顯著差異,包括3種脂酰肉堿、3種氨基酸、5種生物胺、8種甘油磷脂和7種鞘磷脂。然后,他們選擇具有最佳判別值的代謝物(在此具體是:鞘脂SM C 22:3和甘油磷脂lysoPCaC 24:0)進(jìn)行二元邏輯回歸,計(jì)算膿毒癥存在的預(yù)測(cè)概率。他們發(fā)現(xiàn),與CRP、降鈣素原或IL-6相比,SMC 22:3和lysoPCaC 24:0的組合具有更好的鑒別能力。使用SMC 22:3和lysoPCaC 24:0聯(lián)合標(biāo)志物診斷膿毒癥的敏感性為84.1%,特異性為85.7%。

在膿毒癥治療反應(yīng)方面,代謝組學(xué)可能為異質(zhì)性問題提供獨(dú)特的解決方案。在過去的十年中,“藥物代謝組學(xué)”的概念被引入,它指的是“基于干預(yù)前代謝物特征的數(shù)學(xué)模型預(yù)測(cè)藥物或異種藥物干預(yù)對(duì)個(gè)體的影響”。藥物代謝組學(xué)旨在根據(jù)個(gè)體的基線代謝譜確定最能預(yù)測(cè)治療反應(yīng)的代謝物(例如,臨床用藥或集束化管理)。此外,通過比較個(gè)體治療前和治療后的代謝譜,可以揭示新的藥物機(jī)制及其分子途徑。

Puskarich等人使用代謝組學(xué)數(shù)據(jù)來確定對(duì)左旋肉堿治療有更好反應(yīng)的膿毒癥亞組。他們使用了儲(chǔ)存/保存的預(yù)處理血清樣本(n=236),這些樣本來自于膿毒癥試驗(yàn)中左旋肉堿快速給藥(RACE)的患者,這是一項(xiàng)比較左旋肉堿治療與生理鹽水(安慰劑)早期治療感染性休克的II期隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)。左旋肉堿是一種有效的抗氧化劑,可以通過促進(jìn)脂肪酸和丙酮酸的能量利用來減輕膿毒癥的一些代謝影響,以及清除細(xì)胞溶膠的毒性作用。RACE試驗(yàn)在主要終點(diǎn)器官功能障礙(由SOFA評(píng)分的變化定義)和28天死亡率上均為陰性,但Puskarich等人假設(shè)這是由于異質(zhì)性,基線代謝物水平可以預(yù)測(cè)哪些患者對(duì)左旋肉堿有更好的反應(yīng)。他們利用一種半靶向代謝組學(xué)方法,結(jié)合了NMR和LC-MS平臺(tái)。首先,他們確定了與90天死亡率密切相關(guān)的代謝物,這些代謝物與治療分配有顯著的相互作用。接下來,他們確定了這些代謝物的水平,其最能預(yù)測(cè)哪些患者會(huì)從左旋肉堿中在死亡率上獲益。

值得注意的是,他們發(fā)現(xiàn)幾種代謝物對(duì)膿毒癥的死亡率具有預(yù)測(cè)價(jià)值,特別是與脂肪酸代謝有關(guān),從而強(qiáng)調(diào)了膿毒癥發(fā)病機(jī)制中固有的代謝紊亂。此外,他們發(fā)現(xiàn)乙酰肉堿(C2)基線水平大于或等于35μM的患者更有可能從左旋肉堿治療中獲益,定義為90天死亡率降低。Puskarich等人的工作為使用代謝組學(xué)策略豐富未來的臨床試驗(yàn)提供了證據(jù)。

結(jié)論

肯定會(huì)有越來越多的研究利用分子技術(shù)和大型生物學(xué)數(shù)據(jù)集,希望能夠識(shí)別膿毒癥宿主反應(yīng)的分子標(biāo)志物。這些都是令人興奮和有前途的策略。然而,它們還沒有為臨床“黃金時(shí)間”做好準(zhǔn)備。這些技術(shù)的方法學(xué)仍然存在合理性的問題,因?yàn)樗鼈內(nèi)栽诎l(fā)展,尚未在實(shí)驗(yàn)室之間標(biāo)準(zhǔn)化。此外,這些技術(shù)很多非常昂貴,有很長(zhǎng)的不切實(shí)際的實(shí)驗(yàn)周期,并且需要大多數(shù)臨床中心不容易獲得的專業(yè)知識(shí)。最后,雖然分子技術(shù)可能闡明膿毒癥的病理生理學(xué)基礎(chǔ),但我們?nèi)匀徊涣私飧深A(yù)和調(diào)節(jié)這些途徑的影響以及可能產(chǎn)生的下游影響。未來仍需要進(jìn)行大規(guī)模隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)來測(cè)試任何被提出的干預(yù)措施,以確定其安全性和有效性。

譯者簡(jiǎn)介

梁江洪,浙江中醫(yī)藥大學(xué)碩士研究生在讀。

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