里德伯格于2000年提出，人體是由人的細胞和所有共生微生物構(gòu)成的“超級生物體”，是個非常復雜的生態(tài)系統(tǒng)。寄生在人體體表和體腔內(nèi)的微生物數(shù)量可以達到人體自身細胞數(shù)量的10倍，有數(shù)百萬億之多，包括細菌、古細菌、病毒和真菌等，這些微生物的總重量可達2kg左右，其編碼的基因數(shù)量可達人體基因總數(shù)的100倍。我們與微生物共進化通過微生物群與人體之間的基因交流而影響彼此的進化軌跡。2016年Moeller等揭示了現(xiàn)代人和猿類并非簡單地從環(huán)境中獲得其腸道細菌，這些細菌在人和動物體內(nèi)與宿主共同演化了數(shù)百萬年之久并共同進化。共發(fā)育人體微生物群參與人體發(fā)育、生長和衰老的過程（如微生物群能影響幼年時免疫系統(tǒng)的發(fā)育及建立；微生物群的某些代謝產(chǎn)物能影響大腦和神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育和功能；微生物群能影響胃腸道的發(fā)育和血管系統(tǒng)的重構(gòu)。共代謝微生物群與宿主對食品和藥品代謝的合作深刻影響人類的健康和疾病治療，特別是對中藥的藥效影響巨大。腸道微生物群還能通過初級和次級代謝途徑產(chǎn)生大量小分子物質(zhì)（如短鏈脂肪酸等），這一生理過程依賴宿主的飲食。雖然這些小分子物質(zhì)中有很多保留在腸道內(nèi)，但仍有一些進入循環(huán)系統(tǒng)并被宿主化學修飾后發(fā)揮重要生理功能。互調(diào)控微生物組對宿主機體的調(diào)控主要涉及免疫系統(tǒng)、神經(jīng)系統(tǒng)和內(nèi)分泌系統(tǒng)。微生物組通過多種途徑影響三大系統(tǒng)的功能，而機體生理狀態(tài)的改變又反過來影響微生物組的構(gòu)成。此外，微生物組與宿主多種器官之間存在重要的聯(lián)系以相互調(diào)控，這種聯(lián)系包括近年來備受關注的微生物組－腸－腦軸、微生物組－腸－肝軸和微生物組－腸－肺軸。大量研究表明，微生物組與人體健康和疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關，尤以腸道微生物組最為重要。人體微生物組與哮喘等超敏反應疾病，肥胖、糖尿病、肝臟疾病等代謝相關疾病，心腦血管疾病，腸易激綜合征，炎癥性腸病，慢性腎病，消化道腫瘤，自閉癥、抑郁癥及老年癡呆等精神性疾病均相關。干預微生物組微生物群失調(diào)可能是由遺傳傾向、感染、飲食和營養(yǎng)狀況改變及抗生素使用等導致。改善腸道微生物組的方法主要有４種。飲食調(diào)理：飲食顯著影響腸道微生物群的組成，進而影響宿主的生理和免疫系統(tǒng)功能，以及對感染性疾病的敏感性。補充、添加有益菌或有益菌的活性產(chǎn)物：如益生元、益生菌／益生生物和促生元。近年來有研究證明益生菌能有效調(diào)節(jié)腸道菌群，對治療腹瀉、腸易激綜合征、過敏性疾病、艱難梭菌感染等疾病有一定的作用。減少抗生素：抗生素的使用不僅會產(chǎn)生細菌耐藥，還會干擾正常菌群，導致機會性致病菌的定植和致病，如艱難梭菌感染。微生物群的置換：通過糞菌移植，將健康人糞便中的功能菌群移植到患者胃腸道內(nèi)，重建新的腸道菌群，實現(xiàn)腸道及腸道外疾病的治療。
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