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《自然》子刊

根據(jù)現(xiàn)行的癌癥分期方法,癌癥可以籠統(tǒng)地被分為早期、中期和晚期。

這個(gè)分類方法不僅很好的慨括了癌癥的特點(diǎn),而且還通俗易懂地向大眾傳遞了癌癥的嚴(yán)重程度

如果被確診的癌癥是早期,腫瘤挺老實(shí)的待在原地,患者和家屬都會(huì)長吁一口氣,心里默念“幸好發(fā)現(xiàn)的早”;如果確診時(shí)是晚期,那就是癌癥已經(jīng)擴(kuò)散轉(zhuǎn)移了,醫(yī)生一般會(huì)選擇先和家屬談。

相比之下,由斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的醫(yī)學(xué)和遺傳學(xué)助理教授Christina Curtis聯(lián)合其他4所研究機(jī)構(gòu),于近日發(fā)表在著名期刊《自然·遺傳學(xué)》上的研究[1],就有些讓人不安了。

Christina Curtis本尊

(http://med.stanford.edu,Paul Sakuma攝)

他們分析了近3000名患者的基因數(shù)據(jù),通過三維計(jì)算機(jī)模擬分析,發(fā)現(xiàn)高達(dá)80%的轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌,可能在原始腫瘤長到罌粟種子大小(約0.01立方厘米,100萬個(gè)癌細(xì)胞,比芝麻粒還小)之前,就擴(kuò)散到體內(nèi)的其他地方了。而這個(gè)大小,目前在臨床上是檢測(cè)不到的。來自中國的三位青年才俊Hu Zheng,Ding Jie和Ma Zhicheng是論文的前三位作者

“這一發(fā)現(xiàn)非常令人驚訝,”Christina Curtis博士說[2]?!斑@表明癌癥在誕生之初就獲得了轉(zhuǎn)移能力。顯然,我們的結(jié)論與轉(zhuǎn)移發(fā)生在癌癥晚期這個(gè)流行假設(shè)相反,會(huì)對(duì)患者分期、治療和早期檢測(cè)產(chǎn)生一定的影響?!?/p>

三位中國青年才?。ㄗ蟆覍?duì)應(yīng)上一段的名字)

轉(zhuǎn)移是癌癥導(dǎo)致死亡的主要原因,不過癌癥轉(zhuǎn)移的時(shí)間,以及決定癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵分子機(jī)制在很大程度上還不清楚[3,4]。而這兩點(diǎn)對(duì)于癌癥的臨床診斷和治療,有重要價(jià)值。

進(jìn)入21世紀(jì),我們都認(rèn)為癌癥是一種基因病,癌細(xì)胞的產(chǎn)生和轉(zhuǎn)移,是體細(xì)胞逐漸積累基因突變導(dǎo)致的,因此主流觀點(diǎn)認(rèn)為,當(dāng)腫瘤發(fā)展到一定程度之后,會(huì)有一部分細(xì)胞獲得轉(zhuǎn)移的能力[5,6]。

然而,近年來,已經(jīng)有研究人員在早期乳腺腫瘤患者體內(nèi)發(fā)現(xiàn)擴(kuò)散出去的腫瘤細(xì)胞[7],在早期乳腺癌[8]和胰腺癌[9]的小鼠模型中,研究人員也發(fā)現(xiàn)了播散出去的腫瘤細(xì)胞。

Christina Curtis實(shí)驗(yàn)室的主頁,非常有科技感

這就讓一些研究人員對(duì)主流觀點(diǎn)產(chǎn)生了質(zhì)疑。還有一些科學(xué)家被這些新發(fā)現(xiàn)吸引,他們想知道,如果癌細(xì)胞能在腫瘤形成的早期就開始擴(kuò)散,那么究竟有多早呢?觸發(fā)的機(jī)制又是什么呢?

要解答上面的問題,科學(xué)家必須同時(shí)研究原發(fā)病灶的腫瘤和轉(zhuǎn)移灶的腫瘤。然而,同時(shí)在大量患者身上獲取兩處腫瘤組織有一定的難度,因此,目前還沒有研究能評(píng)估人類癌癥的轉(zhuǎn)移時(shí)間。

因此,尋找合適且足夠的研究材料,成為這個(gè)問題的關(guān)鍵突破口。

腸癌(mskcc.org)

Christina Curtis博士團(tuán)隊(duì)將寶壓在了腸癌上。

腸癌發(fā)病率和死亡率都比較高[10],且研究的比較多,因此腸癌的驅(qū)動(dòng)基因與疾病發(fā)展之間的關(guān)系也相對(duì)比較清楚[5]。而且腸癌的主要轉(zhuǎn)移對(duì)象肝臟[11],和罕見轉(zhuǎn)移對(duì)象大腦[12],也能通過切除獲取轉(zhuǎn)移灶腫瘤組織。

雖然目前腸癌轉(zhuǎn)移的主流模型也是腫瘤經(jīng)過一系列的克隆進(jìn)化之后,到晚期才轉(zhuǎn)移[5]。但是也有數(shù)據(jù)證明,腸癌也是“天生的壞種”,在腫瘤誕生的早期就具備了轉(zhuǎn)移的能力[13]。

如此看來,腸癌確實(shí)是個(gè)合適的模型。

腸道(該圖片由LJNovaScotia在Pixabay上發(fā)布)

研究人員在多個(gè)研究隊(duì)列中,找到23例存在肝轉(zhuǎn)移或者腦轉(zhuǎn)移的腸癌患者。其中10例腦轉(zhuǎn)移患者有72份組織活檢樣本,13例肝轉(zhuǎn)移患者有46份組織活檢樣本。研究人員給這118個(gè)組織樣本做了全外顯子基因組測(cè)序分析,以便從中發(fā)現(xiàn)腸癌轉(zhuǎn)移的路徑和時(shí)間。

研究人員將原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶的基因突變做了個(gè)比對(duì),發(fā)現(xiàn)原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶的癌癥驅(qū)動(dòng)基因之間保持了高度的一致性。KRAS,TP53,SMAD4等的突變?cè)谠l(fā)性和轉(zhuǎn)移性腫瘤也是一致的。此外,這兩處的腫瘤也可能共享SNV和小插入缺失。

原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶基因變異情況幾乎一樣啊

(豎虛線之間是一位患者的數(shù)據(jù)原發(fā)灶或者兩個(gè)轉(zhuǎn)移灶)

基于上面的基因變異數(shù)據(jù),研究人員給每位患者的腫瘤發(fā)展歷程做了個(gè)進(jìn)化樹,這就相當(dāng)于給癌細(xì)胞做了個(gè)家譜,看看他們一代代是如何傳遞下去的。

基于這些進(jìn)化樹,研究人員清晰地發(fā)現(xiàn),在可以分析的21名患者中,有17名患者的轉(zhuǎn)移灶是從一小撮癌細(xì)胞,甚至是一個(gè)癌細(xì)胞發(fā)育而來,而且從整個(gè)進(jìn)化樹來看,這些形成轉(zhuǎn)移灶的細(xì)胞形成于腫瘤發(fā)展的早期。這就暗示,在腸癌誕生的初期,這些形成轉(zhuǎn)移灶的癌細(xì)胞就離家出走了。

腸癌發(fā)家史

那這個(gè)早期到底是多早呢?

或者換個(gè)更直觀的說法:癌細(xì)胞開始離家出走的時(shí)候,腫瘤有多大呢?

對(duì)于這個(gè)問題,目前這個(gè)進(jìn)化樹模型是難以回答的。不過這也難不倒在計(jì)算生物學(xué)方面受過專業(yè)訓(xùn)練的Christina Curtis博士。

她帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一個(gè)三維計(jì)算模型[13],這個(gè)模型可以模擬在不同的參數(shù)條件下腫瘤的大小,及其與疾病進(jìn)展和基因變異之間的關(guān)系。

有了這個(gè)模型,他們很快就算出了21名患者癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移時(shí)的腫瘤大小。結(jié)果,那17名(83%)早期轉(zhuǎn)移的患者,轉(zhuǎn)移的真是非常早啊。在腸道腫瘤體積不足0.01立方厘米,也就是不到100萬個(gè)細(xì)胞的時(shí)候,一部分癌細(xì)胞就已經(jīng)離家出走了。

甚至有4名患者,在腫瘤只有1萬個(gè)細(xì)胞,體積只有0.0001立方厘米的時(shí)候,就轉(zhuǎn)移了。。。這也太早了吧~

從理論上講,體積小于0.01立方厘米的腫瘤,在臨床上是檢測(cè)不到的。這就意味著,對(duì)于那17位患者而言,幾乎是腫瘤一誕生,就是晚期。這些癌細(xì)胞那真是配得上“天生的壞種”這個(gè)稱呼。

轉(zhuǎn)移時(shí)腫瘤的大小,紅框內(nèi)是同一患者的兩組數(shù)據(jù)

可以看到腫瘤體積為0.0001立方厘米、10000個(gè)細(xì)胞時(shí),發(fā)生轉(zhuǎn)移的4位患者

那這些“天生的壞種”有沒有什么特點(diǎn)呢?

研究人員又調(diào)用了MSK-Impact[14]和GENIE[15]研究中2751名腸癌患者的測(cè)序數(shù)據(jù)。這2751名患者診斷結(jié)果明確,有938名患者為IV期轉(zhuǎn)移性腸癌患者,另外的1813名患者為I-III期的早期腸癌患者;此外,這些患者的基因變異數(shù)據(jù)也比較完整。

將這些數(shù)據(jù)與上面的結(jié)果相結(jié)合,研究人員有了不小的發(fā)現(xiàn)。

“我們發(fā)現(xiàn)特定的突變組合可以預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)移,”Christina Curtis博士說。例如,一個(gè)名為PTPRT的基因突變與經(jīng)典結(jié)直腸癌驅(qū)動(dòng)基因的突變相結(jié)合,幾乎只在轉(zhuǎn)移性癌癥患者中出現(xiàn)

腸癌的進(jìn)化轉(zhuǎn)移史

之前有研究表明,PTPRT功能的喪失會(huì)增加一個(gè)名為STAT3蛋白的活性,從而增強(qiáng)了細(xì)胞的存活能力[16],因此STAT3有可能是個(gè)不錯(cuò)的抗癌靶點(diǎn)。

此外,PTPRT的基因突變或許還可以用于指導(dǎo)患者的治療。如果切下的早期腫瘤中發(fā)現(xiàn)這個(gè)基因變異,或許可以考慮全身輔助化療。當(dāng)然,這個(gè)還需要臨床研究去驗(yàn)證。

總的來說,Christina Curtis博士團(tuán)隊(duì)的這個(gè)研究表明,腸癌的轉(zhuǎn)移可以發(fā)生在腫瘤形成的初期。現(xiàn)在看來,人類迫切需要一種能檢測(cè)這些難以發(fā)現(xiàn)惡性腫瘤的方法。希望研究液體活檢的科學(xué)家們繼續(xù)努力。

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參考資料:

[1].Zheng Hu, Jie Ding, Zhicheng Ma, et al. Quantitative evidence for early metastatic seeding in colorectal cancer[J]. Nature Genetics, 2019.

[2].http://med.stanford.edu/news/all-news/2019/06/most-metastatic-colorectal-cancers-have-spread-before-diagnosis.html

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[10].Siegel R L, Miller K D, Fedewa S A, et al. Colorectal cancer statistics, 2017.[J]. CA: A Cancer Journal for Clinicians, 2017, 67(3): 177-193.

[11].Vatandoust S, Price T J, Karapetis C S, et al. Colorectal cancer: Metastases to a single organ.[J]. World Journal of Gastroenterology, 2015, 21(41): 11767-11776.

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[16].Zhang X, Guo A, Yu J, et al. Identification of STAT3 as a substrate of receptor protein tyrosine phosphatase T[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2007, 104(10): 4060-4064.

本文作者 | BioTalker

“再次渾身冷汗流”

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