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看院士團(tuán)隊(duì)如何做circRNA研究

CircMTO1作為miR-9海綿抑制肝細(xì)胞癌的進(jìn)程

Circular RNA MTO1 acts as the sponge of miR-9 to suppress hepatocellularcarcinoma progression

非編碼RNA在癌癥生物學(xué)中有非常重要的作用。本文介紹了來(lái)自中科院院士曹雪濤課題組發(fā)現(xiàn)的肝細(xì)胞癌中兩個(gè)非編碼RNA相互作用,調(diào)控抑癌基因p21的表達(dá),對(duì)癌癥的發(fā)展和預(yù)后產(chǎn)生關(guān)鍵影響。

作者在肝細(xì)胞癌病人的芯片數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)顯著下調(diào)的CircRNA——CircMTO1,并發(fā)現(xiàn)隨癌癥分期的發(fā)展和預(yù)后的不良,CircMTO1的表達(dá)越低。作者將CircMTO1作為興趣分子,分析其海綿作用的miRNA,發(fā)現(xiàn)CircMTO1在肝癌細(xì)胞中與miR-9結(jié)合,同時(shí)通過(guò)CircMTO1和miR-9的過(guò)表達(dá)(干涉)及抑制miR-9的表達(dá)雙向證明CircMTO1可以抑制肝癌細(xì)胞的增殖和侵入,并增加細(xì)胞凋亡,其下游靶標(biāo)是p21。最后在小鼠體內(nèi)完成了進(jìn)一步的驗(yàn)證。

具體結(jié)果如下:

1

臨床組織篩選及驗(yàn)證

肝細(xì)胞癌病人中CircMTO1表達(dá)顯著下調(diào),并隨其惡化下調(diào)更加明顯。

2

潛在功能機(jī)制分析

RIP發(fā)現(xiàn)CircMTO1在肝癌細(xì)胞中與miR-9結(jié)合。

3

功能機(jī)制驗(yàn)證

CircMTO1和miR-9的互作影響p21的表達(dá),即發(fā)現(xiàn)了以下的調(diào)節(jié)方式。

3.1 過(guò)表達(dá)miR-9,或干涉CircMTO1,癌細(xì)胞增殖能力提高,凋亡減少,p21下調(diào);加外源CircMTO1后,出現(xiàn)相反的變化。

3.2干涉CircMTO1的表達(dá),p21下調(diào),同時(shí)抑制miR-9的表達(dá),p21的下調(diào)趨勢(shì)被逆轉(zhuǎn);相應(yīng)的細(xì)胞增殖和凋亡也隨p21的變化而變化。

4

體內(nèi)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的結(jié)果

提出CircMTO1可作為HCC治療靶點(diǎn)的理論建議。

思路總結(jié)

1. 利用高通量篩選和QPCR驗(yàn)證手段,獲得興趣circRNA;

2. 以CircRNA—miRNA—mRNA為藍(lán)圖,從差異表達(dá)的分子入手,篩選相互作用的miRNA,探討circRNA機(jī)制;

3. 篩查下游mRNA分子,闡明circRNA ceRNA機(jī)制并驗(yàn)證其在體內(nèi)外功能。

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