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史上最牛CRISPR 篩選|204種細(xì)胞系全基因組 screen 鑒定癌相關(guān)基因

在 Biorxiv 上公布了非常振奮人心的一個(gè)重大 CRISPR 篩選工作,在共計(jì)240種不同的癌癥細(xì)胞系,囊括12種不同的癌癥類型,靶向超過18000個(gè)基因的超級(jí)大規(guī)模的 CRISPR 篩選工作被公布,將會(huì)極大的促進(jìn)癌癥的知識(shí)發(fā)現(xiàn)。




為了在不同的組織學(xué)和分子亞型中全面分析癌細(xì)胞所需的基因(定義為細(xì)胞生長或生存所需的基因),來自 Wellcome Sanger Institute研究所的科學(xué)家們進(jìn)行了基因組規(guī)模的CRISPR - Cas9篩選,針對12種不同組織的204個(gè)癌細(xì)胞系中的18,009個(gè)基因,包括肺( n = 43 )、卵巢( n = 35 )、結(jié)腸直腸( n = 34 )、外周/中樞神經(jīng)系統(tǒng)( n = 29 )、胰腺( n = 24 )、乳房( n = 24 )和其他( n = 14 )。絕大多數(shù)細(xì)胞系( 98 % )是癌癥細(xì)胞系藥物敏感性基因組學(xué)項(xiàng)目的一部分,其中單核苷酸變異體( SNVs )和基因拷貝數(shù)變異體( CNVs )被完全注釋。所選擇的細(xì)胞系廣泛地反映了患者腫瘤的分子特征,包括三種最常見的癌癥形式(肺癌、結(jié)腸癌和乳腺癌),以及特別未滿足臨床需要的癌癥(肺癌、卵巢癌和胰腺癌)。

功能基因組學(xué)方法可以克服目前阻礙腫瘤藥物開發(fā)的限制,這個(gè)研究中預(yù)計(jì)可以極大的改變藥物開發(fā)過程的初始階段,有助于新的、多樣化的和更有效的腫瘤學(xué)目標(biāo)組合。


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