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CSCO衛(wèi)星會筆記丨中國首個NGS在臨床腫瘤學實踐中的大規(guī)模調(diào)研報告

本文來源:基因Talks

2018年《JCO Precision Oncology》發(fā)表了一項具有美國NGS代表性的腫瘤醫(yī)生調(diào)研報告:75.6% 的美國腫瘤醫(yī)生都在用 NGS 基因檢測技術(shù)指導(dǎo)腫瘤治療!

2019年9月19日,CSCO燃石衛(wèi)星會上報告了一項具有中國NGS代表性的腫瘤醫(yī)生調(diào)研報告:95.4%的中國腫瘤醫(yī)生愿意在未來推薦更多患者選擇NGS檢測,同時,在不考慮經(jīng)濟因素的情況下,46.5%的醫(yī)生會推薦NGS大panel,大panel 的NGS已經(jīng)逐漸成為臨床選擇趨勢!

中國NGS在臨床腫瘤學實踐中的調(diào)研報告

二代測序(NGS)又稱大規(guī)模平行測序,能夠同時對上百萬甚至數(shù)十億個DNA分子進行測序,實現(xiàn)了大規(guī)模、高通量測序的目標,是繼 Sanger 測序之后的革命性進步。近年來,NGS技術(shù)發(fā)展迅速,其應(yīng)用已進展至臨床腫瘤檢測,尤其在中國的普及發(fā)展,由于沒有受到監(jiān)管的控制,NGS的普及應(yīng)用程度可能比國外更高。

中國腫瘤NGS臨床普及應(yīng)用程度有多高?沒人統(tǒng)計過,基于此背景,CSCO腫瘤生物標志物委員會攜手燃石醫(yī)學共同發(fā)起和完成了具有中國NGS代表性的腫瘤醫(yī)生調(diào)研報告。(內(nèi)容來自2019年CSCO 燃石 衛(wèi)星會,旨在進行學習交流,侵刪!)

  • 調(diào)研方式:線上調(diào)研。

  • 調(diào)研對象:30個省市的臨床腫瘤醫(yī)生(三甲醫(yī)院,主治及以上為主)。

  • 調(diào)研數(shù)量:1020名(980名曾推薦患者進行NGS檢測的醫(yī)生 + 40名未曾推薦患者進行NGS檢測的醫(yī)生)。

  • 調(diào)研醫(yī)生背景:看診癌種與中國癌癥流行數(shù)據(jù)一致(Globocan2018)。

中國首個NGS在臨床腫瘤學實踐中的大規(guī)模調(diào)研報告將分為以下三個部分進行介紹:① NGS臨床應(yīng)用習慣;② 不同癌種 Biomarker 認知程度;③ NGS檢測規(guī)范化情況。

NGS臨床應(yīng)用習慣

  • NGS使用頻率:>30%腫瘤醫(yī)生每個月NGS檢測處方量超過5個;表明NGS檢測已成為中國腫瘤臨床醫(yī)生的常規(guī)檢測工具!

  • NGS檢測主要目的:臨床指導(dǎo)用藥?。▏鴥?nèi)臨床NGS檢測主要目的:1. 臨床指導(dǎo)用藥;2. 復(fù)發(fā)監(jiān)控、療效評估;3. 跨適應(yīng)癥用藥 vs 美國臨床NGS檢測主要目的:1. 臨床指導(dǎo)用藥;2. 復(fù)發(fā)監(jiān)控、療效評估;3. 跨適應(yīng)癥用藥)

  • NGS使用目的與各癌種目前診治現(xiàn)狀高度相關(guān):輔助診斷和用藥:肺癌,結(jié)直腸癌,乳腺癌等;復(fù)發(fā)監(jiān)控療效評估:子宮內(nèi)膜癌,淋巴瘤,肝癌等;跨適應(yīng)癥用藥:淋巴瘤,乳腺癌,胃癌/食管癌等;臨床入組:尿路上皮癌,卵巢癌,肝癌等。

  • 遺傳篩查關(guān)注度最高癌種:卵巢癌(54%)> 子宮內(nèi)膜癌(38%)= 乳腺癌(38%)> 結(jié)直腸癌(37%)等。

  • NGS應(yīng)用場景:以一線治療為主導(dǎo),NGS檢測在臨床診療的各階段都有應(yīng)用;晚期一線治療(胰腺癌,淋巴瘤,肺癌等) > 術(shù)后輔助治療 (子宮內(nèi)膜癌,肝癌,結(jié)直腸癌等)> 晚期后線治療(胰腺癌,卵巢癌,淋巴瘤等) > 新輔助治療(尿路上皮癌,前列腺癌,胃癌/乳腺癌等)。

  • NGS主要參數(shù)關(guān)注順序:腫瘤醫(yī)生在具體推薦檢測 panel 時,基因數(shù)目是臨床考慮的主要參數(shù)?;驍?shù)目 > 變異類型是否覆蓋 > 測序深度 >最低檢測限。目前,超過半數(shù)臨床醫(yī)生開始關(guān)注NGS的具體質(zhì)控參數(shù)。在不考慮經(jīng)濟因素的情況下,46.5%的醫(yī)生會推薦大panel,大panel的NGS已經(jīng)逐漸成為臨床選擇趨勢!


不同癌種 Biomarker 認知程度

  • 肺癌Biomarker:EGFR、ALK、ROS1、KRAS、PD-L1等。62.8%的醫(yī)生同時關(guān)注EGFR、ALK、ROS1這三個基因;免疫治療在肺癌中受到認可,>50%醫(yī)生關(guān)注PD-L1的表達;單次檢測已經(jīng)無法滿足肺癌的臨床需求,多基因平行檢測是肺癌的剛需。

  • 結(jié)直腸癌 Biomarker:KRAS/NRAS、BRAF、MSI等。

  • 胃癌/食管癌/EGJ癌 Biomarker:MSI,PD-L1,TMB,HER2等。

  • 乳腺癌 Biomarker:HER2,BRCA1/2,CDK4/6等。

  • 全癌種免疫 Biomarker:絕大多數(shù)醫(yī)生重視免疫治療,最為關(guān)注PD-L1的檢出,此外,67.5%醫(yī)生同時關(guān)注PD-L1和TMB。

NGS檢測規(guī)范化情況

  • 選擇檢測平臺時,精準檢測、生信解讀、質(zhì)控成為臨床醫(yī)生最重要考量因素。

  • 規(guī)范化檢測背書:國際認證、NMPA審批;75.4%的醫(yī)生認為,擁有國際質(zhì)量管理體系證書代表NGS檢測規(guī)范化!

  • 23.27%臨床專家對NGS實驗室認證體系完全不了解。

  • 月均>10個患者進行NGS檢測的醫(yī)生中,30.36%從未收到過送檢樣本不合格/樣本質(zhì)量警示提醒。 

  • 58.47%的醫(yī)生常規(guī)推薦1-2家檢測公司,41.53%的醫(yī)生常規(guī)推薦≥3家檢測公司。 

  • 中國NGS臨床應(yīng)用主要限制因素:價格高、是否有臨床價值、缺少接觸渠道。價格高在美國也是主要限制因素。

  • 超過 95% 醫(yī)生愿意在未來推薦更多患者選擇NGS檢測!

重 點 總 結(jié) 

  • 在推薦患者進行NGS檢測的醫(yī)生中,超過 30% 臨床醫(yī)生每月NGS檢測大于5個,NGS已經(jīng)成為腫瘤臨床腫瘤醫(yī)生常用檢測工具;

  • 不同醫(yī)生對NGS檢測目的、臨床應(yīng)用場景略有不同,但均與各癌種目前診治現(xiàn)狀高度匹配;

  • 基因數(shù)目是臨床選擇NGS考慮的主要參數(shù),在不考慮經(jīng)濟條件下,超過300基因的大panel成為臨床選擇趨勢;

  • 免疫Biomarker如 PD-L1,TMB已經(jīng)成為常用靶點之后臨床最為關(guān)注的分子標志物;

  • 23% 的臨床醫(yī)生對NGS實驗室認證體系完全不了解,超過 30% 常用NGS的臨床醫(yī)生從未收到不合格/警戒提示,90% 醫(yī)生臨床醫(yī)生NGS報告需要解讀,說明國內(nèi)NGS檢測的規(guī)范化及教育仍任重道遠。

參考資料:

1.Freedman A N, Klabunde C N, Wiant K, et al. Use of next-generation sequencing tests to guide cancer treatment: results from a nationally representative survey of oncologists in the United States[J]. JCO Precision Oncology, 2018, 2: 1-13.

2.張緒超.,中國NGS在臨床腫瘤學實踐中的調(diào)研報告,PPT,CSCO燃石衛(wèi)星會,20190919.

——本期完——

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