來了一份全外顯子組基因檢測(cè)報(bào)告（2022年3月某域提供），密密麻麻很多內(nèi)容，怎么看呢？
Step1，直接進(jìn)入核心內(nèi)容——檢測(cè)結(jié)果及解釋，其中最重要的是下面三列：變異分類非常重要，至少包括以下五種（不同實(shí)驗(yàn)室的閾值略有差異）：
2、可能良性（LB）：0.1%～5%的可能存在致病性；3、意義未明的變異（VUS）：5%～90%的可能存在致病性；4、可疑致病性（LP）：90%～99%的可能存在致病性；5、致病性（P）：>99%的可能存在致病性；
VUS是個(gè)廣闊的灰區(qū)，還可進(jìn)一步分為VUS偏致病性、偏良性等等。本例中變異分類為意義未明，就是不能準(zhǔn)確判斷該變異的致病性。Step2，看突變基因的臨床意義，檢測(cè)公司已在附二中給我們相應(yīng)的解釋。不滿意的話我們還可以自己檢索數(shù)據(jù)庫查詢突變的臨床意義，常用數(shù)據(jù)庫包括但不限于：
HGMD 數(shù)據(jù)庫（https://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/introduction.php?lang=chinese）OMIM數(shù)據(jù)庫（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/）ClinVar數(shù)據(jù)庫（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/）未來我們也會(huì)介紹相關(guān)數(shù)據(jù)庫檢索方法，敬請(qǐng)期待。三大數(shù)據(jù)庫收錄比較（數(shù)據(jù)截止2020年3月）Step3，綜合判斷患者臨床情況（發(fā)病年齡、臨床表現(xiàn)、遺傳方式等）能不能用該變異解釋，這一步有時(shí)非常困難。讓我們多一點(diǎn)探究精神，看看分子水平發(fā)生了什么變化。再來看檢測(cè)結(jié)果及解釋，中間三列告訴了我們?cè)敱M的分子信息，包括：1、染色體位置：即變異在染色體的位置，本例ACTN4基因的點(diǎn)突變就在19號(hào)染色體（chr19）的第39214722位堿基。2、位置：即變異在基因的位置，本例ACTN4基因的點(diǎn)突變位于14號(hào)內(nèi)含子。注：為什么外顯子測(cè)序能得到內(nèi)含子的結(jié)果呢，那是因?yàn)樗^外顯子測(cè)序不是百分之百測(cè)外顯子，也會(huì)涵蓋外顯子旁邊內(nèi)含子的部分序列。3、發(fā)生了什么突變：以HGVS表達(dá)式描述，后面詳述。
詳細(xì)解釋下第三列HGVS表達(dá)式，分為三部分：
1、參考轉(zhuǎn)錄本：NM開頭的一長(zhǎng)串是RefSeq號(hào)，即ACTN4基因在RefSeq數(shù)據(jù)庫里的ID號(hào)，一般可以不看。
2、DNA水平改變：c.指代編碼DNA（由外顯子組成），1692+5描述位置，G>A描述突變情況；3、蛋白水平改變：p.指代蛋白質(zhì)，后面描述發(fā)生的變化。我們?cè)賮砜聪赂敿?xì)的規(guī)則。
堿基位置描述：外顯子的堿基以c.N（N為正數(shù)）表示，內(nèi)含子則以鄰近的外顯子為參考系，如下圖中c.36+10為外顯子1最后一個(gè)堿基（c.36)下游第10個(gè)堿基。反之，c.37-10為外顯子2第一個(gè)堿基（c.37）上游第10個(gè)堿基。
詳見——https://www.hgvs.org/mutnomen/recs-DNA.html
詳見——https://www.hgvs.org/mutnomen/recs-DNA.html詳見——https://www.hgvs.org/mutnomen/recs-prot.html一般無義突變、移碼突變對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)影響較大。再回頭來看本例WT1基因發(fā)生的改變，其中一條等位基因（雜合）發(fā)生了錯(cuò)義突變
c.1225A>C：編碼區(qū)1225位堿基由A變成了C，該突變位于7號(hào)外顯子。
p.Lys409Gln：肽鏈第409位殘基由Lys變成Gln。
其致病性意義未明。
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