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二代測序建庫流程關鍵酶

隨著二代測序成本的不斷降低,我們開始更加關注測序數據的質量,而文庫構建過程中數據信息的完整性和穩(wěn)定性則對最終的測序數據質量至關重要。 LGC Biosearch Technologies,擁有9年以上二代測序酶生產經驗的廠商,可以為您提供二代測序建庫流程中所有的關鍵酶,保證您的文庫構建更加精準高效!

二代測序建庫流程

RNA建庫

1

mRNA富集/rRNA去除

  • Terminator5

  • 熱穩(wěn)定RNA酶H

2

第一鏈cDNA合成

  • Episcript RNA酶抑制劑

  • RiboGuard? RNA酶抑制劑

  • NxGen酶抑制劑

3

第二鏈合成

  • Klenow DNA聚合酶

4

片段化...

DNA建庫

5

末端修復/加A尾

  • T4 DNA聚合酶

  • T4 磷酸激酶

  • Taq98? DNA聚合酶

6

加接頭

  • NxGen? T4連接酶

7

純化、上機

相關產品及用途列表

具體產品介紹

1. TerminatorTM 5′-Phosphate-Dependent Exonuclease

  • 特異性水解5′單磷酸RNA(如rRNA)不影響mRNA

  • 富集mRNA,去除rRNA

2. Hybridase? Thermostable RNase H

熱穩(wěn)定RNase H

  • RNA的選擇性降解(rRNA removal):針對rRNA設計DNA探針,利用熱穩(wěn)定RNase H選擇性切割DNA/RNA雜合鏈,精準去除背景RNA。詳細步驟可參見參考文獻*。
    *Morlan JD, Qu K, Sinicropi DV (2012) Selective Depletion of rRNA Enables Whole Transcriptome Profiling of Archival Fixed Tissue. PLoS ONE 7(8): e42882.

3. Episcript逆轉錄酶

可從皮克級別的總RNA中逆轉錄得到長達12kbp 的全長cDNA,無RNase H活性, 適用于長read 的測序儀的文庫構建

4. NxGENTM 及Riboguard RNA酶抑制劑

  •  NxGENTM RNA酶抑制劑為一個豬RNA酶抑制基因(52KDa蛋白)融合了我們專利的22.5 kDa 蛋白標簽;

  • 可抑制 RNase A, RNase B及 RNase C對RNA樣品的影響,保護RNA樣品;

  • 可直接加入RNA樣品,并兼容反轉錄反應;

5. T4 DNA 聚合酶

加A尾前形成DNA平末端

  • 在模板和引物存在的情況下催化5’→3’DNA合成

    ——5’ 補齊

    ——DNA 合成(高保真)

  • 包含3’→5’ 外切酶活性

  • 無鏈置換活性

  • 需在75°C熱失活20分鐘

6. NxGen T4 DNA 連接酶

  • ATP-dependent 酶,連接擁有5′ 磷酸和 3′ 羥基平或粘性末端的雙鏈DNA 分子;

  • 對單鏈核酸無活性;

  • 需在65°C熱失活10分鐘;

7. T4 多核苷酸激酶

5’末端磷酸化酶關鍵酶

  • 可將磷酸集團從ATP轉移到5’ 羥基末端,適用于雙鏈DNA, 單鏈DNA, 雙鏈RNA 及單鏈RNA;

  • 主要應用為5’磷酸化,使DNA或RNA適合于連接反應(在連接酶的作用下連接兩個或更多的DNA或RNA分子)

    ——NGS 建庫

    ——Ligation-based PCR assays

  • 需在65°C熱失活20分鐘

8. Taq98? DNA聚合酶

提升DNA 聚合酶加A尾效率

  1. 在模板和引物存在的情況下催化5’→3’DNA合成;

  2. 具有加A尾活性:

    Used in T-A cloning to generate fragments with single 3’ A overhangs

  3. 也可用于PCR,比標準Taq DNA 聚合酶具有更強的熱穩(wěn)定性;

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