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CircRNA研究永不消退的熱點(diǎn)——ceRNA機(jī)制

環(huán)狀RNA一直是非編碼RNA研究領(lǐng)域的寵兒,在不同的研究方向都有發(fā)現(xiàn)circRNA的新功能,吸引了無(wú)數(shù)研究者的目光,僅今年上半年(截至6月底)從pubmed中檢索已發(fā)布的circRNA相關(guān)研究就達(dá)1783篇,其中ceRNA機(jī)制研究占了三分之一。CeRNA機(jī)制是否還能發(fā)高分的文章一直是大家關(guān)注的,今天就與各位老師分享最近發(fā)表的兩篇高分文章,都是很經(jīng)典的研究套路,值得借鑒。

01

circRHOBTB3通過(guò)調(diào)節(jié)HuR介導(dǎo)的PTBP1的mRNA穩(wěn)定性在來(lái)抑制結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移

標(biāo)題Circular RNA circRHOBTB3 represses metastasis by regulating the HuR-mediated mRNA stability of PTBP1 in colorectal cancer

期刊:Theranostics.

影響因子:8.579

作者單位:浙江大學(xué)邵逸夫醫(yī)院

摘要:結(jié)直腸癌(CRC)的腫瘤轉(zhuǎn)移是大多數(shù)患者死亡的主要原因,也是CRC綜合治療的主要難點(diǎn)。環(huán)狀RNA(circRNA)影響實(shí)體瘤中的許多生物學(xué)功能。然而它們?cè)贑RC轉(zhuǎn)移中的機(jī)制仍不清楚。通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)和實(shí)時(shí)定量PCR篩選CRC組織和鄰近正常組織之間差異表達(dá)的circRNA。進(jìn)行CCK-8細(xì)胞遷移和劃痕愈合試驗(yàn)以確定circRHOBTB3在細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移中的功能。RNA pulldown和RNA免疫沉淀試驗(yàn)驗(yàn)證circRHOBTB3和HuR(ELAVL1)蛋白之間的相互作用。進(jìn)一步的 RNA-seq 和rescue experiments尋找下游靶標(biāo)。進(jìn)行小鼠異種移植模型,以闡明 circRHOBTB3 對(duì)體內(nèi)癌癥轉(zhuǎn)移的影響。作者鑒定了在 CRC 組織和細(xì)胞系中顯著下調(diào)的circRHOBTB3,并發(fā)現(xiàn)較低的circRHOBTB3水平與晚期臨床分期和更大的轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)。circRHOBTB3的過(guò)表達(dá)抑制了CRC腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。從機(jī)制上講,circRHOBTB3與HuR結(jié)合HuR是CRC發(fā)展中普遍表達(dá)的功能性RNA結(jié)合蛋白 (RBP),并促進(jìn)β-Trcp1介導(dǎo)的HuR泛素化。通常HuR與靶標(biāo) mRNA 的 3'UTR 結(jié)合以增進(jìn)其穩(wěn)定性,而circRHOBTB3和HuR之間的相互作用會(huì)降解HuR以降低下游靶標(biāo)PTBP1的表達(dá)。此外,在體內(nèi)過(guò)表達(dá)circRHOBTB3可抑制肺轉(zhuǎn)移,并且這種效果可以被PTBP1過(guò)表達(dá)部分逆轉(zhuǎn)。在CRC細(xì)胞中,F(xiàn)US和ADARB2均可促進(jìn)circRHOBTB3的轉(zhuǎn)錄。研究結(jié)果表明,circRHOBTB3通過(guò)HuR/PTBP1軸對(duì)CRC侵襲性產(chǎn)生抑制作用。

02

circWAC通過(guò)miR-142/WWP1/PI3K/AKT信號(hào)機(jī)制促進(jìn)TNBC的發(fā)生發(fā)展和PTX的化療耐藥性

標(biāo)題:CircWAC induces chemotherapeutic resistance in triple-negative breast cancer by targeting miR-142, upregulating WWP1 and activating the PI3K/AKT pathway

期刊:Molecular Cancer.

影響因子:15.302

作者單位:蘇州大學(xué)

摘要:化療耐藥是三陰性乳腺癌(TNBC)臨床治療失敗和預(yù)后不良的主要原因。乳腺癌相關(guān)circRNA的研究尚處于起步階段,尚未報(bào)道與TNBC中的化學(xué)敏感性相關(guān)的circRNA?;贕EO數(shù)據(jù)集鑒定Tnbc相關(guān)circRNA,采用RT-PCR檢測(cè)circWAC在TNBC細(xì)胞和組織中的表達(dá)水平,然后進(jìn)行體外和體內(nèi)功能實(shí)驗(yàn),評(píng)價(jià)circWAC對(duì)TNBC的作用。研究發(fā)現(xiàn)CircWAC在TNBC中高表達(dá),并與更差的TNBC患者預(yù)后相關(guān)。隨后,證實(shí)了circWAC的下調(diào)可以在體外和體內(nèi)增加TNBC細(xì)胞對(duì)紫杉醇(PTX)的敏感性。TNBC中miR-142的表達(dá)與circWAC負(fù)相關(guān)。RNA免疫沉淀測(cè)定,熒光素酶報(bào)告基因測(cè)定,RNA pulldown和熒光原位雜交證實(shí)了TNW細(xì)胞中circWAC和miR-142之間的相互作用。從機(jī)制上講,circWAC充當(dāng)miR-142的“海綿”,以減輕miR-142對(duì)WWP1的抑制作用。此外,miR-142高表達(dá)的TNBC患者的總體生存率明顯好于miR-142低表達(dá)的TNBC患者,這些結(jié)果在公共數(shù)據(jù)庫(kù)中得到了驗(yàn)證。MiR-142調(diào)節(jié)WWP1的表達(dá)和PI3K / AKT途徑的活性。證實(shí)了WWP1在TNBC中高表達(dá),并且WWP1高表達(dá)的患者的預(yù)后較差??傊?,CircWAC / miR-142 / WWP1形成競(jìng)爭(zhēng)性?xún)?nèi)源RNA(ceRNA)網(wǎng)絡(luò),以調(diào)節(jié)TNBC細(xì)胞中的PI3K / AKT信號(hào)傳導(dǎo)活性并影響細(xì)胞的化學(xué)敏感性。

Shbio human ceRNA array覆蓋circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片數(shù)據(jù)同時(shí)提供三個(gè)層面的表達(dá)信息,circRNA和lncRNA作為典型的內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)性RNA(ceRNA機(jī)制),此款芯片可以讓您暢游ceRNA調(diào)控研究。對(duì)circRNA檢測(cè)特異性高:circRNA -特異的反向剪接位點(diǎn)探針設(shè)計(jì),保證每個(gè)探針檢測(cè)的特異性,避免與母基因之間的冗余影響。

Shbio human ceRNA array v3.0(規(guī)格:8 X 160K)芯片參數(shù)



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