NGS、甲基化檢測(cè)、基因測(cè)序……這些名字聽起來很高大上的檢查手段,其實(shí)都是基因檢測(cè)。目前,比較流行的是大家較為熟悉的NGS。
那么,NGS是什么?為什么不同的患者需要檢測(cè)的項(xiàng)目不同?難道不是檢測(cè)的項(xiàng)目越多越好嗎?
最近,一位患者向我咨詢:“醫(yī)生,我3年前得了肺癌,做了手術(shù)。近期復(fù)查,顯示我的肺上又長(zhǎng)了幾個(gè)小結(jié)節(jié),穿刺結(jié)果和上次一樣,還是癌……大夫讓我做個(gè)NGS檢測(cè),那是什么?。课矣袀€(gè)病友,他說他做了肺癌9基因檢測(cè)。我們不懂,為啥都是肺癌,做的檢查還不一樣呢?”我想,像這名患者一樣不明白基因檢測(cè)有什么用途的不在少數(shù)。
什么是NGS
NGS(next-generation seq-uencing)是一種高通量基因測(cè)序技術(shù),又名下一代測(cè)序。它能夠在相對(duì)短的時(shí)間內(nèi)同時(shí)檢測(cè)大量DNA片段,通過和正?;蛐蛄斜葘?duì),高效、準(zhǔn)確地檢測(cè)出樣本中基因發(fā)生的改變,就像給孩子檢查算術(shù)題,NGS能夠一目十行,把錯(cuò)誤檢查出來。這項(xiàng)技術(shù)通常應(yīng)用于產(chǎn)前診斷和惡性腫瘤的診斷及指導(dǎo)用藥上。
簡(jiǎn)單說,NGS就是基因檢測(cè)技術(shù)的一種。它的特點(diǎn)是可以對(duì)幾十萬至幾百萬條DNA分子同時(shí)進(jìn)行序列測(cè)定。而以往的檢測(cè)方法,包括一代測(cè)序技術(shù)、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)、熒光原位雜交(FISH),每次只能檢測(cè)一個(gè)或幾個(gè)基因,且耗時(shí)較長(zhǎng)。
為什么要進(jìn)行NGS檢測(cè)
1.輔助診斷
腫瘤其實(shí)很狡猾,有時(shí)長(zhǎng)得四不像,很難通過常規(guī)手段明確診斷,這時(shí)NGS就可以大顯身手了。由于不同腫瘤有不同基因改變的特點(diǎn),對(duì)于診斷不明確的腫瘤,NGS可以將腫瘤細(xì)胞具有的基因改變一次性檢測(cè)出來,這樣就可以在短時(shí)間內(nèi)明確診斷,臨床醫(yī)生也能夠順利制訂下一步的治療計(jì)劃。
2.尋找腫瘤用藥靶點(diǎn)
近年來,靶向藥物和免疫藥物的出現(xiàn)改善了腫瘤的治療效果。以往的化療藥物雖然能夠殺死腫瘤細(xì)胞,但同時(shí)也會(huì)殺死人體的正常細(xì)胞,沒有特異性,而靶向藥物解決了這一問題。
靶向藥物可以識(shí)別腫瘤細(xì)胞的特定靶點(diǎn),針對(duì)性地清除腫瘤細(xì)胞,對(duì)正常細(xì)胞沒有影響。打個(gè)比方,這就像我們給腫瘤細(xì)胞安裝了一個(gè)GPS(全球定位系統(tǒng))。靶向藥物可以追蹤著GPS的信號(hào),找到腫瘤細(xì)胞,然后殺死它們。但想要使用靶向藥,就要先明確是否有相應(yīng)的靶點(diǎn)。
NGS可以將腫瘤細(xì)胞不同于正常細(xì)胞的基因改變檢測(cè)出來,這就相當(dāng)于找到了腫瘤里所有隱藏的GPS信號(hào)。根據(jù)這些基因改變,臨床醫(yī)生可以有的放矢地選擇相應(yīng)的靶向藥物為患者進(jìn)行治療。目前,歐洲腫瘤醫(yī)學(xué)學(xué)會(huì)(ESMO)推薦:晚期非鱗非小細(xì)胞肺癌、轉(zhuǎn)移性乳腺癌、結(jié)直腸癌、前列腺癌、轉(zhuǎn)移性胃癌、胰腺導(dǎo)管腺癌、晚期卵巢癌、晚期肝細(xì)胞癌和晚期膽管癌患者常規(guī)應(yīng)用NGS進(jìn)行檢測(cè)。
如何選擇NGS項(xiàng)目
NGS根據(jù)腫瘤類型及檢測(cè)的基因數(shù)目不同分成了多種“套餐”,這就像我們?nèi)コ钥觳?,是吃漢堡可樂薯?xiàng)l套餐,還是蓋飯紫菜湯套餐。具體選擇何種套餐,需要根據(jù)我們的口味和需求來決定?,F(xiàn)在可供選擇的NGS項(xiàng)目包括肺癌9基因、乳腺癌21基因、實(shí)體瘤基因、神經(jīng)腫瘤基因等。具體如何選擇呢?
我以肺癌為例講解一下。肺癌9基因檢測(cè)是指檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌中9個(gè)最常見驅(qū)動(dòng)基因是否發(fā)生突變。如果存在突變,患者就可以應(yīng)用相應(yīng)的靶向藥物進(jìn)行治療。相較于肺癌9基因檢測(cè),更大范圍的NGS檢測(cè)可覆蓋更多的基因靶點(diǎn),從而檢測(cè)出除肺癌9基因外的其他突變基因,為靶向用藥指導(dǎo)提供更多的可能性。
既然NGS這么有用,那肯定是檢測(cè)的基因越多越好了?其實(shí)也不是。比如,LuminalA/B、未發(fā)生轉(zhuǎn)移的早期乳腺癌患者可進(jìn)行乳腺癌21基因檢測(cè)。這21個(gè)基因可用于預(yù)測(cè)乳腺癌復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)及接受化療的效益比。21基因檢測(cè)后若被判定為高風(fēng)險(xiǎn),患者未來復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)更高,化療效果更差。根據(jù)檢測(cè)結(jié)果,醫(yī)生在早期即可為患者做出個(gè)性化的診療方案,讓患者有更好的預(yù)后,進(jìn)一步提高未來的生存質(zhì)量。
值得一提的是,經(jīng)過治療的腫瘤患者常出現(xiàn)耐藥。針對(duì)這類患者,NGS檢測(cè)可提供更好的用藥指導(dǎo)。腫瘤發(fā)生耐藥,即原有的藥物不再能殺死腫瘤細(xì)胞,這時(shí)通過NGS檢測(cè),可以把腫瘤更多的突變靶點(diǎn)檢測(cè)出來,下一步就可以嘗試新的靶向藥物,這也為患者的生存提供了新的希望。
NGS檢測(cè)的應(yīng)用潛力是巨大的,既可以輔助疾病的診斷,又為臨床診療提供了可靠的支持與指導(dǎo)。尤其是對(duì)于晚期腫瘤患者來說,NGS提供了精準(zhǔn)的靶向治療及免疫治療用藥指導(dǎo),延長(zhǎng)了患者的生存期,提高了他們的生存質(zhì)量。
文:首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院病理科 王勝男
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