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病毒變異對人類來說意味著什么?
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文/李祥

受影視作品的影響,說到變異,大家往往會想到生化危機(jī)中變異的病毒給人類所帶來的災(zāi)難。那么,病毒變異對人類來說意味著什么?


 RNA病毒變異較快  
作為自然界中結(jié)構(gòu)最簡單的一類生物,大部分病毒僅僅由蛋白質(zhì)外殼和核酸構(gòu)成,小部分病毒含有脂質(zhì)的膜。病毒結(jié)構(gòu)簡單,卻擁有復(fù)雜的生活史。在與動植物和微生物的交互中,病毒具有復(fù)雜的行為特點。病毒的大量繁殖,會導(dǎo)致許多變異病毒的產(chǎn)生。這一特點使得病毒能夠在復(fù)雜的情況下快速進(jìn)化,從而適應(yīng)環(huán)境。
根據(jù)美國生物學(xué)家戴維·巴爾的摩建立的巴爾的摩病毒分類系統(tǒng),新型冠狀病毒(以下簡稱新冠病毒)屬于正義單鏈線狀RNA病毒,即這類病毒的基因組僅有一條RNA鏈。與大部分以雙鏈DNA作為遺傳物質(zhì)的生物不同,冠狀病毒大家族中的遺傳物質(zhì)全都是單鏈線狀RNA。
在自然狀態(tài)下,由于化學(xué)結(jié)構(gòu)的不同,相同的RNA相比DNA更加容易發(fā)生突變,因此RNA病毒的變異速度往往快于DNA病毒。這一特點在2003年的SARS(嚴(yán)重急性呼吸綜合征)期間體現(xiàn)得非常清楚,早期的SARS病毒的傳播能力較弱,隨著病毒的不斷傳播,病毒在快速復(fù)制增殖的過程中產(chǎn)生了許多突變,盡管大部分的突變對病毒而言都是有害的,但仍舊有部分發(fā)生在關(guān)鍵基因上的突變改變了病毒傳播的能力。在疫情暴發(fā)中期,突變后的病毒在人群中大量傳播。
新冠病毒與SARS病毒相似,同屬套式病毒目、冠狀病毒科、冠狀病毒屬,基因組大小為27~32KB。據(jù)中國科研團(tuán)隊在2020年3月4日發(fā)表的論文,到論文發(fā)表為止,根據(jù)已經(jīng)測序的基因組數(shù)據(jù),新冠病毒已經(jīng)產(chǎn)生了149個突變位點,并分化出L和S兩個類型。盡管病毒已經(jīng)產(chǎn)生了這么多的突變,但科研人員在文章中解釋,病毒并沒有像SARS病毒一樣發(fā)生了適應(yīng)性進(jìn)化,因此無需過于擔(dān)心。


 變異是常見的自然現(xiàn)象  
為什么說新冠病毒發(fā)生了這么多的突變卻沒有產(chǎn)生適應(yīng)性變化?病毒的突變是什么?適應(yīng)性進(jìn)化又是什么?這要從科學(xué)家們?nèi)绾窝芯坎《镜倪M(jìn)化說起。
事實上,從生物學(xué)上來講,生物的變異是一件很常見的事情,以我們自身為例,我們瞳孔的顏色、血型等性狀,在從父母身上遺傳的過程中,由于重組等變異的情況存在,我們與父母之間往往存在有許多的不同,這種不同我們也稱之為變異。
突變也是變異的一種。突變一般指的是基因突變,往往用來描述某個基因上某個核苷酸位點上的含氮堿基發(fā)生改變,從一種含氮堿基變成了另一種含氮堿基。廣義的變異包含有多種遺傳信息改變的方式,但有利變異和有害變異相對較少,因此當(dāng)聽到生物學(xué)家們說到某種生物發(fā)生了變異的時候,不要驚慌,他們只是在闡述一種自然現(xiàn)象。
由于病毒沒有染色體等結(jié)構(gòu),它們的遺傳物質(zhì)僅有DNA或RNA,缺乏相應(yīng)的保護(hù)蛋白,且由于病毒的復(fù)制發(fā)生在被他們感染的細(xì)胞中,因此病毒的遺傳物質(zhì)更加容易發(fā)生改變。作為一種基因組相對較大的RNA病毒,新冠病毒在整個基因組上發(fā)生突變的概率也相對更大。


 RNA病毒突變的三種類型  
RNA序列由四種基本的核糖核苷酸組成,分別是腺嘌呤核糖核苷酸(A)、鳥嘌呤核糖核苷酸(G)、胞嘧啶核糖核苷酸(C)以及尿嘧啶核糖核苷酸(U)。RNA病毒上所能夠發(fā)生的突變與上述的四種不同類型的核糖核苷酸有關(guān),主要分為插入、缺失以及點突變?nèi)N類型。
所謂插入突變,指的是在原先的核苷酸序列中憑空插入了一個或數(shù)個核苷酸,例如,序列“AUG GAG AGC”在第三個核苷酸G的后面加入了一個C,由于核糖體是以三個核苷酸為一個密碼子進(jìn)行閱讀的,當(dāng)序列變?yōu)椤癆UG CGA GAG C”后,原先的三個密碼子“AUG”“GAG”“AGC”變化成了“AUG”“CGA”“GAG”。由此可見,由于單個C的插入導(dǎo)致RNA鏈上整個基因后續(xù)的讀碼發(fā)生偏移。通常情況下,發(fā)生單個核苷酸的突變會導(dǎo)致不能產(chǎn)生正常的蛋白質(zhì),因此一旦病毒發(fā)生插入突變,對病毒而言并不是好事,病毒的復(fù)制往往會出現(xiàn)問題,因此這種突變不足畏懼。
缺失突變與插入突變類似,不同的是,缺失突變是由于病毒基因組上核苷酸的缺失導(dǎo)致的,以序列“AUG GAG AGC U”為例,如果第四位的G發(fā)生缺失,原先的三個密碼子“AUG”“GAG”“AGC”將會變成“AUG”“AGA”“GCU”,同樣發(fā)生了移碼突變,在這種情況下病毒也不能夠生存。因此對于插入和缺失突變,我們無需擔(dān)心。
點突變意味著核苷酸鏈上單個核苷酸發(fā)生了改變,改變的方式多種多樣,一種核苷酸可能會突變成其他三種核苷酸中的任意一種,我們?nèi)耘f以RNA序列“AUG GAG AGC”為例進(jìn)行解釋。如果這段序列第四位的G突變成為A,那么這段序列就會從原來的“AUG GAG AGC”變?yōu)椤癆UG AAG AGC”此時僅有一個密碼子發(fā)生了改變,而其他的序列并沒有發(fā)生改變。我們將這種類型的變異成為點突變。點突變是否會對病毒產(chǎn)生影響呢?答案是可能會對病毒產(chǎn)生影響,但對病毒是有利還是有害卻是不一定的。
在病毒的基因組中,除了基因區(qū)域外,還含有一部分與基因無關(guān)的區(qū)域,發(fā)生在這些位置上的突變通常情況下并不會影響到病毒的生存。由于密碼子的簡并性、氨基酸的相似性等一系列因素,發(fā)生在基因區(qū)域的突變也并不一定會影響到病毒的復(fù)制和繁殖。


 流感病毒突變的啟示  
我們可以這樣理解,在大部分情況下,病毒發(fā)生的突變對病毒的改變微乎其微,且很多突變對于病毒而言是有害的。那么是不是所有的突變都是這樣的呢?答案是否定的。盡管病毒突變的概率相對較低(仍舊比含有染色體的生物突變率高),且中性突變和有害突變的概率要高于有利突變,但我們?nèi)圆荒軐Σ《镜粢暂p心。
病毒的復(fù)制速度驚人,在進(jìn)入宿主細(xì)胞后,病毒會在短時間內(nèi)接管細(xì)胞的控制權(quán),利用細(xì)胞內(nèi)儲存的物質(zhì)和能量在短時間內(nèi)大量的復(fù)制自身,在細(xì)胞破裂時,釋放出成千上萬的病毒粒子。在這種情況下,突變的概率即使再低也會產(chǎn)生大量變異的病毒,倘若發(fā)生的突變是對病毒有利的,發(fā)生突變的病毒往往會更容易存活,進(jìn)而產(chǎn)生更多的后代,使得越來越多的后代帶有這種變異,病毒也就慢慢發(fā)生了進(jìn)化。
對于上述過程,人們感受最為明顯的應(yīng)當(dāng)是流感疫苗的變化。在秋冬季節(jié),我們往往需要接種流感疫苗,并且流感疫苗每年都需要進(jìn)行接種,并不能像其他疫苗一樣一次接種就能終身免疫。究其原因,仍舊是流感病毒的進(jìn)化速度相對較快。
人體的免疫系統(tǒng)能夠識別流感病毒靠的是免疫細(xì)胞對流感病毒上的血凝素(H蛋白)和神經(jīng)氨酸酶(N蛋白)的辨別,但由于流感病毒的快速傳播,大量的流感病毒在復(fù)制過程中極有可能發(fā)生突變。若突變發(fā)生在這兩種蛋白上,哪怕是很小的改變都會導(dǎo)致識別失敗,因此流感病毒的疫苗也會隨著流感病毒的變異而失效。
中國科研團(tuán)隊近期所發(fā)現(xiàn)的新冠病毒上的149個突變位點,大部分都是無義突變,即這種突變并不會改變病毒的結(jié)構(gòu),少量的有義突變在大部分情況下也不會對病毒產(chǎn)生顯著的影響,而所謂的S型和L型僅僅是描述了一個功能無關(guān)緊要的基因上某一個位點的變化情況,對新冠病毒在進(jìn)化學(xué)上進(jìn)行了區(qū)別,病毒本身并沒有產(chǎn)生太大的變異,我們也無需對此過于恐慌。
總而言之,病毒的變異并沒有我們想象中的那么可怕,但仍需警惕發(fā)生在特定位點、特定基因上的突變。當(dāng)然,這種工作需要交給病毒學(xué)家來進(jìn)行。作為普通人的我們需要做的是保護(hù)好自己,戴好口罩,勤洗手,少參加聚會,多進(jìn)行鍛煉。


本文刊發(fā)于《科學(xué)畫報·新知版》2020年第4期。

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