（一）“四金”繳納與稅收政策規(guī)定不一致
殘疾人就業(yè)企業(yè)在實(shí)際進(jìn)行基本養(yǎng)老保險(xiǎn)、基本醫(yī)療保險(xiǎn)、失業(yè)保險(xiǎn)和工傷保險(xiǎn)等社會保險(xiǎn)（下簡稱“四金”）繳納時(shí)，存在以下問題：一是繳納時(shí)間與政策規(guī)定時(shí)間不一致。企業(yè)的正常人員和殘疾人員的“四金”一般都是按季或半年匯總繳納。二是繳納方式不符合政策規(guī)定。社保局收取“四金”開具的《行政事業(yè)性收費(fèi)發(fā)票》一般為一張且不區(qū)分人員類別。這與總局、民政部、殘聯(lián)《關(guān)于促進(jìn)殘疾人就業(yè)稅收優(yōu)惠政策征管辦法的通知》（國稅發(fā)[2007]67號）中“減免稅申請及審批”第一項(xiàng)規(guī)定：“納稅人在每月提出減免稅申請時(shí)，須提交當(dāng)月為殘疾人繳納的社會保險(xiǎn)費(fèi)記錄和當(dāng)月向殘疾人通過銀行等金融機(jī)構(gòu)實(shí)際支付的工資憑證。”相違背，存在風(fēng)險(xiǎn)。部分企業(yè)存在以繳納農(nóng)村社會養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)代替基本養(yǎng)老保險(xiǎn)等現(xiàn)象。對符合社會保障部門規(guī)定的繳費(fèi)最高年齡界限以下的人員，企業(yè)必須按照規(guī)定為其繳納基本養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)，不能以農(nóng)村社會養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)代替。
（二）納稅人變通政策造成的風(fēng)險(xiǎn)
新政策實(shí)行限額退稅后，企業(yè)實(shí)際稅收負(fù)擔(dān)與實(shí)現(xiàn)稅款直接相關(guān)，為了盡量少繳稅款，一般企業(yè)通常采用的少記收入少記銷項(xiàng)稅額、賬外經(jīng)營等逃避繳納稅款手段，逐步成為福利企業(yè)可能采用的方式。部分企業(yè)通過對安置殘疾人員突增大幅度增加退稅款，部分企業(yè)銷售收入增加而應(yīng)納稅額明顯減少。
因?yàn)榭梢韵硎苋~退稅，有些企業(yè)不用擔(dān)心稅負(fù)過高，想盡辦法偷逃、轉(zhuǎn)移稅收，使得福利企業(yè)的增值稅平均稅負(fù)明顯高于一般企業(yè)。表現(xiàn)為：為他人代開或虛開發(fā)票，收取費(fèi)用；在采購原材料時(shí)不按規(guī)定索取專用發(fā)票，以普通發(fā)票或白條入賬，進(jìn)項(xiàng)稅額的抵扣不抵，增值稅專用發(fā)票可要而不要，以此壓低原料購進(jìn)價(jià)格；關(guān)聯(lián)企業(yè)之間轉(zhuǎn)移稅負(fù)至福利企業(yè)，一方少繳，另一方多退。同時(shí)，企業(yè)還外購部分貨物用于銷售，申請退稅，按規(guī)定外購貨物直接銷售是不能退稅的。這些都存在較大的涉稅風(fēng)險(xiǎn)，需要納稅人注意。
（三）企業(yè)財(cái)務(wù)管理不規(guī)范造成的風(fēng)險(xiǎn)
主要表現(xiàn)在：一些企業(yè)賬簿設(shè)置不健全，沒有原材料、產(chǎn)成品明細(xì)賬，僅憑自制憑證確定產(chǎn)品成本，隨意性大；企業(yè)的現(xiàn)金管理混亂，生產(chǎn)經(jīng)營過程中大量使用現(xiàn)金交易，又缺乏對現(xiàn)金的有效監(jiān)控；有的企業(yè)的會計(jì)核算明顯失真，與經(jīng)營常規(guī)不符；企業(yè)費(fèi)用支出等缺乏真實(shí)有效憑據(jù)，成本費(fèi)用超標(biāo)準(zhǔn)列支，用白條、收據(jù)、自制單據(jù)列支支出，還有個(gè)人消費(fèi)、福利費(fèi)支出、非本單位人員支出進(jìn)入企業(yè)費(fèi)用。
（四）殘疾人員上崗“名不符實(shí)”的風(fēng)險(xiǎn)
國家在稅收政策上雖然明確了企業(yè)殘疾用工的比例和最低人數(shù)，但是仍有部分在這上面“做文章”。一些企業(yè)采用靈活的用工辦法，雖然長期使用殘疾人，并達(dá)到了一定的比例和人數(shù)，但是在實(shí)際工作中，殘疾人既有長期掛名不上崗、臨時(shí)“客串”的，又有一證多戶等違法現(xiàn)象。還有不少殘疾人在多個(gè)企業(yè)掛名上班，給稅務(wù)檢查當(dāng)擺設(shè)。而實(shí)際上有時(shí)候它們使用健全人在工作，殘疾人的實(shí)際上崗率到不到規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)，企業(yè)只是利用殘疾人騙取退稅款。
（五）延期申請退稅的風(fēng)險(xiǎn)
延期申請退稅，造成企業(yè)實(shí)際銷售情況不能核實(shí)或者準(zhǔn)確核實(shí)，為以后造成隱患，有可能得不償失。按照現(xiàn)行政策規(guī)定，企業(yè)在每月申請退稅，但部分審批與實(shí)物核對往往成為形式。如每月生產(chǎn)的貨物因受時(shí)效限制在下月申請退稅時(shí)都已售出無法核實(shí)，更為突出問題的是企業(yè)普遍存在跨月申請現(xiàn)象，個(gè)別企業(yè)存在跨季跨年申請退稅的現(xiàn)象。
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