人類基因組草圖,拉開了未來精準醫(yī)療的帷幕。
首先,從中心法則講起:遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA到蛋白質(zhì)。這一過程,完成了遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯,信息的維度也相應(yīng)呈數(shù)量級的增加。從基因的角度來看,人類大約僅有2萬個基因,但是通過轉(zhuǎn)錄的調(diào)控、翻譯的修飾等,信息將上升1~2個數(shù)量級。再經(jīng)過蛋白的修飾、蛋白與蛋白的相互作用等,蛋白行使生命活動的相應(yīng)功能。
所以,在廣義的生命活動里,基因更像是一個藍圖,這張藍圖更多描繪的是未來事情發(fā)生的可能性?;蛲蛔兒捅磉_的檢測在很多情況下不能直接反應(yīng)疾病蛋白質(zhì)的活性和免疫系統(tǒng)的狀態(tài),因此在很多情況下無法準確的預(yù)示藥效和指導(dǎo)新藥研發(fā)和臨床用藥。
以腫瘤為例,患者可能會攜帶一個致癌基因的突變,但這個突變會不會導(dǎo)致增值的異常,隨之可能會帶來腫瘤,仍是不確定的。因此,是否真的會導(dǎo)致腫瘤,這就需要許多信息的整合去整體的預(yù)測。
但如果站在蛋白質(zhì)的水平上,蛋白質(zhì)表達與否、表達量的多少,這與基因組、轉(zhuǎn)錄組層面的信息往往并不一致。蛋白質(zhì)的修飾,在功能調(diào)節(jié)上起更加重要的作用,特別是磷酸化修飾,往往代表蛋白的激活與否,與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)。蛋白質(zhì)的修飾和活性是在基因?qū)用鏌o法檢測和預(yù)測的。雖然相比于研究基因組學(xué),蛋白的相互作用信息量龐大,但是好處在于只要知道了關(guān)鍵蛋白和相關(guān)疾病的關(guān)系,就可以直接應(yīng)用于臨床。
基因組技術(shù)在過去十幾年創(chuàng)造了巨大價值。未來,蛋白質(zhì)組學(xué)也同樣具有廣闊的發(fā)展價值,腫瘤精準醫(yī)療的蛋白質(zhì)組學(xué)時代也在逐步來臨。
團隊來自北大,技術(shù)源于諾獎
盡管代表蛋白激活與否的磷酸化激酶,其功能意義經(jīng)過幾十年基礎(chǔ)研究已經(jīng)較為清晰,重要性早已得到公認,但一直缺乏高效穩(wěn)定的檢測技術(shù)。嘉華藥銳科技(珠海)有限公司(以下簡稱嘉華藥銳)則采用多重靶向蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜檢測技術(shù),助力新藥研發(fā),提高精準治療效果。
嘉華藥銳是一家聚焦于腫瘤早篩和制藥領(lǐng)域的蛋白組學(xué)公司,創(chuàng)始人&CEO鄭乃中,北大細胞生物學(xué)博士,曾在北大從事多年的研究工作,主要研究領(lǐng)域是腫瘤遷移方向、神經(jīng)發(fā)育方向和基因編輯方向,論文發(fā)表于PNAS、Genetics等期刊。
2015年,鄭乃中作為美因基因(現(xiàn)已在港交所提交IPO申請)聯(lián)合創(chuàng)始人,帶領(lǐng)美因基因從0到1。也是因為在美因任職時期深耕于基因組學(xué)領(lǐng)域,鄭乃中發(fā)現(xiàn),隨著基因組學(xué)的發(fā)展,腫瘤領(lǐng)域的不少問題都被基因組學(xué)技術(shù)解決。
但是基因組學(xué)方面的應(yīng)用本身檢測的大部分是預(yù)測性的指標,并不能代表真正的生命活動進行的狀態(tài),這使得基因組學(xué)僅能解決20%的問題,大部分的問題更需要蛋白組學(xué)技術(shù)的介入,檢測蛋白組學(xué)的指標。
大量未滿足的臨床需求亟待新技術(shù)解決。
2019年,鄭乃中以蛋白組學(xué)為核心,創(chuàng)辦了嘉華藥銳,從基因測序跨越到蛋白測序。提起再次創(chuàng)業(yè)的跨行之舉,鄭乃中提到,“其實這兩個技術(shù)是'師出同門’,均來自于英國生物化學(xué)家弗雷德里克·桑格(FrederickSanger)。桑格也因蛋白質(zhì)和DNA測序于1958年和1980年兩次獲得諾貝爾化學(xué)獎。這兩個技術(shù)都是諾獎級別,也都在精準醫(yī)學(xué)領(lǐng)域奠定了研究基礎(chǔ)。”
不止核心技術(shù)“師出同門”,嘉華藥銳的核心人員也均“師出北大”。
鄭乃中的大師兄——董事長兼首席科學(xué)家李順成教授,師從Tony Pawson教授(英,美,加多國科學(xué)院士,八次提名諾貝爾獎)。此前,李順成教授的研究組開發(fā)并首創(chuàng)了利用蛋白相互作用結(jié)構(gòu)域特異性超親體的方法。從2006年至今,李順成教授在Nature,Cell,Mol.Cell,Science Signaling,PNAS,EMBOJ.等學(xué)術(shù)雜志上發(fā)表文章超50篇,并從2006年開始先后擔(dān)任加拿大國家蛋白質(zhì)組學(xué)和癌癥機理研究研發(fā)主席。
2013年5月和6月,李順成教授連續(xù)兩次在細胞雜志子刊Mol Cell上以通訊作者發(fā)表文章。截至2020年,李順成博士在高影響因子的國際雜志上發(fā)表了超過120篇文章。
此外,李順成教授還是加拿大西安大略大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物質(zhì)譜實驗室主任,他首創(chuàng)了西安大略大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一個高通量生物實驗室,該實驗室擁有多肽合成、蛋白表達純化、芯片打印、檢測和數(shù)據(jù)分析等一整套芯片技術(shù)研究、開發(fā)和應(yīng)用的先進儀器。李順成教授的實驗室應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)解碼蛋白質(zhì)修飾癌癥機理,開發(fā)超親體在癌癥的研究、診斷及治療中的應(yīng)用。
除了鄭乃中和李順成,嘉華藥銳的合伙人肖云、劉怡等也均來自北大,在臨床研究和IVD領(lǐng)域都有超過15年的從業(yè)經(jīng)驗。嘉華藥銳團隊成員彼此熟識多年,并且具有跨學(xué)科跨行業(yè)的科研與產(chǎn)業(yè)經(jīng)驗。
專利技術(shù)SH2 Superbinder:
提供從新藥靶點發(fā)現(xiàn)到臨床伴隨診斷的閉環(huán)應(yīng)用
在核心隊伍的帶領(lǐng)下,嘉華藥銳以2015年Nature發(fā)表的人類蛋白質(zhì)組草圖為研究基礎(chǔ),利用蛋白組學(xué)技術(shù),從蛋白層面重新定義腫瘤的分子分型。傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法想要更適用于臨床,有四點可以優(yōu)化。
首先是樣本制備的復(fù)雜性。傳統(tǒng)蛋白組學(xué)對樣本質(zhì)量要求極高,需蛋白三級結(jié)構(gòu)完整才能檢測,因此僅能使用新鮮冰凍組織樣本。其它樣本很難檢測到磷酸化信號(磷酸化蛋白組學(xué)是對腫瘤最直接的診斷方式,磷酸化修飾異常會導(dǎo)致多種疾病,包括癌癥或神經(jīng)變性疾病,通過對蛋白磷酸化過程的了解,能夠助力研究人體生理和病理的發(fā)生過程,進一步可將其轉(zhuǎn)化用于藥物開發(fā)和病理診斷)。
其次是傳統(tǒng)質(zhì)譜儀器操作復(fù)雜,自動化程度不高,對操作人員要求高,阻礙醫(yī)院內(nèi)大規(guī)模使用。在通常情況下,研究人員在進行質(zhì)譜分析之前,都采用離子交換層析或親和捕獲層析,如通過金屬氧化物親和層析來富集消化的蛋白中的磷酸肽。但是在這些富集的方法中存在分子間相互作用的固有局限性,導(dǎo)致在固液界面處存在位阻和擴散限制。
再而是傳統(tǒng)方法只適合檢測高豐度蛋白,但是磷酸化蛋白質(zhì)的豐度較低,低豐度蛋白很容易漏檢,而這些卻往往是真正可能的生物標志物。
最后是傳統(tǒng)基于抗體的方法很難做到大通量和普適,抗體靈敏度和特異性提高是一個很艱難的過程。抗體由于識別的是蛋白的表面抗原,天然就會帶來較高假陽性和假陰性,是一種有偏方法,因此很難作為蛋白組學(xué)工具。
嘉華藥銳利用專利技術(shù)超親體技術(shù),(SH2 Superbinder,酪氨酸磷酸化修飾蛋白質(zhì)富集技術(shù)),可不依賴蛋白的三級結(jié)構(gòu),經(jīng)過變性的蛋白依然可以檢測。石蠟切片(FFPE)樣本、福爾馬林固定樣本、穿刺樣本、血液樣本,均能完成檢測。嘉華藥銳這種基于抗體的有偏蛋白富集技術(shù),有效提高臨床應(yīng)用的靈敏度、特異性、穩(wěn)定性。
通過酪氨酸磷酸化修飾蛋白質(zhì)富集技術(shù),能直接檢測靶向藥和免疫藥用藥位點的激活,提供酪氨酸激酶磷酸化譜全譜信息,整合定向蛋白質(zhì)組學(xué)分析策略,對痕量樣本進行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,準確測定藥物靶點蛋白或免疫系統(tǒng)調(diào)控蛋白的活性狀態(tài),從而為靶向用藥和免疫治療的精準使用提供有效的信息。
在應(yīng)用方面,目前酪氨酸磷酸化修飾蛋白質(zhì)富集技術(shù)的應(yīng)用方向可分為制藥到臨床兩大領(lǐng)域。
在制藥應(yīng)用方面,利用酪氨酸磷酸化修飾蛋白質(zhì)富集技術(shù),可系統(tǒng)繪制所有酪氨酸激酶通路,繪制免疫反應(yīng)信號通路,定義腫瘤分子分型;還可定量分析發(fā)現(xiàn)發(fā)病機理與抗藥原因,發(fā)現(xiàn)“新”的藥物治療靶點和生物標志物Biomarker。
在臨床應(yīng)用方面,利用磷酸化修飾蛋白質(zhì)富集技術(shù)可發(fā)現(xiàn)每一個病人靶向治療和免疫治療的蛋白靶點,指導(dǎo)個性化用藥;還可追蹤耐藥和復(fù)發(fā)在蛋白靶點層面的變化,指導(dǎo)用藥方案調(diào)整。
嘉華藥銳的專利技術(shù)提供了從新藥靶點發(fā)現(xiàn)到臨床伴隨診斷的全鏈條應(yīng)用。目前,該核心專利PCT已獲批準,中國專利已獲得授權(quán)。
基于靶向蛋白組學(xué)的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué):
從科研服務(wù)和藥企CRO、LDT、IVD直至創(chuàng)新藥物研發(fā)
目前,嘉華藥銳所提供的主要服務(wù)也多集中在為創(chuàng)新型藥企提供CRO服務(wù)和與臨床專家合作進行前瞻性研究方面。
提及具體發(fā)展階段,鄭乃中介紹道:“目前在臨床方向嘉華藥銳正處于從科研服務(wù)向LDT邁進的過程中,是一個技術(shù)穩(wěn)定到逐步放量的過程。在藥企方向,得益于政策的助力,目前國內(nèi)整個創(chuàng)新藥的態(tài)勢發(fā)展明朗。國內(nèi)從最開始的fast follow到現(xiàn)在真的有創(chuàng)新藥企愿意去做不一樣的靶點,去做沒有人研究過的機制。
“這些需求是傳統(tǒng)CRO所不能解決的,因此我們也積極與賽默飛等企業(yè)合作,共同利用蛋白組學(xué)去實現(xiàn)源頭的創(chuàng)新。在臨床方面,我們則與協(xié)和等幾十家大型三甲醫(yī)院建立了合作關(guān)系,去幫助臨床入組的篩選、臨床伴隨診斷等。”
提及未來的發(fā)展,鄭乃中表示:“在目前的發(fā)展過程中,嘉華藥銳通過與創(chuàng)新藥企和臨床專家合作,去助力癌癥精準醫(yī)療水平的提高、推動建立蛋白組學(xué)質(zhì)譜檢測的行業(yè)標準。
“我們也會同步開發(fā)免疫技術(shù)平臺上的IVD體外伴隨診斷產(chǎn)品,并通過不斷積累的數(shù)據(jù)去加速Biomarker的發(fā)現(xiàn)和創(chuàng)新藥物的研發(fā)。最終,嘉華藥銳兩方向的努力將會勝利“會師”,積累臨床疾病的靶點信息數(shù)據(jù)和大量藥物作用靶點的數(shù)據(jù),當數(shù)據(jù)打通的時候,嘉華藥銳會用數(shù)據(jù)來對接'醫(yī)’、'藥’這兩個巨大的領(lǐng)域,達到基于靶向蛋白組學(xué)的轉(zhuǎn)化?!?/span>
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