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MedCalc:分類資料的統(tǒng)計分析
數(shù)據(jù)小兵
>《待分類》
2022.03.14
關(guān)注
分類資料的統(tǒng)計分析。
主要設(shè)計【交叉表】菜單和【檢驗】兩個菜單,前者基于原始數(shù)據(jù)記錄,后者基于匯總頻數(shù)資料。
1.卡方檢驗
1.1 單變量卡方檢驗
單變量卡方,其分析目的是檢驗擬合優(yōu)度,英文叫做goodness-of-fit test。用于判斷實際觀測頻數(shù)的分布是否服從某一理論期望頻數(shù)分布,比如判斷某個分類變量中各分類水平的構(gòu)成比是否相同。P<0.05,則不同分類水平構(gòu)成比的差異有同統(tǒng)計學(xué)意義。
medcalc既可處理原始數(shù)據(jù)記錄,也可以處理匯總的頻數(shù)數(shù)據(jù)資料。前者用【統(tǒng)計】→【交叉表】菜單,后者用【檢驗】→【卡方檢驗】菜單。
令人很驚喜的是,medcalc可以執(zhí)行Cochran-Armitage test for trend,而SPSS目前是用其他算法替代的。
1.2 兩獨立樣本的Pearson 卡方檢驗
Pearson χ2 用于檢驗兩個或多個分類變量總體率或構(gòu)成比是否有差異或兩個變量之間是否關(guān)聯(lián)。可用于RC表,含四格表。
四格表要求每個格子的期望頻數(shù)T≥5,且總例數(shù)n≥40;
RC表不宜有超過20%以上的格子的T<5,或有任意的一個格子的T<1。
可惜的是,medcalc和SPSS一樣,也不能直接實現(xiàn)多組間卡方分割的多重比較操作。需要用戶手工分割后,分開做多個2*2卡方檢驗匯總結(jié)果后進行校正得到最終結(jié)論。
好處是,隨p值同步給出了列聯(lián)系數(shù),用作效應(yīng)量的評估或兩個分類變量間的關(guān)聯(lián)程度評估。
2.Fisher 精確概率檢驗
Fisher′s exact test,確切概率法。主要(優(yōu)先)用于2x2四格表,其他表格需要單獨指定。H0為兩各變量無關(guān)聯(lián)或期望比例無差異。
MedCalc不提供Yates連續(xù)校正功能,因此如果四格表資料不滿足Pearson χ2 檢驗的條件(T≥5,n≥40)時,可使用Fisher精確檢驗,通常認為該P值對所有樣本含量都是準確的。
小兵資料補充:
關(guān)于交叉表卡方檢驗、fisher精確檢驗的使用條件
https://mp.weixin.qq.com/s/SwPK3XnWAfhweyY54OjwEA
3.配對資料之McNemar檢驗
McNemar檢驗用于配對四格表資料,分析配對資料中控制組合處理組的頻率或比例是否有差異。McNemar檢驗,只適用于二分類變量。
4.相關(guān)性資料的Cochran's Q test
區(qū)組設(shè)計中,如果響應(yīng)變量只有兩種結(jié)局“成功”或“失敗”,這種資料可使用cochran q檢驗。區(qū)組內(nèi)的個案相當于是配對,對個體差異進行控制。
H0為假設(shè)各處理組效應(yīng)相同。
5.四格表相對危險度RR
Relative Risk,簡稱RR,又稱為風(fēng)險比risk ratio或率比rate ratio,率比這個更好理解。它是隊列研究中暴露組和非暴露組死亡率或發(fā)病率的比值,表示暴露組發(fā)病或死亡的危險性為非暴露組的倍數(shù)。
RR>1 暴露因素可能增加疾病危險
RR<1 暴露因素可能是保護因素
RR是蘋果暴露與疾病關(guān)聯(lián)的一個點估計值,判斷RR的意義時要以95%CI為準。
鉤體病人發(fā)病率3.31%,健康人發(fā)病率0.12%,率比為27.04,即RR。
相對危險度大小與疾病關(guān)聯(lián)的強度,見上表。
6.臨床試驗需治療人數(shù)NNT
小兵不是醫(yī)學(xué)專業(yè),所以對這個NNT是從未接觸過。這里僅做簡單學(xué)習(xí),有相關(guān)使用需求的人可以多了解,至少要知道m(xù)edcalc可以計算NNT。
什么是NNT?NNT是指避免1例不良結(jié)局的發(fā)生或得到1例有益結(jié)果需要治療的病例數(shù)。它是治療特異性指標,用來描述治療組與對照組在獲得某個特定臨床結(jié)局上的差異。
????NNT相對來說更為直觀、易懂,而且更便于我們做出醫(yī)療決策。
怎么解釋呢?小兵給大家搬一下李志輝老師圖書中的結(jié)果描述:
NNT值為3.58,表明每治療3.58個發(fā)生中等到嚴重的術(shù)后疼痛的對象,采用對乙酰氨基酚治療后,會有1個對象獲得至少50%的緩解,而對照組卻沒有1例獲得相同的效果。說明對乙酰氨基酚對緩解急性術(shù)后疼痛有效果。
顯然,NNT越小越好。而當NNT為負數(shù)時,又稱為NNH,表明治療措施產(chǎn)生的有害效應(yīng)。
7.病例對照研究的OR值
odd ratio,簡稱OR,又稱為機會比,比值比,在病例對照研究匯總也稱作是交叉乘積比。具體上,它表示暴露者患某種疾病的危險性較未暴露者高的程度。
or<1 保護因素
or=1 無影響
or>1 危險因素
隊列研究中,也用作相對危險度RR的估計值,在隊列研究中可直接計算RR中,所以一般不計算OR值。當研究疾病的發(fā)病率較低時,OR值近似于RR值,故在回顧性研究中可用OR之估計RR值,其解釋與RR值相同。
如何區(qū)分RR和OR是另外一個知識點,小兵后面會專門撰寫新的資料來進行解讀學(xué)習(xí)。
8.分類資料的條形圖
條圖,通??v軸表示數(shù)量,橫軸表示分組標識。
8.1 簡單條圖
菜單:統(tǒng)計→交叉表→頻率條形圖
8.2 復(fù)式條形圖
小兵資料補充:
基于SPSS統(tǒng)計軟件的條形圖,如下:
SPSS條形圖默認是豎條,如何做成橫著的橫條圖?
https://mp.weixin.qq.com/s/Jsb2IkkDszWCoxuOY3BqHw
SPSS頻數(shù)表、頻數(shù)分布圖制作
https://mp.weixin.qq.com/s/u1tjdNLuN25rUUhFi1VSng
8.3 構(gòu)成比條形圖
百分條圖。
我是尾巴
這是《MedCalc統(tǒng)計分析方法及應(yīng)用》讀書筆記,原書作者李志輝老師,感謝寫出這么好的專業(yè)圖書。
第1章 MedCalc:入門基礎(chǔ)
第2章 MedCalc:數(shù)據(jù)管理
第3章 MedCalc:描述統(tǒng)計
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