在早期文明中，哲學(xué)和科學(xué)是不分家的。那時哲學(xué)所涉及的范圍比今天狹義上哲學(xué)的范圍要大得多。哲學(xué)在西方的語言中，是由前綴“熱愛”和詞干“智慧”構(gòu)成。我們現(xiàn)在一般認(rèn)為，這個詞是畢達哥拉斯創(chuàng)造的，當(dāng)然也有人有不同的意見。
在畢達哥拉斯的時代里，哲學(xué)和自然科學(xué)是分不開的。畢達哥拉斯認(rèn)為，數(shù)是世界的本源，萬物皆數(shù)，這是他對世界的認(rèn)識。從那個時候開始，古希臘人就一直在思考關(guān)于世界本源的問題。
到了亞里士多德時期，他把哲學(xué)分為了形而上的和形而下的，形而下的被他稱為物理學(xué)，就是我們今天所說的自然科學(xué)，形而上的則是在自然科學(xué)之上的哲學(xué)和方法論。
不過，亞里士多德的劃分并沒有從此將哲學(xué)研究和自然科學(xué)研究分開。到了中世紀(jì)，哲學(xué)研究主要體現(xiàn)為對神學(xué)的研究，而自然科學(xué)的研究則變成了對實驗科學(xué)的研究，兩者會產(chǎn)生一定的矛盾。因為實驗看到的結(jié)果可能用神學(xué)解釋不了。
等到了歐洲中世紀(jì)，著名經(jīng)院派哲學(xué)家和神學(xué)家阿奎納出現(xiàn)時，他基于亞里士多德的學(xué)說和科學(xué)方法，將科學(xué)和神學(xué)合二為一，寫成了《神學(xué)大全》這一巨著。這套書今天碼放在書架上，能有一米多長。阿奎納的做法產(chǎn)生了兩個影響，一方面，他把科學(xué)放到了神學(xué)的保護之下，讓教士們可以不受干擾地研究科學(xué)；另一方面，也導(dǎo)致了科學(xué)研究的教條主義。簡單說，就是但凡亞里士多德說的都不能改。到了中世紀(jì)后期，亞里士多德的結(jié)論更是被教會定為了金科玉律。人們面對自然現(xiàn)象的時候，首先會嘗試用亞里士多德的理論來解釋。但是隨著時代發(fā)展，越來越多的現(xiàn)象無法再用亞里士多德的理論解釋的時候，科學(xué)家提出了新的科學(xué)定理，同時也就推翻了亞里士多德的結(jié)論。這也是為什么近代以來人們常說，科學(xué)研究的過程幾乎等同于推翻亞里士多德結(jié)論的緣故。
等到近代科學(xué)革命之前，科學(xué)和哲學(xué)雖然還沒有完全分家，但是研究自然科學(xué)的學(xué)者們會強調(diào)他們研究的是自然哲學(xué)，也就是科學(xué)。
我們都知道牛頓有本影響世界的巨著，叫做《自然哲學(xué)的數(shù)學(xué)原理》，其實就是科學(xué)背后的數(shù)學(xué)原理。但是當(dāng)時沒有“科學(xué)家”這個詞，因此牛頓和之前的笛卡爾等人都被稱為自然哲學(xué)家。而另外一些大學(xué)者，包括笛卡爾、萊布尼茨和培根，他們既是自然科學(xué)家，也是哲學(xué)家。又或者，像德國古典哲學(xué)的創(chuàng)始人康德，他的科學(xué)素養(yǎng)也很深，早年也研究過科學(xué)。只是后來，他把注意力放在了哲學(xué)上，特別是認(rèn)識論上。
“科學(xué)家”一詞直到1834年才由英國神學(xué)家和科學(xué)史家威廉·惠威爾（William Whewell）發(fā)明出來。從此，人們也就不再稱呼科學(xué)為自然哲學(xué)了。此后，由于學(xué)科越分越細(xì)，就很難再有像亞里士多德、笛卡爾和萊布尼茨這樣既是科學(xué)家，又是哲學(xué)家的人了。到了20世紀(jì)又出現(xiàn)了一些學(xué)者，專門研究如何有效地進行科學(xué)研究，他們被稱為科學(xué)哲學(xué)家，比如杜威、波普爾等人。
從哲學(xué)和科學(xué)的發(fā)展歷史你可以看出，它們是緊密相連的。事實上，最了不起的科學(xué)家，通常都有獨到的哲學(xué)見解。
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