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《柳葉刀》子刊:研究表明后口咽唾液樣本可檢測(cè)新冠病毒,發(fā)病首周唾液病毒載量最高| COVID-19一周精選【3.21-3.27】

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截至3月27日12時(shí),CNGBdb病毒數(shù)據(jù)庫(VirusDIP):

> 總數(shù)據(jù)量:GISAID EpiCoV? 1871條,CNGBdb新冠病毒數(shù)據(jù)庫204 條;

> 上周新增(3.21~3.27):GISAID EpiCoV? 906條,CNGBdb新冠病毒數(shù)據(jù)庫10條;

> 由CNGBdb共享發(fā)布:24

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COVID-19一周研究速覽


> 標(biāo)題:SARS-CoV-2感染后口咽(深喉)唾液病毒載量和血清抗體反應(yīng)的時(shí)間分布:一項(xiàng)觀察性隊(duì)列研究

> 期刊:The Lancet Infectious Diseases

> DOI:https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30196-1

> 摘要:

背景:2019冠狀病毒病(COVID-19)導(dǎo)致嚴(yán)重的社區(qū)和醫(yī)院疫情。目前還沒有關(guān)于SARS-CoV-2患者的系列呼吸道病毒載量和血清抗體反應(yīng)的綜合數(shù)據(jù)。鼻咽拭子和咽喉拭子通常用于呼吸道感染的連續(xù)病毒載量監(jiān)測(cè),但收集這些樣本會(huì)給患者帶來不適,并將衛(wèi)生保健工作者置于危險(xiǎn)之中。我們的目的是確定后口咽(深喉)唾液樣本中SARS-CoV-2的連續(xù)呼吸道病毒載量和血清抗體反應(yīng)。

方法:我們?cè)谙愀鄣膬杉裔t(yī)院做了一項(xiàng)隊(duì)列研究。我們納入了確診的COVID-19患者,并獲得了血液、尿液、后口咽唾液和直腸拭子的樣本。通過RT-qPCR檢測(cè)病毒載量。使用EIA檢測(cè)SARS-CoV-2內(nèi)核蛋白(NP)和表面S蛋白受體結(jié)合域(RBD)的抗體水平。進(jìn)行了全基因組測(cè)序,以確定感染期間可能發(fā)生的突變。

結(jié)果:在2020年1月22日至2020年2月12日期間, 23例患者納入研究(中位年齡62歲[范圍37-75])。后口咽唾液或其他呼吸道標(biāo)本中病毒載量中位數(shù)為5.2 log10拷貝/mL(四分位距 4.1-7.0)。唾液病毒載量在癥狀出現(xiàn)后第一周最高,隨后隨時(shí)間下降。1例患者在癥狀出現(xiàn)25天后檢測(cè)到病毒RNA。年齡增加與病毒載量升高相關(guān)。16例患者在出現(xiàn)癥狀后14天或更長(zhǎng)時(shí)間獲得血清樣本,抗NP IgG的血清陽性率為94% (n=15),88%抗NP IgM (n=14),100%抗RBD IgG (n=16),94%抗RBD IgM (n=15)??筍ARS-CoV-2 NP或抗SARS-CoV-2 RBD IgG水平與病毒中和效價(jià)相關(guān)。序列樣本未檢測(cè)到基因組突變。

結(jié)論:后口咽唾液樣本是非侵入性樣本,患者和衛(wèi)生保健工作者更容易接受。與嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合征不同,COVID-19患者在發(fā)病時(shí)的病毒載量最高,這可以解釋該流行病的快速傳播特性。這一發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了嚴(yán)格控制感染和早期對(duì)高危個(gè)體單獨(dú)或聯(lián)合使用有效抗病毒藥物的重要性。血清學(xué)檢測(cè)可作為RT-qPCR診斷的補(bǔ)充。


> 標(biāo)題:鑒定馬來亞穿山甲中與SARS-CoV-2相關(guān)的冠狀病毒

> 期刊:Nature

> DOI:https://doi.org/10.1038/s41586-020-2169-0

> 摘要:目前在中國(guó)和其他地區(qū)爆發(fā)的病毒性肺炎與一種新型冠狀病毒SARS-CoV-2有關(guān)。盡管蝙蝠可能是SARS-CoV-2的自然宿主,但任何中間宿主的身份都是未知的。在這里,我們報(bào)告了在中國(guó)南部緝私行動(dòng)中查獲的馬來亞穿山甲(Manis javanica)中發(fā)現(xiàn)的與SARS-CoV-2相關(guān)的冠狀病毒。宏基因組測(cè)序鑒定了與穿山甲相關(guān)的冠狀病毒,它們屬于SARS-CoV-2相關(guān)冠狀病毒的兩個(gè)亞系,其中一個(gè)在受體結(jié)合域與SARS-CoV-2表現(xiàn)出很強(qiáng)的相似性。穿山甲冠狀病毒的多個(gè)譜系的發(fā)現(xiàn)及其與SARS-CoV-2的相似性表明,應(yīng)考慮穿山甲是新冠病毒的可能宿主,并嚴(yán)令禁止野生動(dòng)物市場(chǎng)交易穿山甲,以防止人畜共患傳播。


> 標(biāo)題:患有COVID-19母親所生嬰兒體內(nèi)的抗體

> 期刊:JAMA

> DOI:10.1001/jama.2020.4861

> 主要內(nèi)容:2020年2月開始對(duì)SARS-CoV-2的IgG和IgM抗體進(jìn)行檢測(cè)。2020年3月4日,中華人民共和國(guó)國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì)發(fā)布《2019年新冠狀病毒肺炎預(yù)防控制方案(COVID-19)第七版》,新增血清學(xué)診斷標(biāo)準(zhǔn)。之前一項(xiàng)針對(duì)9名孕婦及其嬰兒的研究發(fā)現(xiàn),基于RT-PCR檢測(cè)的SARS-CoV-2母嬰傳播沒有發(fā)生。我們將這些新標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于6名已確診的COVID-19孕婦和她們的嬰兒,因?yàn)檠鍖W(xué)標(biāo)準(zhǔn)可以對(duì)新生兒的感染進(jìn)行更詳細(xì)的調(diào)查。

預(yù)印本




預(yù)印本網(wǎng)站:medRxiv

> 標(biāo)題:Meplazumab治療COVID-19:一項(xiàng)開放標(biāo)記、同時(shí)對(duì)照的附加臨床試驗(yàn)

> 主要結(jié)論:Meplazumab有效地改善了SARS-CoV-2肺炎患者的康復(fù),具有良好的安全性。我們的結(jié)果支持開展meplazumab治療COVID-19肺炎的大規(guī)模研究。

> DOI: https://doi.org/10.1101/2020.03.21.20040691



預(yù)印本網(wǎng)站:bioRxiv

> 標(biāo)題:SARS-CoV-2人蛋白-蛋白相互作用圖譜揭示了藥物作用靶點(diǎn)和潛在的藥物再利用

> 主要結(jié)論:我們確定了67種可用藥的人類蛋白或宿主因子,這些蛋白或宿主因子由69種現(xiàn)有FDA批準(zhǔn)的藥物、臨床試驗(yàn)藥物和/或臨床前靶向化合物,我們目前正在評(píng)估這些藥物對(duì)SARS-CoV-2感染試驗(yàn)的有效性。宿主依賴因子介導(dǎo)病毒感染的鑒定可能為開發(fā)廣泛有效的針對(duì)SARS-CoV-2和其他致命冠狀病毒株的抗病毒治療提供重要的分子靶點(diǎn)。

> DOI: https://doi.org/10.1101/2020.03.22.002386



預(yù)印本網(wǎng)站:medRxiv

> 標(biāo)題:SARS-CoV-2感染對(duì)男性性腺功能的影響:?jiǎn)沃行难芯?/span>

> 主要結(jié)論:本研究首次提供了COVID-19的醫(yī)療條件對(duì)男性性激素影響的直接證據(jù),提示在SARS-CoV-2感染后恢復(fù)的患者,特別是育齡男性,性腺功能的評(píng)估應(yīng)得到更多的關(guān)注。

> DOI:  https://doi.org/10.1101/2020.03.21.20037267

參考文獻(xiàn):

[1] To K K-W, Tsang O T-Y, Leung W-S, et al. Temporal profiles of viral load in posterior oropharyngeal saliva samples and serum antibody responses during infection by SARS-CoV-2: an observational cohort study [J]. The Lancet Infectious Diseases, 2020.

[2] Lam, T.T., Shum, M.H., Zhu, H. et al. Identifying SARS-CoV-2 related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2169-0.

[3] https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2763854.

[4] Huijie Bian, et al.Meplazumab treats COVID-19 pneumonia: an open-labelled, concurrent controlled add-on clinical trial.medRxiv. 24 March, 2020.

[5] David E. Gordon, et al.A SARS-CoV-2-Human Protein-Protein Interaction Map Reveals Drug Targets and Potential Drug-Repurposing. bioRxiv.23 March, 2020.

[6] Ling Ma, et al.Effect of SARS-CoV-2 infection upon male gonadal function: A single center-based study.medRxiv. 24 March, 2020.

*注:中文翻譯僅供參考,一切內(nèi)容以英文原文為準(zhǔn)。以上內(nèi)容僅代表文章作者本人觀點(diǎn),不代表深圳國(guó)家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)觀點(diǎn)或立場(chǎng)。

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