來(lái)自癌癥患者的血液樣本的高通量基因表達(dá)譜分析為開發(fā)用于早期檢測(cè)癌癥的新生物標(biāo)志物提供了寶貴的資源。雖然相關(guān)研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)開發(fā)了一些數(shù)據(jù)庫(kù),比如EVpedia和exoRBase等。然而,對(duì)于基于血液的專門用于癌癥早期檢測(cè)的高通量基因表達(dá)數(shù)據(jù),仍然缺乏一個(gè)全面的在線存儲(chǔ)庫(kù)。
BBCancer是一個(gè)web訪問的綜合開放資源,在當(dāng)前版本中,其包含來(lái)自正常人和15種癌癥類型(包括乳腺癌,卵巢交界性腫瘤,宮頸癌,結(jié)直腸癌,食道癌,胃癌,肝癌,肺癌,胰腺癌和前列腺癌)的7184個(gè)樣品的RNA表達(dá)數(shù)據(jù),其中包括5040個(gè)血液樣品。
BBCancer包括六種類型的RNA(19612個(gè)mRNA、10918個(gè)lncRNA、60306個(gè)circRNA、2568個(gè)miRNA、1231個(gè)piRNA和43459個(gè)tRFRNA)。