(一)試劑準(zhǔn)備
1 . TRIzol 試劑。
2 .氯仿
3 .異丙醇
4 . 75% 乙醇( DEPC H2O 配制)
5 . DEPC H2O
(二)操作步驟
1 . 樣品處理:
(1)培養(yǎng)細(xì)胞:收獲細(xì)胞 1-5×10 7 ,移入 1.5ml 離心管中,加入 1ml Trizol ,混勻,室溫靜置 5min 。
(2)組織:取 50-100mg 組織(新鮮或 -70 ℃ 及液氮中保存的組織均可)置 1.5ml 離心管中,加入 1ml Trizol 充分勻漿,室溫靜置5 min 。
2 .加入 0.2ml 氯仿,振蕩 15s ,靜置 2min 。
3 . 4 ℃ 離心, 12000g × 15min ,取上清。
4 .加入 0.5ml 異丙醇,將管中液體輕輕混勻,室溫靜置 10min 。
5 . 4 ℃ 離心, 12000g × 10min ,棄上清。
6 .加入 1ml 75% 乙醇,輕輕洗滌沉淀。 4 ℃ , 7500g × 5min ,棄上清。
7. 晾干,加入適量的 DEPC H 2 O 溶解( 65 ℃ 促溶 10-15min )。
(三)注意事項(xiàng)
1 .樣品量和 Trizol 的加入量一定要按步驟( 1 )的比例,不能隨意增加樣品量或減少 Trizol 量,否則會(huì)使內(nèi)源性 RNase 的抑制不完全,導(dǎo)致 RNA 降解。
2 .實(shí)驗(yàn)過程必須嚴(yán)格防止 RNsae 的污染。
二、總 RNA 定量
RNA 定量方法與 DNA 定量相似。 RNA 在 260nm 波長處有最大的吸收峰。因此,可以用 260nm 波長分光測(cè)定 RNA 濃度, OD 值為 1 相當(dāng)于大約 40 μ g/ml 的單鏈 RNA 。如用 1cm 光徑,用 ddH 2 O 稀釋 DNA 樣品 n 倍并以 ddH 2 O 為空白對(duì)照,根據(jù)此時(shí)讀出的 OD 260 值即可計(jì)算出樣品稀釋前的濃度:
RNA ( mg/ml ) =40 × OD 260 讀數(shù)×稀釋倍數(shù) (n)/1000
RNA 純品的 OD 260 /OD 280 的比值為 2.0 ,故根據(jù) OD 260 /OD 280 的比值可以估計(jì) RNA 的純度。若比值較低,說明有殘余蛋白質(zhì)存在;比值太高,則提示 RNA 有降解。
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