轉(zhuǎn)移性肝細(xì)胞癌,圖片來自Yale Rosen via Flickr。
作為一種與肝病和肝硬化相關(guān)聯(lián)的癌癥,肝細(xì)胞癌(HCC)經(jīng)常在晚期時(shí)才表現(xiàn)出癥狀。在全世界,它是癌癥死亡的第二大原因,但是迄今為止,它并沒有一種有效的療法。
美國加州大學(xué)舊金山分校計(jì)算健康科學(xué)研究所主任Atul Butte博士說,正如沒有治療方法的其他疾病那樣,需要理解和治療這種癌癥的數(shù)據(jù)可能明顯地存在于很少進(jìn)行過分析的數(shù)據(jù)庫中。
作為Butte實(shí)驗(yàn)室的一名前博士后學(xué)者,Bin Chen博士如今是加州大學(xué)舊金山分校計(jì)算健康科學(xué)研究所兒科教員。他近期在Gastroenterology期刊上發(fā)表一篇論文,涉及利用數(shù)據(jù)分析計(jì)算工具來鑒定HCC療法。
利用公開可獲得的基因表達(dá)數(shù)據(jù),他首先獲得HCC的分子疾病特征---研究了在癌變肝臟組織而不在正常的肝臟組織中上調(diào)表達(dá)或下調(diào)表達(dá)的274個(gè)基因。
隨后,他尋找已知靶向這些基因的藥物,結(jié)果令人吃驚地發(fā)現(xiàn)一種驅(qū)蟲藥的衍生物當(dāng)與標(biāo)準(zhǔn)的HCC治療藥物組合使用時(shí),高度有效地殺死移植到實(shí)驗(yàn)性小鼠體內(nèi)的癌變肝臟組織。
Chen說,“我們發(fā)現(xiàn)在移植到模式小鼠體內(nèi)的病人源性癌變肝臟組織接受6周治療之后,這些患病基因得到逆轉(zhuǎn)?!彼a(bǔ)充道,他開發(fā)出的這種方法的優(yōu)勢在于它同時(shí)靶向多個(gè)基因,而不是僅靶向單個(gè)基因突變。
Chen說,發(fā)現(xiàn)疾病的分子特征,隨后尋找抵抗這些特征的藥物,是一種治療病人的有前景的方法。這些病人可能每個(gè)人具有一組不同的癌癥突變,而且可能對一次僅靶向一種突變的藥物不作出反應(yīng)。
Chen說,“在這項(xiàng)研究中,病人具有類似的基因表達(dá)譜,但不是完全一樣的。在大多數(shù)情形下,癌癥具有很多突變,而且病人會(huì)復(fù)發(fā)。我們的方法可能被用來控制癌癥,使得它成為一種慢性疾病而不是一種致命性的疾病?!?/p>
僅有少量藥物對基因表達(dá)譜的影響得到分析,因此有些幸運(yùn)的是,Chen發(fā)現(xiàn)了氯硝柳胺(niclosamide)。不過即便發(fā)現(xiàn)這種藥物與這種疾病相匹配之后,他的團(tuán)隊(duì)也陷入困難境地。這種藥物被用來殺死寄生蟲,但是在這種模式小鼠體內(nèi)不能很好地發(fā)揮效果,這是因?yàn)樗遣豢扇艿摹?/p>
僅在Chen團(tuán)隊(duì)碰巧發(fā)現(xiàn)之前的一項(xiàng)研究描述了氯硝柳胺的一種衍生物NEN之后,他們?nèi)〉昧顺晒?。這種衍生物是氯硝柳胺的乙醇胺鹽,在人細(xì)胞中是可溶的。當(dāng)將NEN與晚期HCC標(biāo)準(zhǔn)治療藥物索拉非尼(sorafenib)組合使用時(shí),他們發(fā)現(xiàn)這種腫瘤停止生長。(www.bioeg.cn)
盡管已發(fā)現(xiàn)NEN安全地被用來抵抗狗和貓?bào)w內(nèi)的絳蟲,但是迄今為止科學(xué)家們并不知道它如何影響人體,或者它是否阻止人體中的癌變肝臟組織生長。
但是,Chen說,它是一種有前景的候選藥物,它的開發(fā)成本可能是一種典型藥物的一半或不到,這是因?yàn)樗捎孟冗M(jìn)的計(jì)算技術(shù)來分析免費(fèi)獲得的數(shù)據(jù)。
Chen說,“鑒于我們的方法是在計(jì)算機(jī)上完成的,我們能夠非??斓卦u(píng)估上百種候選藥物。在發(fā)現(xiàn)這種驅(qū)蟲藥是有效的之前,我們研究了1000多種藥物。這種一種非常有效的方法來發(fā)現(xiàn)藥物?!?/p>
來源:生物谷
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